More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_0135 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0135  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 		 793 aa  1565    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2893  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  86.2 
 
 		 764 aa  1274    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1485  ATP-dependent RNA helicase  98.96 
 
 		 602 aa  921    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16789  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2871  cold-shock dead-box protein A  60.51 
 
 		 673 aa  659    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.975529  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0067  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.6 
 
 		 626 aa  637    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2023  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.09 
 
 		 651 aa  649    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.995582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4366  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.48 
 
 		 687 aa  791    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1826  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.45 
 
 		 659 aa  650    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1574  DEAD/DEAH box helicase-like  59.96 
 
 		 706 aa  624  1e-177  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0850  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.05 
 
 		 730 aa  606  9.999999999999999e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00336665  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0590  DEAD/DEAH box helicase-like  48.91 
 
 		 710 aa  598  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00331406 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0900  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.67 
 
 		 787 aa  594  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00172468  normal  0.0499652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.17 
 
 		 593 aa  556  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.172046 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.74 
 
 		 644 aa  556  1e-157  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113541  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2184  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.45 
 
 		 776 aa  554  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.383881 
 
 
-
 
NC_004310  BR0124  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  55.82 
 
 		 626 aa  549  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.232236  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0120  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  56.01 
 
 		 626 aa  552  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.55 
 
 		 545 aa  544  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1589  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.78 
 
 		 609 aa  542  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0876  DEAD/DEAH box helicase-like  52.7 
 
 		 659 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4525  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.61 
 
 		 691 aa  537  1e-151  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3218  DEAD/DEAH box helicase-like  54.67 
 
 		 691 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4667  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.48 
 
 		 545 aa  529  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.528462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1386  DEAD/DEAH box helicase  53.22 
 
 		 677 aa  530  1e-149  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0179  DEAD/DEAH box helicase  47.4 
 
 		 679 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.970165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4919  putative DEAD-box cold-shock protein, ATP-independent RNA helicase  50.9 
 
 		 656 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.730754  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2584  DEAD/DEAH box helicase-like  54.37 
 
 		 590 aa  519  1e-146  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.780763  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1832  DEAD/DEAH box helicase-like protein  51.94 
 
 		 610 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00214348  normal  0.596692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4914  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.79 
 
 		 568 aa  515  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4450  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.79 
 
 		 568 aa  514  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.181916 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1844  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.22 
 
 		 574 aa  509  1e-143  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360564  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1119  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.18 
 
 		 596 aa  509  1e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.538016 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0260  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.27 
 
 		 577 aa  511  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.19 
 
 		 567 aa  509  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.323707  normal  0.0708927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.84 
 
 		 583 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2913  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.95 
 
 		 585 aa  481  1e-134  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898805  normal  0.138469 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.28 
 
 		 505 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.295607 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3044  DEAD/DEAH box helicase-like  51.07 
 
 		 565 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3142  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.29 
 
 		 565 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.29 
 
 		 565 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.629149  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4213  DEAD/DEAH box helicase-like  62.77 
 
 		 340 aa  333  9e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.985867  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1484  hypothetical protein  99.43 
 
 		 174 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0498271  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.05 
 
 		 558 aa  296  1e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000225477  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.75 
 
 		 664 aa  267  4e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.75 
 
 		 664 aa  267  4e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.34 
 
 		 643 aa  267  7e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.75 
 
 		 664 aa  266  8e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.76 
 
 		 624 aa  266  8.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.62 
 
 		 653 aa  266  1e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.84 
 
 		 571 aa  265  2e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0067613  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0948  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.64 
 
 		 530 aa  266  2e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  35.62 
 
 		 656 aa  264  6e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3340  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.01 
 
 		 621 aa  263  8e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.32 
 
 		 559 aa  263  8.999999999999999e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0145  ATP-dependent RNA helicase  32.48 
 
 		 579 aa  262  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432053  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09651  putative ATP-dependent RNA helicase  33.02 
 
 		 636 aa  261  4e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.49 
 
 		 565 aa  260  8e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  37.04 
 
 		 574 aa  260  8e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1989  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.27 
 
 		 597 aa  259  1e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.805069  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3203  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  35.02 
 
 		 581 aa  259  1e-67  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185856  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0814  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.03 
 
 		 632 aa  259  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0212558  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.18 
 
 		 678 aa  259  2e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  38.36 
 
 		 595 aa  258  2e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.81 
 
 		 514 aa  259  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  33.2 
 
 		 530 aa  258  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.48 
 
 		 538 aa  258  4e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  40.56 
 
 		 590 aa  257  5e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.795312  normal  0.95213 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.31 
 
 		 622 aa  257  6e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3048  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.88 
 
 		 747 aa  257  6e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2752  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.14 
 
 		 694 aa  257  7e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0117058 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.31 
 
 		 619 aa  257  7e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1259  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.26 
 
 		 608 aa  256  8e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.65 
 
 		 646 aa  256  9e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.9 
 
 		 625 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.9 
 
 		 599 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.32 
 
 		 546 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.31 
 
 		 622 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  35.24 
 
 		 529 aa  255  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.36 
 
 		 532 aa  254  3e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.04 
 
 		 466 aa  255  3e-66  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.88 
 
 		 589 aa  254  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  40.51 
 
 		 506 aa  254  5.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.03 
 
 		 590 aa  254  6e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  35 
 
 		 525 aa  254  6e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  35 
 
 		 525 aa  254  6e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.56 
 
 		 467 aa  253  9.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4481  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.01 
 
 		 629 aa  253  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.75 
 
 		 561 aa  253  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.5 
 
 		 487 aa  253  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.32 
 
 		 584 aa  253  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1305  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.18 
 
 		 602 aa  253  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1680  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.77 
 
 		 677 aa  253  1e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139881  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.21 
 
 		 405 aa  253  1e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.04 
 
 		 610 aa  253  1e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0543  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.01 
 
 		 629 aa  252  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.01 
 
 		 629 aa  252  2e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419869 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.57 
 
 		 623 aa  252  2e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3458  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.01 
 
 		 629 aa  252  2e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438364 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3644  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.01 
 
 		 651 aa  252  2e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  35 
 
 		 533 aa  252  2e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>