More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_1574 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_0850  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.04 
 
 
730 aa  714    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00336665  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2023  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.33 
 
 
651 aa  672    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.995582  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2893  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.36 
 
 
764 aa  642    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0067  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.28 
 
 
626 aa  668    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237297  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2871  cold-shock dead-box protein A  54.1 
 
 
673 aa  669    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.975529  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1574  DEAD/DEAH box helicase-like  100 
 
 
706 aa  1415    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226882  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1826  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.1 
 
 
659 aa  670    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0590  DEAD/DEAH box helicase-like  56.64 
 
 
710 aa  712    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331406 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0135  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.95 
 
 
793 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776582  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4366  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.8 
 
 
687 aa  627  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0900  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.09 
 
 
787 aa  590  1e-167  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00172468  normal  0.0499652 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1485  ATP-dependent RNA helicase  63.23 
 
 
602 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16789  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4667  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.38 
 
 
545 aa  566  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.528462  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0120  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  51.57 
 
 
626 aa  554  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0124  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  51.39 
 
 
626 aa  550  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.232236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2184  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.25 
 
 
776 aa  549  1e-155  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.383881 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4525  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.41 
 
 
691 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.39 
 
 
545 aa  546  1e-154  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1589  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.51 
 
 
609 aa  543  1e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0876  DEAD/DEAH box helicase-like  50.91 
 
 
659 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.87 
 
 
644 aa  544  1e-153  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113541  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0179  DEAD/DEAH box helicase  54.11 
 
 
679 aa  542  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.970165  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.76 
 
 
593 aa  538  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.172046 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3218  DEAD/DEAH box helicase-like  52.96 
 
 
691 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1119  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.18 
 
 
596 aa  528  1e-148  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.538016 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4919  putative DEAD-box cold-shock protein, ATP-independent RNA helicase  48.41 
 
 
656 aa  524  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.730754  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1386  DEAD/DEAH box helicase  45.63 
 
 
677 aa  521  1e-146  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1844  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.31 
 
 
574 aa  512  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360564  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4450  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.55 
 
 
568 aa  513  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.181916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4914  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.55 
 
 
568 aa  511  1e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2584  DEAD/DEAH box helicase-like  50.19 
 
 
590 aa  506  9.999999999999999e-143  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.780763  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.92 
 
 
567 aa  501  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.323707  normal  0.0708927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.55 
 
 
583 aa  496  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0260  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50 
 
 
577 aa  490  1e-137  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2913  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.03 
 
 
585 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898805  normal  0.138469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1832  DEAD/DEAH box helicase-like protein  48.08 
 
 
610 aa  482  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00214348  normal  0.596692 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.77 
 
 
505 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.295607 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3142  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.51 
 
 
565 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3044  DEAD/DEAH box helicase-like  50.71 
 
 
565 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.51 
 
 
565 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.629149  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4213  DEAD/DEAH box helicase-like  58.97 
 
 
340 aa  317  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.985867  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.73 
 
 
558 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000225477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.73 
 
 
527 aa  265  2e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.07 
 
 
528 aa  265  3e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.07 
 
 
528 aa  265  3e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3753  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.94 
 
 
908 aa  261  3e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237591  normal  0.30492 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.82 
 
 
565 aa  257  5e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.21 
 
 
622 aa  256  8e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14060  DNA/RNA helicase, superfamily II  34.72 
 
 
669 aa  256  8e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28600  DNA/RNA helicase, superfamily II  34.77 
 
 
570 aa  256  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.219312 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.21 
 
 
622 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.21 
 
 
619 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  34.33 
 
 
561 aa  254  3e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.53 
 
 
527 aa  254  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000471221  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  32.19 
 
 
656 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.91 
 
 
590 aa  254  4.0000000000000004e-66  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.13 
 
 
643 aa  252  1e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1989  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34 
 
 
597 aa  252  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.805069  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2746  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.71 
 
 
678 aa  252  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.633229  normal  0.123801 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  32.05 
 
 
530 aa  251  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2820  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.52 
 
 
556 aa  251  3e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00179058  normal  0.0521879 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.68 
 
 
541 aa  250  8e-65  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.51 
 
 
640 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.51 
 
 
640 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.51 
 
 
640 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.74 
 
 
640 aa  249  1e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.51 
 
 
640 aa  249  1e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  35.83 
 
 
637 aa  249  1e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.27 
 
 
623 aa  248  3e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.27 
 
 
532 aa  247  4.9999999999999997e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.21 
 
 
599 aa  247  6e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.93 
 
 
550 aa  246  6.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.61 
 
 
634 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.16 
 
 
664 aa  246  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.16 
 
 
664 aa  246  8e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.16 
 
 
664 aa  246  8e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1083  DEAD/DEAH box helicase domain protein  30.4 
 
 
536 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.87 
 
 
550 aa  246  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.12 
 
 
610 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.75 
 
 
584 aa  246  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.33 
 
 
530 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  34.17 
 
 
572 aa  246  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.42 
 
 
538 aa  245  1.9999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.240435  decreased coverage  0.00164487 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.25 
 
 
605 aa  244  3e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2815  DEAD/DEAH box helicase  43.03 
 
 
533 aa  245  3e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.386188  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.3 
 
 
532 aa  244  3e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1139  DEAD/DEAH box helicase-like protein  34.58 
 
 
568 aa  244  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.52 
 
 
561 aa  244  3.9999999999999997e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.18 
 
 
527 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.74 
 
 
625 aa  243  7e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.63 
 
 
595 aa  243  7e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  34.1 
 
 
529 aa  243  7e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1305  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.59 
 
 
602 aa  243  7.999999999999999e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.8 
 
 
538 aa  243  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.1 
 
 
623 aa  243  1e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.87 
 
 
559 aa  242  2e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1816  DEAD/DEAH box helicase-like  32.19 
 
 
531 aa  242  2e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0814  ATP-dependent RNA helicase DeaD  37.44 
 
 
632 aa  242  2e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0212558  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1443  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.09 
 
 
560 aa  242  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.31662  normal  0.276111 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.68 
 
 
589 aa  241  2e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>