More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2893 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0135  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  86.08 
 
 
793 aa  1240    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776582  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2871  cold-shock dead-box protein A  60.34 
 
 
673 aa  660    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.975529  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1485  ATP-dependent RNA helicase  95 
 
 
602 aa  894    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16789  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2893  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
764 aa  1518    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2023  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.25 
 
 
651 aa  652    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.995582  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4366  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  65.14 
 
 
687 aa  786    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1826  DEAD/DEAH box helicase domain protein  60.98 
 
 
659 aa  656    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0067  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  59.13 
 
 
626 aa  635  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237297  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1574  DEAD/DEAH box helicase-like  60.3 
 
 
706 aa  627  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226882  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0850  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.07 
 
 
730 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00336665  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0900  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.84 
 
 
787 aa  596  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00172468  normal  0.0499652 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0590  DEAD/DEAH box helicase-like  49.28 
 
 
710 aa  593  1e-168  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331406 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.28 
 
 
644 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113541  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.17 
 
 
593 aa  560  1e-158  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.172046 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0120  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  56.93 
 
 
626 aa  561  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0124  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  56.75 
 
 
626 aa  558  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.232236  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2184  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.62 
 
 
776 aa  557  1e-157  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.383881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.72 
 
 
545 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0876  DEAD/DEAH box helicase-like  51.33 
 
 
659 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1589  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.92 
 
 
609 aa  541  9.999999999999999e-153  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4919  putative DEAD-box cold-shock protein, ATP-independent RNA helicase  49.53 
 
 
656 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.730754  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4525  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.97 
 
 
691 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3218  DEAD/DEAH box helicase-like  47.25 
 
 
691 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4667  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.58 
 
 
545 aa  530  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.528462  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0179  DEAD/DEAH box helicase  52.44 
 
 
679 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.970165  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1386  DEAD/DEAH box helicase  52.88 
 
 
677 aa  524  1e-147  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2584  DEAD/DEAH box helicase-like  54.09 
 
 
590 aa  523  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.780763  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1832  DEAD/DEAH box helicase-like protein  53.58 
 
 
610 aa  523  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00214348  normal  0.596692 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4914  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.46 
 
 
568 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4450  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.46 
 
 
568 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.181916 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1844  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.43 
 
 
574 aa  513  1e-144  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360564  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0260  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.27 
 
 
577 aa  514  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.04 
 
 
567 aa  512  1e-143  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.323707  normal  0.0708927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.44 
 
 
583 aa  511  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1119  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.72 
 
 
596 aa  507  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.538016 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2913  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.35 
 
 
585 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898805  normal  0.138469 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.79 
 
 
505 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.295607 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3044  DEAD/DEAH box helicase-like  51.07 
 
 
565 aa  449  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.1 
 
 
565 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.629149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3142  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.1 
 
 
565 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4213  DEAD/DEAH box helicase-like  61.68 
 
 
340 aa  331  3e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.985867  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.91 
 
 
558 aa  294  4e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000225477  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.76 
 
 
664 aa  266  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.63 
 
 
643 aa  266  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.76 
 
 
664 aa  265  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.76 
 
 
664 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.45 
 
 
565 aa  265  3e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.58 
 
 
624 aa  264  4.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.9 
 
 
653 aa  263  6.999999999999999e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  34.59 
 
 
656 aa  263  8.999999999999999e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.12 
 
 
571 aa  261  3e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0067613  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.7 
 
 
559 aa  261  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3340  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.08 
 
 
621 aa  261  5.0000000000000005e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  31.76 
 
 
530 aa  260  8e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09651  putative ATP-dependent RNA helicase  32.84 
 
 
636 aa  259  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.78 
 
 
561 aa  258  2e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.63 
 
 
538 aa  258  2e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0814  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.41 
 
 
632 aa  258  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0212558  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0948  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.69 
 
 
530 aa  257  6e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.82 
 
 
466 aa  256  8e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1259  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.26 
 
 
608 aa  256  1.0000000000000001e-66  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1989  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.06 
 
 
597 aa  256  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.805069  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.99 
 
 
619 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.97 
 
 
590 aa  256  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.46 
 
 
514 aa  256  1.0000000000000001e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2752  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.75 
 
 
694 aa  255  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0117058 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  38.27 
 
 
595 aa  255  2.0000000000000002e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.21 
 
 
622 aa  255  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1305  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.3 
 
 
602 aa  255  3e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.11 
 
 
467 aa  254  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.71 
 
 
625 aa  254  3e-66  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  34.76 
 
 
529 aa  254  3e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0522  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.35 
 
 
562 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.17 
 
 
525 aa  254  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4245  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  43.14 
 
 
477 aa  254  5.000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.694527 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  34.17 
 
 
525 aa  254  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.2 
 
 
646 aa  254  5.000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.21 
 
 
622 aa  254  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.53 
 
 
546 aa  254  6e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  40.23 
 
 
590 aa  253  7e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.795312  normal  0.95213 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  40.29 
 
 
506 aa  253  7e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.37 
 
 
599 aa  253  7e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3203  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  33.85 
 
 
581 aa  253  7e-66  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185856  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5248  ATP-dependent RNA helicase DbpA  40.71 
 
 
478 aa  253  8.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.748721 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  36.05 
 
 
574 aa  253  9.000000000000001e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3706  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.98 
 
 
594 aa  253  9.000000000000001e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.41 
 
 
532 aa  253  9.000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.81 
 
 
511 aa  253  1e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.52 
 
 
528 aa  253  1e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  34.52 
 
 
528 aa  253  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04825  ATP-dependent RNA helicase  37.03 
 
 
614 aa  253  1e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  36.24 
 
 
561 aa  253  1e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.52 
 
 
528 aa  253  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  34.52 
 
 
533 aa  253  1e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  34.52 
 
 
528 aa  253  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.95 
 
 
487 aa  252  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  34.52 
 
 
528 aa  252  2e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4481  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.96 
 
 
629 aa  252  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3048  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.28 
 
 
747 aa  252  2e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.88 
 
 
589 aa  251  2e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>