More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_3396 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4667  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  74.82 
 
 
545 aa  783    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.528462  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  75.89 
 
 
545 aa  785    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1386  DEAD/DEAH box helicase  63.58 
 
 
677 aa  637    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0179  DEAD/DEAH box helicase  62.39 
 
 
679 aa  643    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.970165  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  70.93 
 
 
567 aa  730    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.323707  normal  0.0708927 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0876  DEAD/DEAH box helicase-like  61.89 
 
 
659 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
583 aa  1148    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3218  DEAD/DEAH box helicase-like  58.91 
 
 
691 aa  646    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4525  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.59 
 
 
691 aa  635    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4914  DEAD/DEAH box helicase domain protein  70.02 
 
 
568 aa  757    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4450  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  70.19 
 
 
568 aa  759    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.181916 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1589  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.37 
 
 
609 aa  662    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4919  putative DEAD-box cold-shock protein, ATP-independent RNA helicase  60.68 
 
 
656 aa  620  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.730754  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0260  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.31 
 
 
577 aa  607  9.999999999999999e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2584  DEAD/DEAH box helicase-like  60.38 
 
 
590 aa  592  1e-168  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.780763  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2184  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.25 
 
 
776 aa  584  1.0000000000000001e-165  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.383881 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.91 
 
 
593 aa  580  1e-164  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.172046 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1119  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.91 
 
 
596 aa  580  1e-164  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.538016 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1832  DEAD/DEAH box helicase-like protein  58.5 
 
 
610 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00214348  normal  0.596692 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1844  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.46 
 
 
574 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360564  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  68.56 
 
 
505 aa  561  1e-158  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.295607 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0067  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.49 
 
 
626 aa  557  1e-157  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237297  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1826  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.39 
 
 
659 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2871  cold-shock dead-box protein A  53.26 
 
 
673 aa  551  1e-155  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.975529  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2023  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.59 
 
 
651 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.995582  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0900  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.96 
 
 
787 aa  542  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00172468  normal  0.0499652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.42 
 
 
644 aa  528  1e-149  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113541  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0850  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.05 
 
 
730 aa  529  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00336665  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2913  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.36 
 
 
585 aa  526  1e-148  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898805  normal  0.138469 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0120  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  48.75 
 
 
626 aa  528  1e-148  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0124  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  48.58 
 
 
626 aa  525  1e-147  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.232236  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4366  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.75 
 
 
687 aa  521  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2893  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.74 
 
 
764 aa  510  1e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0590  DEAD/DEAH box helicase-like  54.62 
 
 
710 aa  508  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331406 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0135  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.22 
 
 
793 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776582  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1574  DEAD/DEAH box helicase-like  52.26 
 
 
706 aa  497  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226882  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1485  ATP-dependent RNA helicase  55.86 
 
 
602 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.74 
 
 
565 aa  467  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.629149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3142  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.74 
 
 
565 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3044  DEAD/DEAH box helicase-like  52.58 
 
 
565 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4213  DEAD/DEAH box helicase-like  65.96 
 
 
340 aa  365  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.985867  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.93 
 
 
558 aa  272  1e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000225477  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.24 
 
 
664 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.24 
 
 
664 aa  270  4e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.24 
 
 
664 aa  270  4e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.06 
 
 
653 aa  269  8e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.56 
 
 
643 aa  266  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.93 
 
 
629 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.93 
 
 
629 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3340  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.22 
 
 
621 aa  264  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3573  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.93 
 
 
629 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.93 
 
 
629 aa  264  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3635  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.93 
 
 
629 aa  263  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0814  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.01 
 
 
632 aa  263  8e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0212558  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.46 
 
 
527 aa  263  8.999999999999999e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09651  putative ATP-dependent RNA helicase  35.28 
 
 
636 aa  262  2e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.69 
 
 
624 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.65 
 
 
565 aa  261  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.68 
 
 
625 aa  261  3e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03029  ATP-dependent RNA helicase  32.68 
 
 
629 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0543  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.68 
 
 
629 aa  260  4e-68  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02980  hypothetical protein  32.68 
 
 
629 aa  260  4e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.68 
 
 
629 aa  260  4e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4481  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.68 
 
 
629 aa  260  4e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3458  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.68 
 
 
629 aa  260  4e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.438364 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3609  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.68 
 
 
651 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3644  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.68 
 
 
651 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3354  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.68 
 
 
651 aa  260  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  32.14 
 
 
589 aa  258  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.89 
 
 
546 aa  258  3e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3599  ATP-dependent RNA helicase DeaD  40.11 
 
 
655 aa  257  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00604869 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1927  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.85 
 
 
594 aa  256  6e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.118281  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1680  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.25 
 
 
677 aa  256  7e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.139881  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0626  inducible ATP-independent RNA helicase  32.09 
 
 
591 aa  256  7e-67  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.79 
 
 
532 aa  256  9e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.96 
 
 
550 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.52 
 
 
546 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14060  DNA/RNA helicase, superfamily II  34.72 
 
 
669 aa  256  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.14 
 
 
590 aa  254  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.16 
 
 
533 aa  253  6e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2564  DEAD/DEAH box helicase-like protein  45.98 
 
 
634 aa  253  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347829  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0704  ATP-dependent RNA helicase  31.28 
 
 
601 aa  252  1e-65  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.92 
 
 
532 aa  252  2e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.4 
 
 
529 aa  251  3e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.82 
 
 
541 aa  250  6e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0894  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.04 
 
 
627 aa  249  7e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.923334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0823  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.04 
 
 
627 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.31 
 
 
538 aa  249  1e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0952  putative ATP-dependent RNA helicase protein  44.41 
 
 
608 aa  248  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.850051  normal  0.62904 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1259  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.68 
 
 
608 aa  248  3e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.62 
 
 
595 aa  248  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1989  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.13 
 
 
597 aa  247  3e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.805069  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2402  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.28 
 
 
634 aa  247  4e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.208521  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2820  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.1 
 
 
556 aa  247  4.9999999999999997e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00179058  normal  0.0521879 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.33 
 
 
528 aa  246  6e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000109109  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  33.33 
 
 
528 aa  246  6e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000667125  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.1 
 
 
581 aa  246  8e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0434047 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1139  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.86 
 
 
568 aa  245  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.69 
 
 
584 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35 
 
 
514 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>