More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2184 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2184  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  100 
 
 
776 aa  1541    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.383881 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1386  DEAD/DEAH box helicase  62.5 
 
 
677 aa  657    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4525  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.82 
 
 
691 aa  643    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3218  DEAD/DEAH box helicase-like  53.2 
 
 
691 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1844  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  62.03 
 
 
574 aa  627  1e-178  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360564  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1119  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.61 
 
 
596 aa  627  1e-178  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.538016 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1589  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.59 
 
 
609 aa  624  1e-177  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4919  putative DEAD-box cold-shock protein, ATP-independent RNA helicase  57.72 
 
 
656 aa  621  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.730754  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0179  DEAD/DEAH box helicase  54.52 
 
 
679 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.970165  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4667  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  60.18 
 
 
545 aa  611  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.528462  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0876  DEAD/DEAH box helicase-like  57.38 
 
 
659 aa  611  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0900  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.82 
 
 
787 aa  598  1e-169  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00172468  normal  0.0499652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.12 
 
 
545 aa  592  1e-168  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1832  DEAD/DEAH box helicase-like protein  56.66 
 
 
610 aa  587  1e-166  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00214348  normal  0.596692 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2871  cold-shock dead-box protein A  50 
 
 
673 aa  585  1e-166  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.975529  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.45 
 
 
593 aa  584  1.0000000000000001e-165  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.172046 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2023  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50 
 
 
651 aa  581  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.995582  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1826  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.53 
 
 
659 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.25 
 
 
583 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0260  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.54 
 
 
577 aa  572  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.03 
 
 
644 aa  572  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113541  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0067  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.16 
 
 
626 aa  571  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237297  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0120  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  54.63 
 
 
626 aa  566  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4914  DEAD/DEAH box helicase domain protein  57.46 
 
 
568 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_004310  BR0124  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  54.44 
 
 
626 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.232236  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4450  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.65 
 
 
568 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.181916 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2893  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.64 
 
 
764 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.4 
 
 
567 aa  551  1e-155  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.323707  normal  0.0708927 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2584  DEAD/DEAH box helicase-like  52.68 
 
 
590 aa  550  1e-155  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.780763  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0135  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.78 
 
 
793 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776582  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0850  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.2 
 
 
730 aa  531  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00336665  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1574  DEAD/DEAH box helicase-like  52.05 
 
 
706 aa  525  1e-147  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226882  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0590  DEAD/DEAH box helicase-like  45.09 
 
 
710 aa  525  1e-147  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331406 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2913  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.03 
 
 
585 aa  523  1e-147  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898805  normal  0.138469 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  65.78 
 
 
505 aa  519  1e-146  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.295607 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4366  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  47.86 
 
 
687 aa  517  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1485  ATP-dependent RNA helicase  53.54 
 
 
602 aa  492  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16789  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.73 
 
 
565 aa  489  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.629149  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3044  DEAD/DEAH box helicase-like  54.25 
 
 
565 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3142  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.73 
 
 
565 aa  488  1e-136  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4213  DEAD/DEAH box helicase-like  65.96 
 
 
340 aa  366  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.985867  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.49 
 
 
643 aa  275  3e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.23 
 
 
558 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000225477  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.69 
 
 
664 aa  256  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.69 
 
 
664 aa  256  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.69 
 
 
664 aa  256  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.39 
 
 
590 aa  249  1e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.77 
 
 
599 aa  249  2e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.39 
 
 
640 aa  248  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.72 
 
 
634 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  33.28 
 
 
589 aa  247  6e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0637  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.82 
 
 
640 aa  246  9.999999999999999e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.73 
 
 
584 aa  246  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0552  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.21 
 
 
640 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0583  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.21 
 
 
640 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3757  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.21 
 
 
640 aa  246  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.96 
 
 
532 aa  244  6e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2996  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.97 
 
 
618 aa  244  6e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09651  putative ATP-dependent RNA helicase  34.26 
 
 
636 aa  243  7.999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.81 
 
 
624 aa  243  1e-62  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.89 
 
 
610 aa  243  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.66 
 
 
611 aa  242  2e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3340  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.87 
 
 
621 aa  241  5e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.59 
 
 
622 aa  241  5e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.69 
 
 
605 aa  240  5.999999999999999e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0566  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  41.21 
 
 
623 aa  240  6.999999999999999e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.59 
 
 
622 aa  240  9e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.08 
 
 
623 aa  239  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.59 
 
 
619 aa  239  1e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.39 
 
 
637 aa  239  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.7 
 
 
527 aa  239  2e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.13 
 
 
653 aa  238  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.9 
 
 
595 aa  238  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.23 
 
 
527 aa  238  5.0000000000000005e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0030  ATP-dependent RNA helicase DbpA  40.57 
 
 
467 aa  236  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3577  ATP-dependent RNA helicase DbpA  43.53 
 
 
473 aa  237  8e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0650  ATP-dependent RNA helicase DbpA  42.94 
 
 
468 aa  237  8e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3020  ATP-dependent RNA helicase DbpA  42.45 
 
 
465 aa  236  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.93907  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04825  ATP-dependent RNA helicase  32.73 
 
 
614 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.13 
 
 
625 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0220  ATP-dependent RNA helicase  31.42 
 
 
609 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.986223  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4436  ATP-dependent RNA helicase DbpA  43.58 
 
 
467 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0603  DEAD/DEAH box helicase-like protein  40.58 
 
 
591 aa  235  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.365924 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0439  cold-shock DEAD box protein A (ATP-independent RNA helicase)  34.66 
 
 
641 aa  236  2.0000000000000002e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.251569  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5212  ATP-dependent RNA helicase DbpA  42.6 
 
 
476 aa  235  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0191  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.26 
 
 
609 aa  235  3e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1648  DEAD/DEAH box helicase-like  41.74 
 
 
607 aa  235  3e-60  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14060  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.39 
 
 
669 aa  235  3e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.96 
 
 
550 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2250  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.1 
 
 
574 aa  234  4.0000000000000004e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.460178  normal  0.714612 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0814  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.12 
 
 
632 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0212558  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1083  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.74 
 
 
536 aa  234  5e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0647  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.7 
 
 
589 aa  234  6e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.176165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32 
 
 
532 aa  234  6e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14791  putative ATP-dependent RNA helicase  33.7 
 
 
589 aa  233  7.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.459404  normal  0.230286 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.19 
 
 
589 aa  233  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001711  ATP-dependent RNA helicase DbpA  41.06 
 
 
459 aa  233  1e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177181  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.4 
 
 
487 aa  233  1e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.554014  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.02 
 
 
646 aa  233  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3048  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.08 
 
 
747 aa  233  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>