More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR0124 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0124  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  100 
 
 
626 aa  1275    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.232236  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0120  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  99.84 
 
 
626 aa  1273    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  91.16 
 
 
644 aa  1088    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113541  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1826  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.52 
 
 
659 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2023  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.25 
 
 
651 aa  620  1e-176  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.995582  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0900  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.33 
 
 
787 aa  615  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00172468  normal  0.0499652 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0067  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.87 
 
 
626 aa  594  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237297  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2871  cold-shock dead-box protein A  53.11 
 
 
673 aa  593  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.975529  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2184  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.53 
 
 
776 aa  579  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.383881 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0590  DEAD/DEAH box helicase-like  55.66 
 
 
710 aa  567  1e-160  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331406 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4366  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.31 
 
 
687 aa  561  1e-158  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1589  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.16 
 
 
609 aa  557  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2893  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.63 
 
 
764 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1119  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.34 
 
 
596 aa  554  1e-156  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.538016 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0179  DEAD/DEAH box helicase  48.24 
 
 
679 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.970165  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.07 
 
 
593 aa  553  1e-156  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.172046 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1386  DEAD/DEAH box helicase  54.73 
 
 
677 aa  550  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0876  DEAD/DEAH box helicase-like  49.35 
 
 
659 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0850  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.76 
 
 
730 aa  545  1e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00336665  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0135  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.17 
 
 
793 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776582  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1574  DEAD/DEAH box helicase-like  53.67 
 
 
706 aa  540  9.999999999999999e-153  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226882  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4919  putative DEAD-box cold-shock protein, ATP-independent RNA helicase  50.24 
 
 
656 aa  541  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.730754  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1844  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.7 
 
 
574 aa  538  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360564  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3218  DEAD/DEAH box helicase-like  52.16 
 
 
691 aa  534  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1832  DEAD/DEAH box helicase-like protein  53.7 
 
 
610 aa  531  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00214348  normal  0.596692 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4525  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.73 
 
 
691 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  51.62 
 
 
545 aa  522  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4667  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.29 
 
 
545 aa  520  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.528462  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  49.33 
 
 
583 aa  520  1e-146  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2584  DEAD/DEAH box helicase-like  51.39 
 
 
590 aa  518  1.0000000000000001e-145  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.780763  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1485  ATP-dependent RNA helicase  57 
 
 
602 aa  515  1e-144  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16789  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4914  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.76 
 
 
568 aa  513  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4450  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.76 
 
 
568 aa  512  1e-143  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.181916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0260  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.03 
 
 
577 aa  500  1e-140  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.8 
 
 
567 aa  499  1e-140  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.323707  normal  0.0708927 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2913  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  51.5 
 
 
585 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898805  normal  0.138469 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  59.58 
 
 
505 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.295607 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3142  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.94 
 
 
565 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3044  DEAD/DEAH box helicase-like  49.04 
 
 
565 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.94 
 
 
565 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.629149  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4213  DEAD/DEAH box helicase-like  56.18 
 
 
340 aa  306  9.000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.985867  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.46 
 
 
558 aa  290  6e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000225477  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  32.67 
 
 
589 aa  276  6e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.11 
 
 
646 aa  272  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.6 
 
 
643 aa  270  5e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.5 
 
 
541 aa  266  7e-70  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32 
 
 
546 aa  266  8e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1259  DEAD/DEAH box helicase domain protein  31.75 
 
 
608 aa  266  8e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3340  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.07 
 
 
621 aa  266  8.999999999999999e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.45 
 
 
590 aa  266  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  34.57 
 
 
561 aa  265  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0704  ATP-dependent RNA helicase  31.33 
 
 
601 aa  264  3e-69  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.15 
 
 
561 aa  264  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.64 
 
 
624 aa  263  8.999999999999999e-69  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.57 
 
 
546 aa  263  8.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.15 
 
 
664 aa  263  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.15 
 
 
664 aa  261  2e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.15 
 
 
664 aa  261  2e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.31 
 
 
532 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.39 
 
 
584 aa  259  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0814  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.97 
 
 
632 aa  258  3e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0212558  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0591  ATP-dependent RNA helicase DeaD  32.6 
 
 
625 aa  256  7e-67  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3981  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.51 
 
 
557 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124844  normal  0.0163927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3967  DEAD/DEAH box helicase-like protein  32.51 
 
 
557 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28600  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.8 
 
 
570 aa  256  1.0000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.219312 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4041  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.51 
 
 
557 aa  256  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.07 
 
 
629 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3573  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.07 
 
 
629 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3467  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.07 
 
 
629 aa  255  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.25 
 
 
629 aa  254  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3635  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.07 
 
 
629 aa  253  6e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  31.3 
 
 
653 aa  253  7e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1726  RNA helicase DeaD  35.87 
 
 
611 aa  253  9.000000000000001e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226291  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0649  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.71 
 
 
532 aa  253  9.000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2820  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.2 
 
 
556 aa  252  1e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00179058  normal  0.0521879 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14060  DNA/RNA helicase, superfamily II  32 
 
 
669 aa  252  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1118  helicase, C-terminal:DbpA, RNA-binding:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  33.15 
 
 
606 aa  252  2e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.892999  normal  0.51461 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  31.33 
 
 
527 aa  251  3e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3599  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.75 
 
 
655 aa  250  5e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00604869 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.6 
 
 
527 aa  250  5e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.22 
 
 
590 aa  250  5e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  31.4 
 
 
637 aa  250  5e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09651  putative ATP-dependent RNA helicase  32.39 
 
 
636 aa  249  8e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1477  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.64 
 
 
559 aa  249  9e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682084  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.84 
 
 
533 aa  249  9e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.64 
 
 
595 aa  248  2e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5212  ATP-dependent RNA helicase DbpA  40.95 
 
 
476 aa  248  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.8 
 
 
634 aa  249  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0577  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  29.92 
 
 
640 aa  248  2e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0430169 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4481  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.39 
 
 
629 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03029  ATP-dependent RNA helicase  33.58 
 
 
629 aa  248  3e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0543  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.58 
 
 
629 aa  248  3e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  32.65 
 
 
541 aa  248  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000440496  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02980  hypothetical protein  33.58 
 
 
629 aa  248  3e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0536  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.58 
 
 
629 aa  248  3e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419869 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3458  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.58 
 
 
629 aa  248  3e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.438364 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  32.77 
 
 
572 aa  247  4e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  30.02 
 
 
611 aa  247  4e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.4 
 
 
589 aa  247  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3354  ATP-dependent RNA helicase DeaD  33.39 
 
 
651 aa  247  6e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>