More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1485 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_0135  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  98.96 
 
 
793 aa  919    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.776582  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1485  ATP-dependent RNA helicase  100 
 
 
602 aa  1174    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.16789  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2893  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  95 
 
 
764 aa  892    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4366  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  76.67 
 
 
687 aa  698    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1826  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.78 
 
 
659 aa  600  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2871  cold-shock dead-box protein A  63.71 
 
 
673 aa  599  1e-170  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.975529  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0067  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  64.01 
 
 
626 aa  598  1e-169  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237297  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2023  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.17 
 
 
651 aa  594  1e-168  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.995582  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1574  DEAD/DEAH box helicase-like  63 
 
 
706 aa  577  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.226882  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0850  DEAD/DEAH box helicase domain protein  61.44 
 
 
730 aa  553  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00336665  normal  0.272992 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0590  DEAD/DEAH box helicase-like  62.26 
 
 
710 aa  553  1e-156  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00331406 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0900  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.92 
 
 
787 aa  552  1e-156  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00172468  normal  0.0499652 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0138  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.17 
 
 
644 aa  528  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113541  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0120  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  56.84 
 
 
626 aa  523  1e-147  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.352683  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0124  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  56.64 
 
 
626 aa  520  1e-146  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.232236  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3798  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  57.73 
 
 
593 aa  517  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.172046 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2928  DEAD/DEAH box helicase domain protein  58.97 
 
 
545 aa  513  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1589  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50.89 
 
 
609 aa  511  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3218  DEAD/DEAH box helicase-like  54.81 
 
 
691 aa  509  1e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0179  DEAD/DEAH box helicase  54.13 
 
 
679 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.970165  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4919  putative DEAD-box cold-shock protein, ATP-independent RNA helicase  56.2 
 
 
656 aa  505  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.730754  normal  0.525378 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0876  DEAD/DEAH box helicase-like  50.59 
 
 
659 aa  503  1e-141  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2184  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.78 
 
 
776 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.383881 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4914  DEAD/DEAH box helicase domain protein  55.85 
 
 
568 aa  501  1e-140  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4450  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.85 
 
 
568 aa  500  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.181916 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4667  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.76 
 
 
545 aa  498  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.528462  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4525  DEAD/DEAH box helicase domain protein  54.64 
 
 
691 aa  498  1e-139  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4964  DEAD/DEAH box helicase domain protein  56.05 
 
 
567 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.323707  normal  0.0708927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1386  DEAD/DEAH box helicase  54.02 
 
 
677 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2584  DEAD/DEAH box helicase-like  55.6 
 
 
590 aa  488  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.780763  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3396  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.42 
 
 
583 aa  484  1e-135  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.112042 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0260  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  54.73 
 
 
577 aa  484  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1832  DEAD/DEAH box helicase-like protein  54.71 
 
 
610 aa  481  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00214348  normal  0.596692 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1844  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.18 
 
 
574 aa  478  1e-133  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360564  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1119  DEAD/DEAH box helicase domain protein  53.25 
 
 
596 aa  470  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.538016 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0223  DEAD/DEAH box helicase domain protein  62.28 
 
 
505 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.295607 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2913  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  53.24 
 
 
585 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.898805  normal  0.138469 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3044  DEAD/DEAH box helicase-like  51.63 
 
 
565 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3142  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.82 
 
 
565 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3243  DEAD/DEAH box helicase domain protein  50.82 
 
 
565 aa  418  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.629149  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4213  DEAD/DEAH box helicase-like  62.77 
 
 
340 aa  332  2e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.985867  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0508  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.25 
 
 
558 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000225477  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  33.73 
 
 
643 aa  275  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  35.62 
 
 
656 aa  264  4e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0145  ATP-dependent RNA helicase  35.8 
 
 
579 aa  261  2e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432053  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3203  ATP-dependent RNA helicase, DEAD box family protein  35.02 
 
 
581 aa  261  4e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185856  normal  0.0248784 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.09 
 
 
538 aa  260  6e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.9 
 
 
514 aa  259  8e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  37.04 
 
 
574 aa  259  1e-67  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0948  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  32.46 
 
 
530 aa  257  3e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.02 
 
 
466 aa  258  3e-67  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  38.81 
 
 
595 aa  258  3e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000047314  decreased coverage  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  35.58 
 
 
530 aa  258  3e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  37.78 
 
 
664 aa  257  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  37.78 
 
 
664 aa  257  4e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1259  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.26 
 
 
608 aa  257  5e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0528  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.17 
 
 
622 aa  257  5e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3595  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.17 
 
 
619 aa  257  5e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09651  putative ATP-dependent RNA helicase  36.19 
 
 
636 aa  256  6e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.84 
 
 
599 aa  256  7e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  37.78 
 
 
664 aa  256  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.48 
 
 
653 aa  256  8e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  34.86 
 
 
529 aa  256  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.5 
 
 
646 aa  256  9e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3424  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.17 
 
 
622 aa  256  9e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.56 
 
 
467 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.59 
 
 
590 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.63 
 
 
525 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.98 
 
 
565 aa  256  1.0000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  34.63 
 
 
525 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.88 
 
 
589 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  40.51 
 
 
590 aa  255  2.0000000000000002e-66  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.795312  normal  0.95213 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.44 
 
 
511 aa  254  3e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.63 
 
 
528 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  34.63 
 
 
528 aa  254  3e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3459  ATP-dependent RNA helicase DeaD  34.12 
 
 
624 aa  254  3e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.319039  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  34.63 
 
 
528 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  34.63 
 
 
528 aa  254  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.75 
 
 
561 aa  254  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  34.63 
 
 
533 aa  254  3e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  34.63 
 
 
528 aa  254  4.0000000000000004e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3028  DEAD/DEAH box helicase-like  40.28 
 
 
506 aa  254  4.0000000000000004e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.287974  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.87 
 
 
571 aa  253  5.000000000000001e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0067613  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.32 
 
 
584 aa  253  5.000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.04 
 
 
610 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.66 
 
 
546 aa  253  6e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.97 
 
 
529 aa  253  6e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1648  DEAD/DEAH box helicase-like  40.86 
 
 
607 aa  253  7e-66  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1305  DEAD/DEAH box helicase domain protein  41.18 
 
 
602 aa  253  7e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0981  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.42 
 
 
405 aa  253  7e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00015169  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3202  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.5 
 
 
487 aa  252  1e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.409913 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1989  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.47 
 
 
597 aa  252  1e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.805069  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.96 
 
 
623 aa  252  1e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0666  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.38 
 
 
625 aa  252  1e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.477317  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3706  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.86 
 
 
594 aa  251  2e-65  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.5682  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2106  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.47 
 
 
579 aa  252  2e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.119399  normal  0.0955445 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  33.87 
 
 
527 aa  252  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.9 
 
 
538 aa  251  2e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.240435  decreased coverage  0.00164487 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0265  superfamily II DNA/RNA helicase  34.89 
 
 
485 aa  251  2e-65  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.45 
 
 
607 aa  251  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.017054  normal  0.720031 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>