More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2201 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00746  excinuclease ABC subunit B  71.47 
 
 
673 aa  950    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000144798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2863  excinuclease ABC, B subunit  71.47 
 
 
673 aa  950    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294362  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0441  excinuclease ABC subunit B  58.17 
 
 
668 aa  765    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3262  excinuclease ABC subunit B  59.49 
 
 
664 aa  790    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1974  excinuclease ABC subunit B  73.68 
 
 
671 aa  1002    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.238105  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_002950  PG0380  excinuclease ABC subunit B  56.52 
 
 
678 aa  746    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0426  excinuclease ABC subunit B  57.6 
 
 
661 aa  779    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2201  excinuclease ABC subunit B  100 
 
 
664 aa  1334    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0839  excinuclease ABC subunit B  55.15 
 
 
635 aa  739    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1011  excinuclease ABC subunit B  65.91 
 
 
696 aa  887    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.771852  normal  0.613992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5272  excinuclease ABC subunit B  57.94 
 
 
658 aa  758    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2887  excinuclease ABC subunit B  68.37 
 
 
673 aa  932    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.149884  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1464  excinuclease ABC subunit B  55.71 
 
 
663 aa  766    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1512  excinuclease ABC subunit B  62.24 
 
 
940 aa  822    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2506  excinuclease ABC subunit B  70.27 
 
 
673 aa  951    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2164  excinuclease ABC, B subunit  73.03 
 
 
671 aa  995    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5016  excinuclease ABC subunit B  58.09 
 
 
658 aa  761    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4845  excinuclease ABC subunit B  58.09 
 
 
658 aa  762    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4860  excinuclease ABC subunit B  57.94 
 
 
658 aa  760    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0880  excinuclease ABC subunit B  65.86 
 
 
696 aa  883    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0086  excinuclease ABC subunit B  70.86 
 
 
663 aa  967    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0074  excinuclease ABC subunit B  70.86 
 
 
663 aa  969    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1974  excinuclease ABC subunit B  73.03 
 
 
671 aa  996    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.292507 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0744  excinuclease ABC subunit B  62.69 
 
 
703 aa  865    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2003  excinuclease ABC subunit B  66.06 
 
 
690 aa  896    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138887  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1247  excinuclease ABC subunit B  57.55 
 
 
678 aa  774    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1051  excinuclease ABC subunit B  66.62 
 
 
695 aa  901    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1568  excinuclease ABC subunit B  67.53 
 
 
675 aa  919    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2495  excinuclease ABC subunit B  61.25 
 
 
1032 aa  823    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.75553 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4680  excinuclease ABC subunit B  56.56 
 
 
665 aa  756    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1920  excinuclease ABC subunit B  65.86 
 
 
707 aa  882    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1139  excinuclease ABC subunit B  74.77 
 
 
687 aa  999    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0652505  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1875  excinuclease ABC subunit B  72.89 
 
 
671 aa  993    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2083  excinuclease ABC subunit B  58.9 
 
 
727 aa  786    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0099  excinuclease ABC subunit B  62.18 
 
 
667 aa  837    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5538  excinuclease ABC subunit B  65.1 
 
 
707 aa  875    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0077  excinuclease ABC subunit B  55.52 
 
 
679 aa  754    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.5939  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0080  excinuclease ABC subunit B  56.7 
 
 
702 aa  763    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.935466  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3219  excinuclease ABC subunit B  60.88 
 
 
665 aa  800    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0533109  hitchhiker  0.000839421 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2096  excinuclease ABC subunit B  57.95 
 
 
682 aa  761    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.587064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1754  excinuclease ABC subunit B  70.14 
 
 
678 aa  956    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5396  excinuclease ABC subunit B  58.09 
 
 
658 aa  761    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1741  excinuclease ABC subunit B  55.75 
 
 
679 aa  762    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0563  excinuclease ABC subunit B  58.12 
 
 
666 aa  759    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.733421  normal  0.043063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1361  excinuclease ABC subunit B  64.56 
 
 
695 aa  902    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1133  excinuclease ABC subunit B  59.19 
 
 
733 aa  784    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0668171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0251  excinuclease ABC subunit B  63 
 
 
663 aa  819    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2036  excinuclease ABC subunit B  65.86 
 
 
696 aa  882    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1275  excinuclease ABC subunit B  58.95 
 
 
699 aa  795    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.668  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1626  excinuclease ABC subunit B  56.01 
 
 
714 aa  743    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4146  excinuclease ABC subunit B  60.75 
 
 
1017 aa  818    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.919849  normal  0.885523 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2780  excinuclease ABC subunit B  59.3 
 
 
747 aa  781    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.768947  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3602  excinuclease ABC subunit B  58.85 
 
 
731 aa  790    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.510357  normal  0.935221 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2175  excinuclease ABC subunit B  66.31 
 
 
710 aa  893    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00395254  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1753  excinuclease ABC subunit B  70.76 
 
 
666 aa  975    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4137  excinuclease ABC subunit B  59.97 
 
 
1053 aa  808    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1320  excinuclease ABC subunit B  63.66 
 
 
679 aa  879    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.350926  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2176  excinuclease ABC subunit B  65.71 
 
 
706 aa  887    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00882926  normal  0.14877 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3153  excinuclease ABC subunit B  65.36 
 
 
701 aa  879    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.414181 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1797  excinuclease ABC subunit B  69.35 
 
 
676 aa  933    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000373442  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2303  excinuclease ABC subunit B  57.1 
 
 
660 aa  744    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3987  excinuclease ABC subunit B  60.9 
 
 
1047 aa  816    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.584236  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1833  excinuclease ABC subunit B  71.95 
 
 
676 aa  989    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2923  excinuclease ABC subunit B  60.75 
 
 
1011 aa  817    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.50321  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0737  excinuclease ABC subunit B  62.31 
 
 
662 aa  863    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1019  excinuclease ABC subunit B  65.71 
 
 
697 aa  890    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231406  normal  0.390908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1782  excinuclease ABC subunit B  58.55 
 
 
662 aa  777    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.753339  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0144  excinuclease ABC subunit B  59.15 
 
 
730 aa  798    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00842263  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0275  excinuclease ABC subunit B  59.61 
 
 
728 aa  786    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5867  excinuclease ABC subunit B  65.4 
 
 
707 aa  879    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3001  excinuclease ABC subunit B  57.29 
 
 
719 aa  754    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2963  excinuclease ABC subunit B  69.35 
 
 
669 aa  947    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000919416  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2132  excinuclease ABC subunit B  61.71 
 
 
928 aa  809    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0300  excinuclease ABC subunit B  56.76 
 
 
659 aa  775    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0295  excinuclease ABC subunit B  56.89 
 
 
659 aa  775    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.837943  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1617  excinuclease ABC subunit B  69.73 
 
 
677 aa  956    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2678  excinuclease ABC subunit B  56.21 
 
 
677 aa  753    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.292307 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2061  excinuclease ABC subunit B  70.27 
 
 
673 aa  959    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000836148  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1914  excinuclease ABC subunit B  70.42 
 
 
673 aa  961    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00112158  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1088  excinuclease ABC subunit B  73.19 
 
 
675 aa  983    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2170  excinuclease ABC subunit B  67.98 
 
 
673 aa  922    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00276805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0251  excinuclease ABC subunit B  57.32 
 
 
665 aa  778    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00546906  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2160  excinuclease ABC subunit B  59.25 
 
 
721 aa  806    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2248  excinuclease ABC subunit B  65.1 
 
 
696 aa  876    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23510  excinuclease ABC subunit B  76.67 
 
 
670 aa  1037    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00672603 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0583  excinuclease ABC subunit B  53.21 
 
 
692 aa  741    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0372  excinuclease ABC subunit B  57.27 
 
 
673 aa  776    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1318  excinuclease ABC subunit B  54.71 
 
 
671 aa  758    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000791691  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0392  excinuclease ABC subunit B  55.14 
 
 
669 aa  758    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1457  excinuclease ABC subunit B  55.86 
 
 
668 aa  765    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.174778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2070  excinuclease ABC subunit B  55.9 
 
 
693 aa  749    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.12882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2210  excinuclease ABC subunit B  65.4 
 
 
707 aa  879    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0801  excinuclease ABC subunit B  60.03 
 
 
691 aa  800    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.177675 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0699  excinuclease ABC subunit B  59.82 
 
 
675 aa  810    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.301254  normal  0.648791 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2166  excinuclease ABC subunit B  70.1 
 
 
673 aa  956    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000274119  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1106  excinuclease ABC subunit B  56.64 
 
 
705 aa  762    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.442429  normal  0.317752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3485  excinuclease ABC subunit B  55.81 
 
 
701 aa  781    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1308  excinuclease ABC subunit B  58.97 
 
 
741 aa  794    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.948841  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1588  excinuclease ABC subunit B  58.81 
 
 
741 aa  791    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.359907  normal  0.0204454 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1828  excinuclease ABC subunit B  69.12 
 
 
672 aa  941    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00277406  normal  0.439002 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>