More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2813 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_2813  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 991 aa  1921    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3382  putative PAS/PAC sensor protein  51.09 
 
 		 952 aa  861    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1012  putative PAS/PAC sensor protein  57.8 
 
 		 1154 aa  891    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0819572  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  39.34 
 
 		 1059 aa  383  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  42.74 
 
 		 1969 aa  375  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  40.54 
 
 		 1216 aa  358  3.9999999999999996e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  31.7 
 
 		 1589 aa  320  9e-86  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.39 
 
 		 700 aa  316  9.999999999999999e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  36.8 
 
 		 712 aa  314  4.999999999999999e-84  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  35.66 
 
 		 728 aa  304  7.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  32.09 
 
 		 1081 aa  295  4e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  32.61 
 
 		 896 aa  285  4.0000000000000003e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  33.38 
 
 		 982 aa  276  1.0000000000000001e-72  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0683  putative PAS/PAC sensor protein  31.29 
 
 		 750 aa  242  2e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987157  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5264  putative PAS/PAC sensor protein  38.91 
 
 		 1073 aa  224  6e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.255684  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  32.94 
 
 		 919 aa  204  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 532 aa  196  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1541  putative PAS/PAC sensor protein  34.2 
 
 		 1071 aa  196  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.69 
 
 		 564 aa  194  7e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3905  putative PAS/PAC sensor protein  35.24 
 
 		 537 aa  186  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.68 
 
 		 637 aa  184  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  34.11 
 
 		 553 aa  181  4e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  34.15 
 
 		 781 aa  181  5.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  31.34 
 
 		 843 aa  176  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3054  putative PAS/PAC sensor protein  32.74 
 
 		 1260 aa  173  1e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5215  putative PAS/PAC sensor protein  31.18 
 
 		 677 aa  172  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1747  putative PAS/PAC sensor protein  34.14 
 
 		 524 aa  166  3e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1371  putative PAS/PAC sensor protein  33.91 
 
 		 834 aa  165  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  31.46 
 
 		 994 aa  163  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  31.4 
 
 		 737 aa  155  4e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3168  putative PAS/PAC sensor protein  31.86 
 
 		 807 aa  155  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  30.09 
 
 		 680 aa  153  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3065  putative PAS/PAC sensor protein  32 
 
 		 770 aa  148  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  30.88 
 
 		 666 aa  147  1e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 921 aa  144  9.999999999999999e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.76 
 
 		 1516 aa  136  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 873 aa  123  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1305  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.45 
 
 		 598 aa  123  1.9999999999999998e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  29.55 
 
 		 644 aa  122  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1537  putative PAS/PAC sensor protein  39.89 
 
 		 636 aa  122  3e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 		 896 aa  118  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 1042 aa  115  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.755924 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3297  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 		 700 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  28.78 
 
 		 539 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3535  putative PAS/PAC sensor protein  31.17 
 
 		 684 aa  110  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 1195 aa  106  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0888  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.04 
 
 		 1045 aa  104  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.628916  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0920  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 		 655 aa  102  4e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.301008  decreased coverage  0.000022653 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3311  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 1300 aa  95.9  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.703453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2827  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 1064 aa  95.5  4e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 529 aa  93.2  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 759 aa  92.8  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0209  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 		 546 aa  92  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.77 
 
 		 242 aa  89.7  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 1052 aa  87.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2916  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 691 aa  87  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3015  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 500 aa  85.1  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1325  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.2 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 		 1352 aa  84.7  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  31.25 
 
 		 906 aa  84.3  0.000000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.47 
 
 		 1532 aa  84.3  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1202  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.86 
 
 		 1126 aa  83.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.766255  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3379  putative PAS/PAC sensor protein  28.87 
 
 		 449 aa  82  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.02 
 
 		 604 aa  81.3  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 1325 aa  81.3  0.00000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  29.49 
 
 		 1171 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.86 
 
 		 773 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.12 
 
 		 683 aa  79.7  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 783 aa  80.1  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0184  histidine kinase  35.32 
 
 		 511 aa  79.7  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.31584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.8 
 
 		 251 aa  79  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.94 
 
 		 653 aa  79.3  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0330  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 		 758 aa  77.4  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2115  putative PAS/PAC sensor protein  25.96 
 
 		 536 aa  76.6  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  26.83 
 
 		 1629 aa  75.9  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 		 817 aa  75.5  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1643  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 739 aa  74.7  0.000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 1032 aa  74.3  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.99 
 
 		 1466 aa  73.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0011  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.1 
 
 		 952 aa  73.6  0.00000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  27.27 
 
 		 440 aa  73.6  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 		 909 aa  72.4  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0059  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 		 729 aa  71.6  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.318391  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2707  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.06 
 
 		 776 aa  71.6  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.81 
 
 		 823 aa  71.2  0.00000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.348272  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 781 aa  70.5  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.15 
 
 		 793 aa  70.1  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0208  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.81 
 
 		 947 aa  70.1  0.0000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3391  putative PAS/PAC sensor protein  31.52 
 
 		 1301 aa  68.9  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0258089  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  26.29 
 
 		 1062 aa  68.6  0.0000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.4 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3712  putative PAS/PAC sensor protein  33.05 
 
 		 379 aa  68.6  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0335  response regulator receiver/GGDEF/EAL domain-containing protein  25 
 
 		 980 aa  68.2  0.0000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.376364  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2464  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 		 812 aa  67.8  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  52.24 
 
 		 603 aa  66.6  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.8 
 
 		 1791 aa  66.6  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  26.23 
 
 		 1061 aa  66.2  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.91 
 
 		 1053 aa  66.2  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.55 
 
 		 1051 aa  64.7  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1464  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.07 
 
 		 1135 aa  64.7  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.396763 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>