More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_22480 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_22480  histone deacetylase superfamily  100 
 
 
480 aa  991    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00877873  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1405  histone deacetylase superfamily protein  59.68 
 
 
478 aa  544  1e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2932  histone deacetylase  58.05 
 
 
528 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00716511 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2127  Histone deacetylase  56.66 
 
 
447 aa  528  1e-148  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.003009  normal  0.054608 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1885  histone deacetylase superfamily protein  54.18 
 
 
451 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0989  histone deacetylase superfamily protein  58.26 
 
 
437 aa  515  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1009  Histone deacetylase  54.93 
 
 
450 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.287637  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0024  histone deacetylase superfamily  56.95 
 
 
439 aa  515  1.0000000000000001e-145  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0263374 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2337  histone deacetylase family protein  55.19 
 
 
439 aa  514  1e-144  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.724338  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1031  histone deacetylase superfamily  55.38 
 
 
438 aa  508  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3163  histone deacetylase superfamily protein  55.61 
 
 
438 aa  509  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.114353  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4058  histone deacetylase superfamily protein  54.16 
 
 
438 aa  509  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0976  hypothetical protein  54.77 
 
 
448 aa  505  9.999999999999999e-143  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0778  histone deacetylase superfamily  51.47 
 
 
435 aa  499  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1093  histone deacetylase superfamily protein  54.36 
 
 
439 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.718834  normal  0.264484 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0223  Histone deacetylase  53.3 
 
 
446 aa  481  1e-134  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.195671 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0126  histone deacetylase superfamily  52.55 
 
 
473 aa  455  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2733  histone deacetylase superfamily  46.17 
 
 
441 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  41.54 
 
 
364 aa  234  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1947  histone deacetylase superfamily  33.22 
 
 
343 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0154  histone deacetylase superfamily protein  38.84 
 
 
345 aa  151  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000391208  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  32.92 
 
 
426 aa  150  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  29.81 
 
 
331 aa  149  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  34.59 
 
 
417 aa  146  6e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0721  histone deacetylase superfamily protein  32.19 
 
 
322 aa  146  7.0000000000000006e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.459937  normal  0.0813837 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  34.48 
 
 
351 aa  145  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  32.75 
 
 
316 aa  145  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  38.46 
 
 
344 aa  144  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  33.77 
 
 
407 aa  144  5e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  34.11 
 
 
344 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  40.09 
 
 
326 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3589  histone deacetylase superfamily  37.45 
 
 
352 aa  141  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000112978 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  32.9 
 
 
403 aa  141  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0732  histone deacetylase superfamily protein  32.17 
 
 
308 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  31.39 
 
 
435 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  37.45 
 
 
369 aa  139  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  31.53 
 
 
411 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  37.95 
 
 
370 aa  139  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  38.34 
 
 
387 aa  138  2e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  31.27 
 
 
370 aa  138  2e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0563  histone deacetylase superfamily  32.65 
 
 
335 aa  137  5e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.349825  normal  0.347907 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  34.44 
 
 
388 aa  136  8e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  35.43 
 
 
311 aa  136  8e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  34.44 
 
 
388 aa  136  8e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1949  histone deacetylase superfamily protein  37.56 
 
 
346 aa  136  9e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  34.07 
 
 
388 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  34.53 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0388  histone deacetylase superfamily protein  34.01 
 
 
309 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.621071 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  34.07 
 
 
388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  34.07 
 
 
388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  34.07 
 
 
388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  34.07 
 
 
388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  34.07 
 
 
388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  34.07 
 
 
388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  35.91 
 
 
396 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4349  histone deacetylase superfamily protein  31.02 
 
 
373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.360906 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  31.56 
 
 
388 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0496  histone deacetylase superfamily protein  34.6 
 
 
309 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  45.21 
 
 
348 aa  134  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1341  putative acetylpolyamine aminohydrolase  35.42 
 
 
380 aa  134  3e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0109  histone deacetylase superfamily  37.38 
 
 
334 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.39401 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  34.4 
 
 
389 aa  134  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  34.19 
 
 
369 aa  134  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15260  putative acetylpolyamine aminohydrolase  34.58 
 
 
380 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0390858  hitchhiker  0.0000000000262427 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2249  histone deacetylase superfamily  41.94 
 
 
336 aa  133  6e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.775284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  37.78 
 
 
369 aa  133  6e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  33.76 
 
 
369 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  33.76 
 
 
369 aa  133  7.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  36.77 
 
 
369 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  32.1 
 
 
388 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  39.8 
 
 
396 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  34.82 
 
 
379 aa  131  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2918  histone deacetylase superfamily protein  37.63 
 
 
345 aa  131  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  31.43 
 
 
306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  39.49 
 
 
374 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1151  histone deacetylase superfamily protein  30.46 
 
 
309 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  35.07 
 
 
340 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  35.07 
 
 
369 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  34.4 
 
 
406 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0616  histone deacetylase superfamily protein  32.39 
 
 
370 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  37.23 
 
 
390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00780  histone deacetylase clr3, putative  35.94 
 
 
737 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.568291  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  29.21 
 
 
406 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2048  histone deacetylase superfamily protein  37.12 
 
 
365 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.309662  normal  0.408539 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3218  histone deacetylase superfamily  34.27 
 
 
309 aa  127  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.22285  normal  0.410643 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  34.96 
 
 
392 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3337  histone deacetylase family protein  36.32 
 
 
367 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.937629  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2993  histone deacetylase superfamily protein  34.27 
 
 
328 aa  127  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0478  histone deacetylase superfamily protein  41.53 
 
 
342 aa  127  5e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262897  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1875  histone deacetylase superfamily  35.27 
 
 
309 aa  127  5e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.184151  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0024  histone deacetylase superfamily  31.25 
 
 
343 aa  127  6e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  34.98 
 
 
373 aa  127  6e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3179  histone deacetylase superfamily  33.87 
 
 
325 aa  127  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  30.74 
 
 
395 aa  126  8.000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_71431  predicted protein  40.19 
 
 
807 aa  126  9e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.71958  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0991  Histone deacetylase  36.02 
 
 
327 aa  126  1e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.964877  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_87707  predicted protein  36.19 
 
 
480 aa  125  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.18467  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0430  histone deacetylase family protein  29.32 
 
 
337 aa  125  1e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2206  Histone deacetylase  37.98 
 
 
344 aa  125  1e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1126  histone deacetylase superfamily protein  39.66 
 
 
336 aa  125  1e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.546018 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>