More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1656 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1656  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 225 aa  115  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 236 aa  112  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3445  TetR family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 208 aa  84  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2015  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 205 aa  67.4  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3859  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.677666 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4557  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  27.57 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.03 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.03 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.03 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  27.03 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.03 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.03 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1709  transcriptional regulator, TetR family  45.21 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1864  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.796207  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  37.3 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27500  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5376  putative transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0545475 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4302  transcriptional regulator, TetR family  25.68 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17710  transcriptional regulator  29.23 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0632938  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4432  TetR family transcriptional regulator  29.84 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.21103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1206  regulatory protein TetR  44.26 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3587  TetR family transcriptional regulator  23.24 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 199 aa  52.4  0.000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  26.13 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  24.29 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4010  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 228 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.00413509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1780  regulatory protein, TetR  25.13 
 
 		 212 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.407505  normal  0.506261 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0947  TetR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 205 aa  51.6  0.000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0946183  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4481  transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.918639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1498  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 233 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0699971 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4682  TetR family transcriptional regulator  23.13 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000014918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4426  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 210 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.062473  normal  0.279059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1387  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.649854  normal  0.844436 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3171  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.323724  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4336  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.426629 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5279  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00504673 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  34.72 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 183 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  28.06 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 		 222 aa  50.1  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4006  regulatory protein, TetR  24.59 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722695  normal  0.0616898 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3439  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4301  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3809  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 193 aa  49.7  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5436  transcriptional regulator, TetR family  43.1 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.770498 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 194 aa  49.7  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  38.46 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2337  TetR family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0181151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2561  transcriptional regulator, TetR family  24.83 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5008  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1053  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.853566  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  21.77 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  23.17 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3010  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  39.74 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  39.74 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0936  transcriptional regulator, TetR family protein  28.21 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  39.74 
 
 		 194 aa  48.5  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 190 aa  48.5  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1196  TetR family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 235 aa  48.5  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0270816  normal  0.528782 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  43.48 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2888  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 231 aa  48.5  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.465905  normal  0.0499957 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  26.77 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 202 aa  48.1  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  21.77 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  21.77 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  21.77 
 
 		 215 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0457  TetR family transcriptional regulator  22.3 
 
 		 206 aa  48.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3842  transcriptional regulator BetI  35.38 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3036  regulatory protein, TetR  25 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0300267  normal  0.0658454 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  39.74 
 
 		 194 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  39.74 
 
 		 194 aa  48.1  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1436  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 125 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000772402  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3528  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3584  regulatory protein TetR  32.26 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0125026  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4404  TetR family transcriptional regulator  46.03 
 
 		 199 aa  47.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0114676  normal  0.191291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2917  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 218 aa  47.4  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 201 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>