More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0205 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0205  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
378 aa  762    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.130265  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3245  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.04 
 
 
372 aa  107  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1681  RND family efflux transporter MFP subunit  29.04 
 
 
368 aa  96.7  6e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.98485  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2136  CzcB family heavy metal efflux protein  26.35 
 
 
418 aa  94  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4295  secretion protein HlyD  26.87 
 
 
368 aa  93.6  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.369293  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0829  CzcB family heavy metal efflux protein  27.36 
 
 
423 aa  93.6  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1176  RND family efflux transporter MFP subunit  26.86 
 
 
421 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.771785  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0152  secretion protein HlyD  26.89 
 
 
382 aa  91.3  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.78 
 
 
428 aa  90.5  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.84 
 
 
368 aa  89.7  7e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.334759  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00408  putative cation efflux protein  29.69 
 
 
344 aa  89.7  8e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000967818  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4764  RND family efflux transporter MFP subunit  26.73 
 
 
405 aa  89.4  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0953346  normal  0.423915 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28 
 
 
412 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3508  secretion protein HlyD  25.83 
 
 
424 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3361  RND family efflux transporter MFP subunit  24.75 
 
 
410 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3606  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.5 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.335838  normal  0.676056 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4683  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.5 
 
 
406 aa  87.8  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0376338  normal  0.281701 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0514  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.02 
 
 
393 aa  87.4  3e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.770818  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02378  cation transporter transmembrane protein  28.27 
 
 
382 aa  87.4  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.571869  normal  0.441465 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2275  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.44 
 
 
427 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.178981 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2719  heavy metal efflux system protein, putative  27.48 
 
 
365 aa  84.3  0.000000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0333968  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3561  secretion protein HlyD  25.07 
 
 
413 aa  84  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.398677 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0293  secretion protein HlyD  30.2 
 
 
514 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.287992  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4189  secretion protein HlyD  25.2 
 
 
432 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.934665 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01979  multidrug efflux system, subunit A  29.69 
 
 
415 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01971  hypothetical protein  29.69 
 
 
415 aa  82.8  0.000000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4508  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.51 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50904  normal  0.396278 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2170  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.43 
 
 
390 aa  82.8  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000873754  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4376  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.51 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.264009  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2800  secretion protein HlyD  30.69 
 
 
356 aa  82  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.278622  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3686  RND family efflux transporter MFP subunit  26.56 
 
 
440 aa  82.4  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.98045  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1465  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.93 
 
 
519 aa  82.4  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.817622  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0537  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.58 
 
 
400 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5682  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein NimB  29.51 
 
 
366 aa  82  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00246104  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3014  multidrug efflux system subunit MdtA  29.69 
 
 
415 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.105913 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2366  multidrug efflux system subunit MdtA  29.69 
 
 
415 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2684  multidrug efflux system subunit MdtA  29.18 
 
 
411 aa  82  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1159  multidrug efflux system subunit MdtA  29.69 
 
 
415 aa  82  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0295  secretion protein HlyD  25.17 
 
 
379 aa  82  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.438063  normal  0.535582 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0986  multidrug efflux system subunit MdtA  29.69 
 
 
415 aa  82  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0918  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.27 
 
 
366 aa  80.9  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0448  secretion protein HlyD  23.56 
 
 
388 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.192124 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2842  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.55 
 
 
587 aa  80.5  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.609412  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1582  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.38 
 
 
415 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0117238  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2216  multidrug efflux system subunit MdtA  29.38 
 
 
415 aa  79.7  0.00000000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1567  multidrug efflux system subunit MdtA  29.38 
 
 
455 aa  79.3  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.331208 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6239  putative cation efflux membrane fusion protein  26.51 
 
 
375 aa  79.3  0.00000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3803  secretion protein HlyD  25.33 
 
 
386 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545346  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5330  heavy metal cation tricomponent efflux protein HmxB  27.37 
 
 
385 aa  79  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0257182  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2043  RND family efflux transporter MFP subunit  25.44 
 
 
404 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148074  normal  0.931139 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3297  secretion protein HlyD  24.49 
 
 
418 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1564  RND family efflux transporter MFP subunit  28.25 
 
 
369 aa  76.6  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.000000112948  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2912  secretion protein HlyD  23.91 
 
 
418 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1640  secretion protein HlyD  26.48 
 
 
384 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31990  cobalt/zinc/cadmium efflux RND transporter, membrane fusion protein, CzcB famil  27.62 
 
 
484 aa  76.6  0.0000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1078  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.6 
 
 
459 aa  76.3  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.465461  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1545  HlyD family heavy metal efflux pump  23.24 
 
 
415 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.453732  normal  0.148664 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3622  secretion protein HlyD  26.81 
 
 
397 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.106281  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2988  hypothetical protein  26.77 
 
 
416 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0772  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.42 
 
 
353 aa  75.5  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000602446  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1784  secretion protein HlyD  28.44 
 
 
524 aa  75.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0136066  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2259  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.04 
 
 
397 aa  75.5  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.141283  normal  0.411522 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0142  secretion protein HlyD  32.3 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.133339  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2409  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB, putative  26.04 
 
 
404 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.228901  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4802  secretion protein HlyD  26.67 
 
 
424 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838463  decreased coverage  0.00074061 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2627  secretion protein HlyD  23.27 
 
 
399 aa  74.3  0.000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.524182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  24.82 
 
 
416 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.847384 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2716  RND divalent metal cation efflux membrane fusion protein CzcB precursor  27.27 
 
 
484 aa  74.7  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00705  cation efflux system protein  27.85 
 
 
371 aa  74.3  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.333087  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  24.82 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  24.82 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3286  RND family efflux transporter MFP subunit  26.04 
 
 
404 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.522349 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  24.82 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1549  RND family efflux transporter MFP subunit  26.55 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6209  membrane fusion protein cluster 2  27.8 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.401631  normal  0.0698846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2818  secretion protein HlyD  24.85 
 
 
376 aa  73.2  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.68617  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1177  secretion protein HlyD  26.94 
 
 
397 aa  72.8  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4121  heavy metal cation tricomponent efflux membrane fusion protein HmyB  26 
 
 
384 aa  72.8  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1460  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.74 
 
 
355 aa  72  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4057  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.24 
 
 
374 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3353  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.22 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.462389  normal  0.0123154 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2107  secretion protein HlyD  25.79 
 
 
509 aa  70.5  0.00000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.207972  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  27.66 
 
 
362 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000256578  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2356  multidrug efflux system subunit MdtA  27.83 
 
 
413 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2253  secretion protein HlyD  21.3 
 
 
398 aa  70.1  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.706134 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0830  cation eflux system protein  22.47 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0187806  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2473  RND family efflux transporter MFP subunit  27.18 
 
 
340 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000483953  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0376  cation efflux family protein  25.68 
 
 
422 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  27.97 
 
 
380 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2256  multidrug efflux system subunit MdtA  27.52 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2472  multidrug efflux system subunit MdtA  27.52 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.957345 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2363  multidrug efflux system subunit MdtA  27.52 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.67985 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0979  transporter, putative  24.51 
 
 
253 aa  68.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.88 
 
 
388 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8250  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.98 
 
 
368 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.673804  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2097  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.91 
 
 
553 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0579  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.09 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.087454  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2338  RND family efflux transporter MFP subunit  28.35 
 
 
459 aa  68.2  0.0000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.205065  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  23.32 
 
 
502 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3919  RND family efflux transporter MFP subunit  28.14 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0652865  normal  0.12074 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>