More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2651 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2651  pyruvate carboxyltransferase  100 
 
 		 345 aa  696    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0638  pyruvate carboxyltransferase  79.94 
 
 		 345 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0582905  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0906  pyruvate carboxyltransferase  77.71 
 
 		 446 aa  547  1e-154  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2770  pyruvate carboxyltransferase  76.15 
 
 		 438 aa  545  1e-154  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0876  pyruvate carboxyltransferase  71.01 
 
 		 387 aa  511  1e-144  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1298  2-isopropylmalate synthase  51.95 
 
 		 500 aa  358  7e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0942  2-isopropylmalate synthase  49.57 
 
 		 502 aa  348  6e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1781  2-isopropylmalate synthase  49.39 
 
 		 442 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2111  pyruvate carboxyltransferase  49.25 
 
 		 491 aa  330  2e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1815  pyruvate carboxyltransferase  47.26 
 
 		 490 aa  322  4e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.38569 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0603  2-isopropylmalate synthase  47.02 
 
 		 522 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0910176 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0849  2-isopropylmalate synthase  42.77 
 
 		 514 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2360  pyruvate carboxyltransferase  47.46 
 
 		 479 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1070  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  46.15 
 
 		 505 aa  300  3e-80  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1596  2-isopropylmalate synthase  44.54 
 
 		 514 aa  295  6e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.343171  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0316  2-isopropylmalate synthase  44.25 
 
 		 514 aa  295  8e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.196798 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0531  2-isopropylmalate synthase  43.66 
 
 		 514 aa  291  9e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.428249  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1671  LeuA allosteric domain-containing protein  50.35 
 
 		 411 aa  291  1e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0623  trans-homoaconitate synthase  46.71 
 
 		 377 aa  287  2e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0214  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  44.48 
 
 		 347 aa  286  5e-76  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.693207  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0385  2-isopropylmalate synthase  41.3 
 
 		 514 aa  285  8e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0388632  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2063  trans-homoaconitate synthase  46.11 
 
 		 389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.214289 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1171  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.14 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.653479 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1814  trans-homoaconitate synthase  45.2 
 
 		 406 aa  264  2e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.770908  hitchhiker  0.00000383108 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1629  trans-homoaconitate synthase  41.93 
 
 		 382 aa  263  4.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0832  trans-homoaconitate synthase  45.67 
 
 		 372 aa  261  1e-68  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1533  trans-homoaconitate synthase  40.65 
 
 		 393 aa  260  3e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.200545  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0109  (R)-citramalate synthase  40.6 
 
 		 460 aa  258  1e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1604  trans-homoaconitate synthase  46.81 
 
 		 378 aa  256  4e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0226  2-isopropylmalate synthase  43.26 
 
 		 525 aa  256  5e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.885298  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3129  2-isopropylmalate synthase  45.32 
 
 		 510 aa  256  5e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.23887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3434  2-isopropylmalate synthase  40.91 
 
 		 508 aa  256  6e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0604  (R)-citramalate synthase  40.47 
 
 		 504 aa  255  8e-67  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0984378 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0260  (R)-citramalate synthase  39.51 
 
 		 492 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0093381 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0347  (R)-citramalate synthase  38.21 
 
 		 492 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2796  2-isopropylmalate synthase  42.39 
 
 		 520 aa  252  6e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.731216 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2255  2-isopropylmalate synthase  41.16 
 
 		 517 aa  251  9.000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1265  2-isopropylmalate synthase  40.77 
 
 		 512 aa  250  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000029461  decreased coverage  0.00000000000565514 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4446  2-isopropylmalate synthase  42.9 
 
 		 555 aa  250  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_734  isopropylmalate/homocitrate/citramalate synthase  41.07 
 
 		 505 aa  249  5e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.368888  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1641  (R)-citramalate synthase  38.6 
 
 		 492 aa  249  5e-65  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.345484  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1190  2-isopropylmalate synthase  40.72 
 
 		 503 aa  249  6e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.636554  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0711  (R)-citramalate synthase  38.81 
 
 		 485 aa  249  7e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0830  2-isopropylmalate synthase  41.07 
 
 		 505 aa  248  8e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.141095  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0576  (R)-citramalate synthase  38.6 
 
 		 492 aa  248  1e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0595  2-isopropylmalate synthase  40.75 
 
 		 532 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000207046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1158  trans-homoaconitate synthase  40.82 
 
 		 386 aa  248  1e-64  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0285  2-isopropylmalate synthase  40.75 
 
 		 505 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2666  2-isopropylmalate synthase  41.49 
 
 		 521 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.390091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0749  2-isopropylmalate synthase  41.07 
 
 		 505 aa  246  3e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2143  2-isopropylmalate synthase  40.23 
 
 		 509 aa  246  3e-64  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.151808  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0093  2-isopropylmalate synthase  42.24 
 
 		 521 aa  247  3e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2901  2-isopropylmalate synthase  42.39 
 
 		 520 aa  246  4e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.162698 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2674  2-isopropylmalate synthase  42.39 
 
 		 520 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.151029  normal  0.154507 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1522  trans-homoaconitate synthase  41.48 
 
 		 386 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1243  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.94 
 
 		 504 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0797  trans-homoaconitate synthase  41.8 
 
 		 386 aa  245  8e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0215775  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1906  2-isopropylmalate synthase  39.58 
 
 		 512 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00355798  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0602  2-isopropylmalate synthase  42.09 
 
 		 522 aa  244  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1153  trans-homoaconitate synthase  40.84 
 
 		 386 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0014  pyruvate carboxyltransferase  41.34 
 
 		 398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2219  2-isopropylmalate synthase  38.99 
 
 		 499 aa  243  3e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2402  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthase  41.19 
 
 		 500 aa  243  3e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.748245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0785  trans-homoaconitate synthase  38.82 
 
 		 380 aa  243  3.9999999999999997e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3643  2-isopropylmalate synthase  41.38 
 
 		 519 aa  243  5e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1069  isopropylmalate/citramalate/homocitrate synthases  40.6 
 
 		 503 aa  242  6e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.111067  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2330  2-isopropylmalate synthase  44.25 
 
 		 529 aa  242  7.999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1005  2-isopropylmalate synthase  43.95 
 
 		 529 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1459  2-isopropylmalate synthase  41.64 
 
 		 511 aa  241  1e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.281807 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0505  2-isopropylmalate synthase  39.44 
 
 		 507 aa  241  2e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0683  2-isopropylmalate synthase  41.33 
 
 		 526 aa  240  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.725586 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0415  trans-homoaconitate synthase  38.99 
 
 		 383 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000279687  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6044  2-isopropylmalate synthase  41.49 
 
 		 523 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0953  2-isopropylmalate synthase  42.39 
 
 		 520 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10860  2-isopropylmalate synthase  41.18 
 
 		 515 aa  240  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0994  trans-homoaconitate synthase  40.95 
 
 		 387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1598  2-isopropylmalate synthase  43.95 
 
 		 529 aa  239  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.292541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1391  2-isopropylmalate synthase  40 
 
 		 511 aa  239  5e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1444  2-isopropylmalate synthase  41.79 
 
 		 519 aa  239  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3715  2-isopropylmalate synthase  39.88 
 
 		 516 aa  239  5e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000112658  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08050  trans-homoaconitate synthase  38.51 
 
 		 385 aa  239  5.999999999999999e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000328807  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0596  2-isopropylmalate synthase  42.39 
 
 		 525 aa  238  8e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1703  trans-homoaconitate synthase  39.13 
 
 		 381 aa  238  8e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3218  2-isopropylmalate synthase  41.79 
 
 		 507 aa  238  8e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2918  2-isopropylmalate synthase  40.64 
 
 		 407 aa  238  8e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.447422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0355  2-isopropylmalate synthase  40.77 
 
 		 509 aa  238  1e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1522  trans-homoaconitate synthase  38.87 
 
 		 387 aa  238  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000249206  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0739  2-isopropylmalate synthase  41.81 
 
 		 524 aa  238  1e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0190  pyruvate carboxyltransferase  41.25 
 
 		 393 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1035  trans-homoaconitate synthase  40.06 
 
 		 386 aa  237  2e-61  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.875019  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2742  2-isopropylmalate synthase  39.29 
 
 		 515 aa  237  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0232  trans-homoaconitate synthase  39.81 
 
 		 388 aa  237  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1499  2-isopropylmalate synthase  39.29 
 
 		 515 aa  236  4e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1589  2-isopropylmalate synthase  38.86 
 
 		 510 aa  236  5.0000000000000005e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2593  2-isopropylmalate synthase  38.23 
 
 		 515 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2282  2-isopropylmalate synthase  42.39 
 
 		 527 aa  236  6e-61  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2192  trans-homoaconitate synthase  39.64 
 
 		 405 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.452906  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1801  trans-homoaconitate synthase  40.31 
 
 		 393 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.803537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0854  trans-homoaconitate synthase  37.31 
 
 		 389 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000165834  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1329  2-isopropylmalate synthase  41.79 
 
 		 527 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>