More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_2145 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_2145  UspA domain protein  100 
 
 		 295 aa  589  1e-167  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4298  UspA domain protein  74.19 
 
 		 281 aa  417  9.999999999999999e-116  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.940658  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3718  UspA domain protein  69.45 
 
 		 278 aa  396  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0262  UspA domain protein  69.06 
 
 		 279 aa  387  1e-106  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.542285  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1040  UspA domain protein  70.46 
 
 		 281 aa  361  9e-99  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0924435  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3112  UspA domain-containing protein  31.03 
 
 		 290 aa  95.9  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.615607  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1847  UspA domain protein  29.73 
 
 		 293 aa  95.5  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000811482 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2427  UspA domain-containing protein  29.75 
 
 		 275 aa  94.7  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.420316  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2866  UspA domain-containing protein  29.33 
 
 		 276 aa  88.2  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1158  UspA domain-containing protein  28.21 
 
 		 296 aa  88.2  1e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2372  UspA domain protein  31.14 
 
 		 293 aa  82.4  0.000000000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019406  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4336  hypothetical protein  34.38 
 
 		 289 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0474832 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3170  hypothetical protein  25.94 
 
 		 294 aa  76.6  0.0000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  31.14 
 
 		 287 aa  75.9  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  29.3 
 
 		 300 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  32.86 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  27.55 
 
 		 288 aa  73.9  0.000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56590  hypothetical protein  29.13 
 
 		 286 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.563899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3936  UspA domain protein  35 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.961196 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  31.53 
 
 		 298 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0923  UspA domain-containing protein  28.1 
 
 		 285 aa  70.5  0.00000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.792635  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2155  UspA domain-containing protein  25.58 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2648  universal stress protein  25 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2309  hypothetical protein  23.91 
 
 		 295 aa  69.3  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  29.17 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4922  hypothetical protein  28.26 
 
 		 286 aa  69.3  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  28.25 
 
 		 290 aa  69.3  0.00000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  32.13 
 
 		 309 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4382  UspA domain-containing protein  26.55 
 
 		 295 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3171  UspA domain-containing protein  24.16 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0327  UspA domain protein  28.45 
 
 		 305 aa  65.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.81164 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1641  UspA domain-containing protein  25.09 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0276  UspA domain protein  36.96 
 
 		 138 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  28.62 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1094  hypothetical protein  25.91 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.604509  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  37.41 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  29.58 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1269  hypothetical protein  29.49 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.775784 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  33.78 
 
 		 283 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0255  UspA domain protein  27.03 
 
 		 291 aa  62  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.955091  normal  0.331109 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0288  UspA domain protein  28.29 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.48991 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1735  universal stress protein  26.11 
 
 		 301 aa  60.8  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0846445  normal  0.348826 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2707  UspA domain-containing protein  28.32 
 
 		 279 aa  61.6  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1900  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 		 277 aa  60.5  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0128633  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  26.21 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3238  universal stress protein  27.64 
 
 		 297 aa  59.7  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.173397  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0161  UspA domain-containing protein  25.31 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1939  UspA domain-containing protein  32.89 
 
 		 157 aa  59.7  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4203  hypothetical protein  30.07 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.470587 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1453  UspA domain protein  26.72 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.870406  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  28.76 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  29.53 
 
 		 157 aa  59.3  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0991  hypothetical protein  24.24 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2614  universal stress protein  28.03 
 
 		 280 aa  59.3  0.00000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1011  UspA domain protein  24.89 
 
 		 292 aa  59.3  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000787918 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0336  hypothetical protein  30.46 
 
 		 284 aa  59.3  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1314  UspA domain-containing protein  27.4 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.858313  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  34.75 
 
 		 148 aa  59.3  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0070  UspA domain protein  30.77 
 
 		 157 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2342  UspA domain protein  31.95 
 
 		 304 aa  58.5  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.289237  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1891  UspA domain-containing protein  30.29 
 
 		 277 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.098004  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  26.79 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  37.14 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0101  UspA domain protein  30.92 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3796  UspA domain protein  30.88 
 
 		 139 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.72021 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2511  UspA domain-containing protein  40.54 
 
 		 143 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.947152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4616  UspA domain protein  29.79 
 
 		 141 aa  58.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1517  UspA domain protein  28.97 
 
 		 148 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.346414  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2792  UspA domain-containing protein  33.79 
 
 		 162 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.276612  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1021  UspA domain-containing protein  29.37 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2918  UspA domain-containing protein  23.56 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00519295 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1787  universal stress protein  26.38 
 
 		 345 aa  57  0.0000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0609  UspA domain protein  20.07 
 
 		 283 aa  57  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4087  UspA domain-containing protein  34.65 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.305818  normal  0.183761 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0415  UspA domain protein  25.75 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.189257 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 147 aa  56.6  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4990  UspA domain protein  23.98 
 
 		 285 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.380571 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1118  universal stress protein  29.45 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2182  UspA domain protein  23.11 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44930  Usp-like protein  29.06 
 
 		 294 aa  56.2  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  25.31 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2244  UspA domain protein  23.11 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.616395 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  27.23 
 
 		 282 aa  56.2  0.0000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1759  universal stress protein  25.21 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  43 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7039  UspA domain protein  28.63 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  29.36 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  36.43 
 
 		 162 aa  55.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0631  UspA domain protein  32.26 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113911  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1124  UspA domain-containing protein  28.38 
 
 		 282 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  35.71 
 
 		 162 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2660  hypothetical protein  27.27 
 
 		 288 aa  55.1  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.82122  normal  0.708398 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1007  UspA domain protein  28.43 
 
 		 320 aa  55.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  31.53 
 
 		 303 aa  55.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6657  UspA domain protein  32.35 
 
 		 311 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4486  hypothetical protein  23.94 
 
 		 306 aa  54.3  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1861  hypothetical protein  26.89 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  28.97 
 
 		 145 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0866  UspA domain protein  25.95 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111703  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  32.65 
 
 		 148 aa  54.3  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>