57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0977 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_3138  Type II secretion system F domain protein  60.32 
 
 		 684 aa  849    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.160866  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0947  Type II secretion system F domain protein  61.95 
 
 		 697 aa  843    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2147  type II secretion system protein  64.13 
 
 		 679 aa  807    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0236165 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2860  type II secretion system protein  59.97 
 
 		 678 aa  773    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0977  type II secretion system protein  100 
 
 		 680 aa  1365    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0449  type II secretion system protein  29.29 
 
 		 716 aa  288  2e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  28.33 
 
 		 641 aa  243  7.999999999999999e-63  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  29.01 
 
 		 644 aa  240  6.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  29.59 
 
 		 652 aa  240  6.999999999999999e-62  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  26.32 
 
 		 647 aa  217  7e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1031  type II secretion system protein  28.72 
 
 		 715 aa  204  4e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.549235 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  26.79 
 
 		 807 aa  194  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  27.89 
 
 		 802 aa  187  5e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0732  transporter  24.52 
 
 		 660 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1458  hypothetical protein  23.64 
 
 		 625 aa  172  2e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.441143 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  27.83 
 
 		 536 aa  163  9e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1538  hypothetical protein  24.64 
 
 		 601 aa  144  4e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000607294  hitchhiker  0.000766837 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2385  type II secretion system protein  24.7 
 
 		 610 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0700595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0253  type II secretion system protein  32.77 
 
 		 306 aa  127  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0793731  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0313  type II secretion system protein  22.04 
 
 		 625 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.549227  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  31.28 
 
 		 307 aa  111  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  31.46 
 
 		 224 aa  105  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  24.61 
 
 		 329 aa  100  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  25.48 
 
 		 349 aa  96.3  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0007  Type II secretion system F domain protein  29.89 
 
 		 332 aa  95.5  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  27.84 
 
 		 296 aa  91.7  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  25.8 
 
 		 328 aa  89  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2054  serine/threonine protein kinase  44.72 
 
 		 633 aa  84.3  0.000000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.647087  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  24.58 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2001  type II secretion system protein  23.36 
 
 		 349 aa  76.6  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  22.71 
 
 		 290 aa  76.6  0.000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2569  flagellar assembly protein J  24.17 
 
 		 578 aa  74.7  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0961  flagellar assembly protein J  23.71 
 
 		 581 aa  73.9  0.000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0229  type II secretion system protein  22.27 
 
 		 582 aa  73.9  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2869  Type II secretion system F domain protein  22.78 
 
 		 574 aa  70.5  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.43773  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0268  flagellar assembly protein J  27.46 
 
 		 558 aa  60.8  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.439303  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1317  Type II secretion system F domain protein  24.4 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.89339  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  23.39 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0777  type II secretion system protein  27.56 
 
 		 284 aa  57.4  0.0000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0996  flagellar assembly protein J  21.62 
 
 		 558 aa  54.3  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.448004  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3420  Type II secretion system F domain protein  26.99 
 
 		 295 aa  54.3  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.490118  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  28.42 
 
 		 658 aa  54.3  0.000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0949  flagellar assembly protein J  21.95 
 
 		 558 aa  53.9  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2308  Type II secretion system F domain protein  24.55 
 
 		 284 aa  53.5  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1731  flagellar assembly protein J  21.46 
 
 		 558 aa  53.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.8602  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0976  flagellar assembly protein J  22.89 
 
 		 558 aa  51.2  0.00006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.73678  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1575  flagellar assembly protein J  22.51 
 
 		 551 aa  49.3  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00843715  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2405  type II secretion system protein  20.78 
 
 		 450 aa  49.7  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4445  type II secretion system protein  23.17 
 
 		 309 aa  49.7  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00467148 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1638  type II secretion system protein  23.19 
 
 		 300 aa  47.4  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.786377  normal  0.203569 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1033  type II secretion system protein  21.94 
 
 		 272 aa  46.2  0.002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0423  hypothetical protein  25.18 
 
 		 307 aa  45.8  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2671  type II secretion system protein  26.77 
 
 		 313 aa  44.3  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4618  type II secretion system protein  23.18 
 
 		 325 aa  44.3  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.347884 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1964  flagellar assembly protein J  23.03 
 
 		 517 aa  43.9  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.607678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1198  type II secretion system protein  21.93 
 
 		 620 aa  43.9  0.009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.665055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3117  type II secretion system protein  24.11 
 
 		 326 aa  43.9  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.193846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>