More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1039 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1039  Shikimate kinase  100 
 
 		 162 aa  334  2.9999999999999997e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0118821  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  44.37 
 
 		 166 aa  129  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  37.11 
 
 		 170 aa  98.2  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2022  shikimate kinase  37.42 
 
 		 192 aa  95.5  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  36.25 
 
 		 170 aa  95.1  3e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  35.8 
 
 		 593 aa  93.2  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3014  Shikimate kinase  38.13 
 
 		 203 aa  93.6  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0650528 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1596  shikimate kinase  34.06 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0865399  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1629  shikimate kinase  34.06 
 
 		 174 aa  92.8  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.682402  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2174  shikimate kinase II  31.29 
 
 		 172 aa  92  3e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  35.58 
 
 		 207 aa  91.7  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2880  shikimate kinase  36.08 
 
 		 188 aa  91.7  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  34.19 
 
 		 190 aa  91.7  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0781  shikimate kinase  37.75 
 
 		 170 aa  91.3  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.275347  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2922  shikimate kinase II  33.12 
 
 		 173 aa  90.9  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.55352  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3889  shikimate kinase  36.31 
 
 		 196 aa  90.9  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.090563  decreased coverage  0.00239824 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00335  shikimate kinase II  35.76 
 
 		 174 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3220  Shikimate kinase  35.76 
 
 		 174 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00339  hypothetical protein  35.76 
 
 		 174 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0456  shikimate kinase II  35.76 
 
 		 174 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3244  shikimate kinase II  35.76 
 
 		 174 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0812303 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0418  shikimate kinase II  35.76 
 
 		 174 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0462  shikimate kinase II  35.76 
 
 		 174 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0415  shikimate kinase II  35.76 
 
 		 174 aa  90.5  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  32.9 
 
 		 187 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1776  shikimate kinase II  37.12 
 
 		 170 aa  89.4  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.769228  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  31.33 
 
 		 184 aa  89.4  2e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  32.9 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  38.81 
 
 		 180 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0553  shikimate kinase  35.48 
 
 		 181 aa  88.6  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.387005  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3596  shikimate kinase  36.31 
 
 		 196 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  36.77 
 
 		 181 aa  88.6  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  34.78 
 
 		 171 aa  88.2  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  35.4 
 
 		 173 aa  87.8  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0486  shikimate kinase II  33.55 
 
 		 181 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0444  shikimate kinase II  33.55 
 
 		 181 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.647174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0431  shikimate kinase II  33.55 
 
 		 181 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0425  shikimate kinase II  33.55 
 
 		 181 aa  87.4  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0305  shikimate kinase II  35.1 
 
 		 174 aa  87  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0859  shikimate kinase II  32.89 
 
 		 174 aa  86.7  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1457  Shikimate kinase  39.71 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1431  shikimate kinase  36.57 
 
 		 196 aa  87  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373345  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1282  shikimate kinase  35.62 
 
 		 178 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410778  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2817  shikimate kinase  37.31 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.248239  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1479  shikimate kinase  37.31 
 
 		 193 aa  86.3  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.298287  normal  0.404477 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0426  shikimate kinase II  32.89 
 
 		 181 aa  86.3  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.992434  normal  0.531253 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  33.76 
 
 		 168 aa  85.1  4e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1700  Shikimate kinase  35.95 
 
 		 172 aa  84.7  5e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3313  shikimate kinase II  30.72 
 
 		 173 aa  84.3  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2745  shikimate kinase  37.42 
 
 		 173 aa  84.3  6e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.164945  normal  0.272805 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2361  shikimate kinase II  29.68 
 
 		 175 aa  84  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.314592  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1799  shikimate kinase  35.86 
 
 		 191 aa  84  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.279615  normal  0.998322 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3113  shikimate kinase II  29.41 
 
 		 173 aa  84  9e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.907983  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1609  shikimate kinase  33.78 
 
 		 185 aa  83.2  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.451303 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0997  shikimate kinase II  31.37 
 
 		 173 aa  83.6  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.287041  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  32.1 
 
 		 184 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431404 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3524  Shikimate kinase  33.77 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.236256  normal  0.835023 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  35.95 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4053  shikimate kinase  33.8 
 
 		 197 aa  82.8  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2345  shikimate kinase  33.13 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01201  shikimate kinase  37.66 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3143  shikimate kinase II  31.82 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.770724  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3282  shikimate kinase II  31.82 
 
 		 174 aa  82.8  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970543  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1018  shikimate kinase II  32.68 
 
 		 174 aa  82.4  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.891294 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  34.62 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3293  shikimate kinase II  31.17 
 
 		 174 aa  81.6  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.431512  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1145  shikimate kinase  31.79 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  32.3 
 
 		 180 aa  81.3  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2565  shikimate kinase  33.33 
 
 		 192 aa  81.3  0.000000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.412267 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  32.37 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1476  shikimate kinase  33.74 
 
 		 198 aa  80.9  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  33.12 
 
 		 167 aa  80.9  0.000000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1020  shikimate kinase  36.48 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  34.84 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  37.5 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01791  shikimate kinase  34.62 
 
 		 198 aa  80.5  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2029  shikimate kinase  31.82 
 
 		 200 aa  79  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  31.65 
 
 		 165 aa  79.3  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1381  Shikimate kinase  30.67 
 
 		 188 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1900  shikimate kinase  30.67 
 
 		 216 aa  79.3  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.976916  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0946  shikimate kinase  34.55 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.133424  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2255  shikimate kinase  30.95 
 
 		 166 aa  79.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0722  shikimate kinase  30.82 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.989492 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  32.52 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2486  shikimate kinase  32.3 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0460027  normal  0.0259491 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1951  shikimate kinase  31.82 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  31.65 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0220  Shikimate kinase  34.31 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000013813  normal  0.0131612 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49363  predicted protein  36.02 
 
 		 277 aa  78.2  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.130562  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01231  shikimate kinase  34.97 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3226  shikimate kinase  34.48 
 
 		 172 aa  77.8  0.00000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2313  Shikimate kinase  30.86 
 
 		 168 aa  78.2  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0915782  hitchhiker  0.00353016 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  36.64 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0346  shikimate kinase  32.52 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0038  shikimate kinase  31.48 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  34.33 
 
 		 183 aa  77.8  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  32.37 
 
 		 170 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  32 
 
 		 165 aa  77.4  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2488  shikimate kinase  30.63 
 
 		 168 aa  77.4  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.995704 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  32.3 
 
 		 190 aa  77  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>