More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3113 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3113  shikimate kinase II  100 
 
 		 173 aa  350  5.9999999999999994e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.907983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2922  shikimate kinase II  79.19 
 
 		 173 aa  281  3.0000000000000004e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.55352  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0997  shikimate kinase II  70.52 
 
 		 173 aa  247  6e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.287041  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3313  shikimate kinase II  69.94 
 
 		 173 aa  244  6e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1018  shikimate kinase II  64.12 
 
 		 174 aa  221  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.891294 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3282  shikimate kinase II  64.29 
 
 		 174 aa  221  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.970543  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3143  shikimate kinase II  64.29 
 
 		 174 aa  221  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.770724  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3293  shikimate kinase II  64.29 
 
 		 174 aa  219  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.431512  normal  0.133035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2174  shikimate kinase II  62.13 
 
 		 172 aa  213  8e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2361  shikimate kinase II  61.05 
 
 		 175 aa  207  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.314592  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1776  shikimate kinase II  55.36 
 
 		 170 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.769228  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0859  shikimate kinase II  53.76 
 
 		 174 aa  197  7e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.386804 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0305  shikimate kinase II  53.57 
 
 		 174 aa  195  3e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0425  shikimate kinase II  52.38 
 
 		 181 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0431  shikimate kinase II  52.38 
 
 		 181 aa  192  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.969771  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0444  shikimate kinase II  52.38 
 
 		 181 aa  193  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.647174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0486  shikimate kinase II  52.38 
 
 		 181 aa  192  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00335  shikimate kinase II  52.98 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3220  Shikimate kinase  52.98 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0462  shikimate kinase II  52.98 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0418  shikimate kinase II  52.98 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00339  hypothetical protein  52.98 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0456  shikimate kinase II  52.98 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3244  shikimate kinase II  52.98 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0812303 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0415  shikimate kinase II  52.98 
 
 		 174 aa  192  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0426  shikimate kinase II  51.79 
 
 		 181 aa  191  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.992434  normal  0.531253 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2181  Shikimate kinase  54.97 
 
 		 202 aa  174  5e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.296368  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2728  shikimate kinase II  49.7 
 
 		 180 aa  154  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255147  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1410  Shikimate kinase  49.09 
 
 		 177 aa  145  3e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.702119 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2092  shikimate kinase II  44.24 
 
 		 175 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.300334  normal  0.0606791 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1381  Shikimate kinase  40 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1388  Shikimate kinase  43.2 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00592582  normal  0.782338 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  38.82 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  42.38 
 
 		 179 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1377  Shikimate kinase  39.64 
 
 		 201 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.149071  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0252  shikimate kinase  39.29 
 
 		 190 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0091  shikimate kinase  42.07 
 
 		 173 aa  110  7.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10625 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0266  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  38.24 
 
 		 539 aa  105  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2168  shikimate kinase  37.35 
 
 		 186 aa  105  2e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.157663  normal  0.699838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  35.29 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1555  shikimate kinase  35.67 
 
 		 170 aa  103  9e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.436884  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2722  shikimate kinase I  37.95 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1878  shikimate kinase  37.35 
 
 		 186 aa  103  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2761  shikimate kinase  36.77 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00028  shikimate kinase I  38.99 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0165  Shikimate kinase  32.54 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  34.5 
 
 		 170 aa  101  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1639  shikimate kinase  40.12 
 
 		 187 aa  102  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00313687  normal  0.0402231 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0086  Shikimate kinase  36.08 
 
 		 161 aa  101  5e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.744352  hitchhiker  0.00173966 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  37.65 
 
 		 229 aa  101  6e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0894  shikimate kinase  33.73 
 
 		 190 aa  100  7e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00120765  hitchhiker  0.000836884 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2258  shikimate kinase  38.41 
 
 		 177 aa  100  7e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0089  shikimate kinase  37.34 
 
 		 161 aa  100  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.506122  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1506  shikimate kinase  35.71 
 
 		 184 aa  100  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1563  shikimate 5-dehydrogenase  35.98 
 
 		 462 aa  99.8  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4137  shikimate kinase  34.13 
 
 		 165 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.151576  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  38 
 
 		 174 aa  99  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4457  shikimate kinase  34.13 
 
 		 165 aa  98.6  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745283  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2456  shikimate kinase  35.29 
 
 		 170 aa  99  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.209695  normal  0.679915 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1840  Shikimate kinase  33.9 
 
 		 188 aa  98.6  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0636308  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  35.8 
 
 		 192 aa  98.6  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3659  Shikimate kinase  36.71 
 
 		 169 aa  98.6  4e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  38.51 
 
 		 195 aa  98.6  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  37.25 
 
 		 183 aa  98.2  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2922  shikimate kinase  34.15 
 
 		 165 aa  98.2  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1899  Shikimate kinase  33.93 
 
 		 184 aa  97.8  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000431404 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  37.91 
 
 		 183 aa  97.1  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  33.73 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0024  shikimate kinase I  35 
 
 		 173 aa  97.1  1e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  39.74 
 
 		 190 aa  96.3  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5127  shikimate kinase  35.54 
 
 		 172 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2206  shikimate kinase I  35.85 
 
 		 174 aa  96.3  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000184461  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2794  shikimate kinase  38.56 
 
 		 183 aa  96.3  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1855  shikimate kinase  34.94 
 
 		 181 aa  96.7  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0311  shikimate kinase  38.31 
 
 		 184 aa  96.3  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  34.73 
 
 		 172 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45250  shikimate kinase  34.94 
 
 		 172 aa  95.5  3e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  32.37 
 
 		 165 aa  95.1  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  32.34 
 
 		 170 aa  94.7  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  33.93 
 
 		 165 aa  95.1  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  34.73 
 
 		 172 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0979  Shikimate kinase  31.93 
 
 		 187 aa  94.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0506883 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  36.13 
 
 		 190 aa  94.7  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3598  shikimate kinase  35.95 
 
 		 183 aa  94.4  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000887516  hitchhiker  0.0000000252706 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4255  shikimate kinase  32.34 
 
 		 165 aa  94.7  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  34.34 
 
 		 176 aa  94.7  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  35.29 
 
 		 169 aa  94.7  6e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3977  shikimate kinase  32.34 
 
 		 165 aa  94.4  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.537604  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0408  shikimate kinase  34.94 
 
 		 172 aa  94.4  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  34.01 
 
 		 175 aa  94.4  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  34.01 
 
 		 175 aa  94.4  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0952  Shikimate kinase  31.93 
 
 		 187 aa  94.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1030  shikimate 5-dehydrogenase  32.21 
 
 		 454 aa  94.4  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3727  shikimate kinase I  36.25 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000014395  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3987  shikimate kinase  32.34 
 
 		 165 aa  94  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.585593  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  36.63 
 
 		 169 aa  93.2  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0225  shikimate kinase I  36.25 
 
 		 173 aa  93.6  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000000000752096  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  31.76 
 
 		 168 aa  94  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0163  shikimate kinase  35.22 
 
 		 171 aa  94  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.919882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4605  shikimate kinase I  36.25 
 
 		 173 aa  93.2  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000116276  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>