210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_3637 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_3637  Radical SAM domain protein  100 
 
 
347 aa  719    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0442  radical SAM domain-containing protein  76.33 
 
 
354 aa  536  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3390  hypothetical protein  75.22 
 
 
353 aa  527  1e-148  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3618  radical SAM domain-containing protein  75.81 
 
 
357 aa  520  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4285  radical SAM domain-containing protein  73.89 
 
 
364 aa  514  1.0000000000000001e-145  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0219  Radical SAM domain protein  72.92 
 
 
357 aa  504  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0235  Radical SAM domain protein  73.21 
 
 
357 aa  504  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.568527  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0320  hypothetical protein  66.96 
 
 
355 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000157308  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0671  Radical SAM domain protein  61.42 
 
 
355 aa  425  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  59.82 
 
 
358 aa  425  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000004914  hitchhiker  0.00000000624327 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1844  hypothetical protein  59.52 
 
 
360 aa  399  9.999999999999999e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  53.78 
 
 
355 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1091  radical SAM domain-containing protein  61.61 
 
 
356 aa  395  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0315  Radical SAM domain protein  54.44 
 
 
360 aa  367  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0801  hypothetical protein  50.29 
 
 
348 aa  357  1.9999999999999998e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000463089  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1189  Radical SAM domain protein  50.44 
 
 
386 aa  348  9e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.355638 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1159  hypothetical protein  49.86 
 
 
356 aa  347  2e-94  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.34532  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0797  hypothetical protein  50.45 
 
 
371 aa  345  6e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.106816  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1272  radical SAM domain-containing protein  51.33 
 
 
355 aa  344  1e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0550  radical SAM domain-containing protein  50.45 
 
 
375 aa  342  5.999999999999999e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0244585  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2881  hypothetical protein  50.87 
 
 
348 aa  340  2e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3088  radical SAM domain-containing protein  51.52 
 
 
354 aa  340  2.9999999999999998e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.675437  unclonable  0.0000126154 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0404  hypothetical protein  48.4 
 
 
349 aa  337  1.9999999999999998e-91  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1528  hypothetical protein  49.12 
 
 
363 aa  334  1e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1619  hypothetical protein  48.83 
 
 
348 aa  335  1e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.320855  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1280  Radical SAM domain protein  47.92 
 
 
381 aa  332  8e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1029  hypothetical protein  48.54 
 
 
359 aa  331  1e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.148113  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1007  Radical SAM domain protein  46.94 
 
 
369 aa  331  1e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0379726 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0850  Radical SAM domain protein  49.12 
 
 
350 aa  330  2e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000345291  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1407  Radical SAM domain protein  50 
 
 
352 aa  330  2e-89  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0487  hypothetical protein  49.71 
 
 
348 aa  329  4e-89  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.995091  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1477  hypothetical protein  49.42 
 
 
348 aa  327  1.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.32235  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4207  radical SAM domain-containing protein  49.56 
 
 
625 aa  327  2.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.428604  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0512  hypothetical protein  49.42 
 
 
348 aa  326  4.0000000000000003e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0371  hypothetical protein  49.13 
 
 
626 aa  324  1e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.541832  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1735  Radical SAM domain protein  48.06 
 
 
345 aa  323  2e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00136048  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0399  Radical SAM domain protein  48.55 
 
 
626 aa  318  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0400  Radical SAM domain protein  48.55 
 
 
626 aa  318  9e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.184942  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0686  hypothetical protein  47.81 
 
 
348 aa  311  1e-83  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.725444  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4707  radical SAM domain-containing protein  47.91 
 
 
399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4068  radical SAM domain-containing protein  45 
 
 
394 aa  307  2.0000000000000002e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.18733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4467  radical SAM domain-containing protein  44.71 
 
 
396 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.82006  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0533  hypothetical protein  46.22 
 
 
395 aa  302  5.000000000000001e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.271829  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1258  Radical SAM domain-containing protein  43.41 
 
 
385 aa  300  2e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.616603 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2811  Radical SAM domain protein  45.66 
 
 
402 aa  291  1e-77  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.524917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8059  Radical SAM domain protein  43.24 
 
 
404 aa  285  9e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0217  radical SAM domain-containing protein  44 
 
 
353 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.896474  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0263  hypothetical protein  47.37 
 
 
380 aa  280  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6099  radical SAM domain-containing protein  44.71 
 
 
515 aa  279  4e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.61579  normal  0.0270865 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1588  Radical SAM domain protein  43.4 
 
 
374 aa  278  8e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.357687  normal  0.0606442 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0223  radical SAM domain-containing protein  42.94 
 
 
364 aa  278  1e-73  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.772616  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0740  radical SAM domain-containing protein  42.77 
 
 
347 aa  276  4e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000523159 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1324  radical SAM domain-containing protein  40.99 
 
 
348 aa  275  7e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.161004  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1789  Radical SAM domain-containing protein  44.07 
 
 
377 aa  271  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0701  Radical SAM domain protein  41.57 
 
 
374 aa  267  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1958  Radical SAM domain protein  44.11 
 
 
379 aa  266  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.443092  normal  0.514588 
 
 
-
 
NC_002620  TC0148  hypothetical protein  41.44 
 
 
354 aa  265  7e-70  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.200407  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  41.99 
 
 
368 aa  263  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1416  radical SAM domain-containing protein  41.14 
 
 
358 aa  263  3e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.150894 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1998  hypothetical protein  42.61 
 
 
393 aa  260  2e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261204  normal  0.689392 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3578  radical SAM domain-containing protein  42.57 
 
 
359 aa  260  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2195  radical SAM domain-containing protein  40.35 
 
 
367 aa  260  2e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1157  radical SAM domain-containing protein  38 
 
 
359 aa  258  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.423135  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1643  Radical SAM domain protein  39.59 
 
 
367 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000555203  hitchhiker  0.00000328368 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0625  Radical SAM domain protein  41.83 
 
 
359 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.834734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0218  Radical SAM domain protein  39.41 
 
 
358 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0234  Radical SAM domain protein  39.71 
 
 
358 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  39.43 
 
 
360 aa  252  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  42 
 
 
360 aa  252  6e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1499  Radical SAM domain protein  38.79 
 
 
373 aa  250  2e-65  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0554  radical SAM domain-containing protein  39.43 
 
 
372 aa  248  1e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.420102 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  40.29 
 
 
361 aa  246  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  41.32 
 
 
362 aa  246  4e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000596234  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1450  Radical SAM domain protein  40.06 
 
 
368 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000839661  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  41.35 
 
 
358 aa  239  5e-62  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  39.88 
 
 
376 aa  239  6.999999999999999e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  42.17 
 
 
381 aa  235  8e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0222  radical SAM domain-containing protein  38.99 
 
 
353 aa  233  3e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.255233  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  38.11 
 
 
356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0584  hypothetical protein  36.66 
 
 
360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1846  hypothetical protein  40.8 
 
 
373 aa  233  5e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3089  radical SAM domain-containing protein  37.92 
 
 
373 aa  233  5e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.185999  hitchhiker  0.000152785 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1271  radical SAM domain-containing protein  36.31 
 
 
367 aa  231  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  37.24 
 
 
419 aa  231  1e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0149  Radical SAM domain protein  37.65 
 
 
358 aa  231  2e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00717785  normal  0.324103 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0738  radical SAM domain-containing protein  37.79 
 
 
359 aa  230  3e-59  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000230285 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0742  radical SAM domain-containing protein  35.64 
 
 
365 aa  229  4e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.547138 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2097  hypothetical protein  39.31 
 
 
376 aa  229  6e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0332172  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0551  radical SAM domain-containing protein  37.32 
 
 
372 aa  228  1e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0260021  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1686  Radical SAM domain protein  36.86 
 
 
354 aa  228  1e-58  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2163  radical SAM domain-containing protein  36.81 
 
 
367 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1188  Radical SAM domain protein  36.78 
 
 
387 aa  226  4e-58  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12301 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0259  hypothetical protein  36.9 
 
 
384 aa  226  4e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.341096  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  37.25 
 
 
370 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1483  hypothetical protein  35.92 
 
 
353 aa  226  7e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0220  radical SAM domain-containing protein  36.84 
 
 
350 aa  225  7e-58  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0810  Radical SAM domain protein  36.99 
 
 
364 aa  225  8e-58  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0537641  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  37.72 
 
 
384 aa  224  2e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  37.25 
 
 
359 aa  223  4e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0427  hypothetical protein  34.58 
 
 
354 aa  223  4.9999999999999996e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>