More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2816 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2816  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 187 aa  374  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.978539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2950  isochorismatase hydrolase  70.65 
 
 		 188 aa  260  6.999999999999999e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4714  isochorismatase hydrolase  61.54 
 
 		 191 aa  230  8.000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4464  isochorismatase hydrolase  60.96 
 
 		 187 aa  228  3e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0939811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2021  isochorismatase hydrolase  62.09 
 
 		 187 aa  227  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.128296  normal  0.0227718 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4001  isochorismatase hydrolase  59.36 
 
 		 187 aa  227  7e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4071  isochorismatase hydrolase  60.43 
 
 		 187 aa  226  1e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3796  isochorismatase hydrolase  60.96 
 
 		 187 aa  225  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.525922  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4572  isochorismatase hydrolase  60.96 
 
 		 187 aa  225  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5733  isochorismatase hydrolase  60.96 
 
 		 187 aa  225  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.57449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1272  isochorismatase hydrolase  58.38 
 
 		 187 aa  223  1e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.107065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5812  isochorismatase hydrolase  59.89 
 
 		 187 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241433  normal  0.309803 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1712  putative isochorismatase hydrolase  59.68 
 
 		 187 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2403  isochorismatase hydrolase  60.99 
 
 		 185 aa  216  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1590  isochorismatase hydrolase  49.74 
 
 		 193 aa  184  8e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2306  isochorismatase hydrolase  50.84 
 
 		 185 aa  177  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.978441  normal  0.33888 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0276  isochorismatase hydrolase  42.93 
 
 		 204 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1265  isochorismatase  41.08 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.967032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3032  isochorismatase family protein  41.08 
 
 		 195 aa  142  3e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1477  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 198 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2229  isochorismatase family protein family  40.54 
 
 		 195 aa  137  7e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2435  hypothetical protein  41.58 
 
 		 188 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.528744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1014  isochorismatase hydrolase  39.68 
 
 		 190 aa  132  3e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.584957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3302  isochorismatase  39.78 
 
 		 190 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.154623 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3599  hypothetical protein  41.58 
 
 		 199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.88722 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3277  hypothetical protein  39.49 
 
 		 199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2180  isochorismatase hydrolase  40.86 
 
 		 190 aa  128  6e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.536811 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1221  hypothetical protein  39.78 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.400987  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2116  hypothetical protein  39.78 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503086 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2061  hypothetical protein  39.78 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00956218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2056  hypothetical protein  39.78 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.201983  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1345  hypothetical protein  39.78 
 
 		 188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.263242  hitchhiker  0.00089909 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01838  predicted hydrolase  40 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1773  isochorismatase hydrolase  40 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00431212  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2098  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.803498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1765  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2603  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.54824 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1961  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01826  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1319  hypothetical protein  40 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2783  hypothetical protein  40.22 
 
 		 192 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.163841  normal  0.0349806 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0172  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 		 185 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0177  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 		 185 aa  119  3.9999999999999996e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1769  isochorismatase hydrolase  40.32 
 
 		 189 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0542  isochorismatase hydrolase  36.76 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.881223 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1016  amidase  32.98 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1678  isochorismatase hydrolase  37.65 
 
 		 166 aa  97.1  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000210474  normal  0.105079 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1817  isochorismatase hydrolase  32.97 
 
 		 189 aa  72.4  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4611  isochorismatase hydrolase family protein  33.89 
 
 		 186 aa  71.2  0.000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20850  isochorismate hydrolase  28.12 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00852514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  31.03 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0815  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0792  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 194 aa  68.9  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3307  isochorismatase hydrolase  40.4 
 
 		 174 aa  68.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0000000323098  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 213 aa  68.6  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0034  isochorismatase hydrolase  30.39 
 
 		 189 aa  67.8  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0906  isochorismatase hydrolase  26 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00114508  normal  0.390187 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1290  isochorismatase hydrolase  23.47 
 
 		 209 aa  66.6  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.534089  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1976  isochorismatase hydrolase  32.21 
 
 		 186 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.421533  normal  0.80757 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2775  isochorismatase hydrolase  29.89 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0016707  normal  0.950769 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1314  isochorismatase hydrolase  29.33 
 
 		 172 aa  66.2  0.0000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.164435  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0032  isochorismatase hydrolase  23.63 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.983597  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2152  isochorismatase hydrolase  29.48 
 
 		 185 aa  64.3  0.0000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4714  isochorismatase hydrolase  40.59 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.249873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5815  isochorismatase hydrolase  28.09 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.28995  hitchhiker  0.00617884 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0010  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000022819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1215  isochorismatase hydrolase  34.01 
 
 		 185 aa  63.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1721  isochorismatase hydrolase  32.45 
 
 		 185 aa  64.3  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.132447  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2113  isochorismatase hydrolase  35.22 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0439307  normal  0.165313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3130  isochorismatase hydrolase  34.25 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.820956  normal  0.361806 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0095  isochorismatase hydrolase  29.7 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0569  isochorismatase family protein  41.89 
 
 		 182 aa  63.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0754986  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3214  isochorismatase hydrolase  41.03 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176395  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0430  isochorismatase hydrolase  27.37 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.650644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1893  isochorismatase hydrolase  34.03 
 
 		 188 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.472889 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2952  isochorismatase hydrolase  33.8 
 
 		 185 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.2688 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3069  isochorismatase hydrolase  32.57 
 
 		 173 aa  63.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000901159  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1978  isochorismatase hydrolase  35.1 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0785753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4208  isochorismatase hydrolase  32.05 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1386  isochorismatase hydrolase  27.09 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.508569 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2198  isochorismatase hydrolase  30.65 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2026  isochorismatase hydrolase  31.1 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0370  isochorismatase hydrolase  30.86 
 
 		 209 aa  61.6  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0259  isochorismatase hydrolase family protein  27.51 
 
 		 195 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0893  isochorismatase hydrolase  35.87 
 
 		 226 aa  61.2  0.000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1023  isochorismatase hydrolase  29.94 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.228804  normal  0.0648547 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0306  GCN5-related N-acetyltransferase  42.25 
 
 		 342 aa  60.8  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2838  isochorismatase hydrolase  33.33 
 
 		 174 aa  60.5  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102988  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3272  isochorismatase hydrolase  31.07 
 
 		 212 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0889986 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02070  nicotinamidase-like amidase  28.41 
 
 		 258 aa  60.5  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.450894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2058  isochorismatase hydrolase  26.63 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2425  Isochorismatase  26.29 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4942  isochorismatase hydrolase  35.1 
 
 		 186 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0334336 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  30.91 
 
 		 227 aa  59.7  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0076  isochorismatase hydrolase  31.13 
 
 		 184 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1316  Isochorismatase  27.13 
 
 		 291 aa  60.1  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0470712  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2534  isochorismatase hydrolase  34.03 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.70955  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00897  putative hydrolase protein  30.65 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  27.36 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0170  isochorismatase hydrolase  30.46 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>