More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7115 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  100 
 
 		 699 aa  1360    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  48.85 
 
 		 745 aa  523  1e-147  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  47.05 
 
 		 713 aa  496  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  45.39 
 
 		 709 aa  465  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  44.66 
 
 		 699 aa  463  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3419  MMPL domain-containing protein  44.99 
 
 		 714 aa  451  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.825697 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  44.87 
 
 		 682 aa  448  1.0000000000000001e-124  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  38.87 
 
 		 730 aa  448  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  41.77 
 
 		 812 aa  436  1e-121  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2251  MMPL domain-containing protein  43.85 
 
 		 702 aa  434  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0500894  decreased coverage  0.00962037 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3120  MMPL domain-containing protein  42.23 
 
 		 699 aa  435  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.184679  hitchhiker  0.00179324 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  45.76 
 
 		 701 aa  429  1e-119  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  41.55 
 
 		 706 aa  416  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  40.4 
 
 		 702 aa  414  1e-114  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  41.86 
 
 		 712 aa  411  1e-113  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2666  MMPL  42.59 
 
 		 778 aa  402  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.1973 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  37.92 
 
 		 753 aa  398  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  45.57 
 
 		 576 aa  394  1e-108  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  39.83 
 
 		 737 aa  392  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3796  MMPL domain-containing protein  44.32 
 
 		 714 aa  390  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0152473 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15430  predicted RND superfamily drug exporter  40.79 
 
 		 775 aa  383  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.246156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3129  MMPL domain-containing protein  43.55 
 
 		 707 aa  375  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0519  MMPL  41.89 
 
 		 674 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0531  MMPL domain-containing protein  41.89 
 
 		 674 aa  366  1e-100  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0509  MMPL domain-containing protein  41.73 
 
 		 674 aa  364  4e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.10227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  39.01 
 
 		 733 aa  359  9.999999999999999e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9047  drug exporter of the RND superfamily-like protein  40.98 
 
 		 697 aa  358  1.9999999999999998e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1508  MMPL domain-containing protein  43.28 
 
 		 704 aa  354  2.9999999999999997e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.765397  normal  0.0844824 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0347  MMPL domain-containing protein  40.93 
 
 		 713 aa  353  5e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.553023  normal  0.0108424 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0683  MMPL domain-containing protein  42.97 
 
 		 679 aa  352  2e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316421 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1791  MMPL domain protein  39.45 
 
 		 750 aa  349  9e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0350577  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0224  MMPL domain-containing protein  43.44 
 
 		 678 aa  348  2e-94  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.525426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0269  MMPL domain protein  40.58 
 
 		 700 aa  341  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3333  MMPL domain protein  45.5 
 
 		 686 aa  340  5e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0169676  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5187  MMPL domain protein  38.02 
 
 		 780 aa  333  7.000000000000001e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3356  MMPL domain-containing protein  43.44 
 
 		 708 aa  332  2e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0136207 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18860  predicted RND superfamily drug exporter  37.47 
 
 		 764 aa  329  1.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.697244  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3564  MMPL domain protein  39.34 
 
 		 727 aa  326  9e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.643651 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2105  MMPL domain protein  40.53 
 
 		 762 aa  321  3e-86  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.174165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01110  predicted RND superfamily drug exporter  39.47 
 
 		 711 aa  312  1e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0114  MMPL domain-containing protein  41.58 
 
 		 673 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  30.06 
 
 		 713 aa  301  2e-80  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2220  MMPL domain-containing protein  32.23 
 
 		 743 aa  272  1e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.243308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2374  membrane protein, MmpL family  32.14 
 
 		 743 aa  272  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2958  membrane protein, MmpL family  31.59 
 
 		 743 aa  271  2e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000505534 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2507  membrane protein, MmpL family  32.41 
 
 		 743 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.387064  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0091  MMPL domain protein  34.75 
 
 		 712 aa  271  4e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0263056  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2177  MmpL family membrane protein  32.28 
 
 		 743 aa  270  7e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000358784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2163  MmpL family integral membrane protein  32.28 
 
 		 743 aa  269  1e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.605092  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2442  MmpL family membrane protein  32.6 
 
 		 743 aa  268  2e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.181468  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2243  MmpL family membrane protein  32.14 
 
 		 743 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2407  MmpL family membrane protein  32.14 
 
 		 743 aa  268  2e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.874429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2424  membrane protein, MmpL family  32.18 
 
 		 743 aa  262  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4494  MMPL domain protein  49.24 
 
 		 339 aa  246  6.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  30.14 
 
 		 740 aa  219  2e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  28.36 
 
 		 723 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4493  MMPL domain protein  41.42 
 
 		 358 aa  204  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.617386  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3656  MMPL domain-containing protein  30.95 
 
 		 719 aa  203  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0733435  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  29.99 
 
 		 747 aa  190  7e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  31.8 
 
 		 726 aa  190  8e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2997  hypothetical protein  52.23 
 
 		 777 aa  188  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  30.09 
 
 		 717 aa  155  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2038  MMPL domain-containing protein  31.14 
 
 		 718 aa  153  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0027  MMPL domain protein  39.1 
 
 		 352 aa  146  1e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.232375 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  36.99 
 
 		 974 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1683  MMPL domain-containing protein  26.48 
 
 		 737 aa  144  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.356062 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0113  MMPL domain protein  31.21 
 
 		 724 aa  143  9e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2221  MMPL domain protein  29.8 
 
 		 726 aa  143  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.359869 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  31.01 
 
 		 714 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3990  MMPL domain protein  30.95 
 
 		 741 aa  142  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.891596  normal  0.827301 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  36.12 
 
 		 981 aa  141  4.999999999999999e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1105  conserved hypothetical protein, precursor; putative membrane protein  28.9 
 
 		 737 aa  140  7.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.646697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5128  MMPL domain-containing protein  26.86 
 
 		 740 aa  140  8.999999999999999e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24210  predicted RND superfamily drug exporter  29.29 
 
 		 734 aa  139  1e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0859082  normal  0.0577993 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  35.62 
 
 		 974 aa  139  1e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  39.79 
 
 		 1146 aa  139  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3339  MmpL domain-containing protein  29.91 
 
 		 732 aa  138  4e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0617981 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  28.5 
 
 		 836 aa  137  5e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6213  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.93 
 
 		 736 aa  137  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.509369 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  42.86 
 
 		 1077 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  27.59 
 
 		 704 aa  137  8e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1013  hypothetical protein  28.46 
 
 		 860 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000000218575 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3334  drug exporter-like proteinr of the RND superfamily  28.57 
 
 		 729 aa  134  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.679264  normal  0.254741 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  29.1 
 
 		 842 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5142  MMPL  25.99 
 
 		 772 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1580  hypothetical protein  28.16 
 
 		 869 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000620673 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5231  MMPL domain-containing protein  25.99 
 
 		 772 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.408807  normal  0.610643 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  28.49 
 
 		 740 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5523  MMPL domain-containing protein  25.99 
 
 		 772 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.999727  normal  0.344492 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5232  putative membrane transport protein  28.04 
 
 		 732 aa  132  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.528213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  27.03 
 
 		 743 aa  130  9.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3870  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.94 
 
 		 740 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.507814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0161  hypothetical protein  27.1 
 
 		 934 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.703618 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  24.62 
 
 		 829 aa  128  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  24.62 
 
 		 829 aa  128  3e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  26.18 
 
 		 758 aa  128  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0271  transport protein  35.81 
 
 		 1000 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  26.36 
 
 		 781 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1912  MmpL family protein  27.92 
 
 		 731 aa  126  2e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  27.11 
 
 		 920 aa  125  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>