110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0604 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0604  PKD domain-containing protein  100 
 
 
1290 aa  2633    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0603  PKD domain-containing protein  47.7 
 
 
927 aa  255  4.0000000000000004e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403223  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0602  two component regulator  32.66 
 
 
2491 aa  185  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1522  hypothetical protein  50 
 
 
972 aa  152  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  unclonable  0.000000106004  normal  0.087723 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4790  hypothetical protein  41.07 
 
 
553 aa  134  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000821118  normal  0.489267 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3209  hypothetical protein  38.61 
 
 
2395 aa  97.8  1e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304767  normal  0.127821 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3247  leucine-rich repeat-containing protein  30.71 
 
 
2324 aa  88.2  8e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2058  hypothetical protein  36.67 
 
 
1921 aa  79.7  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  26.32 
 
 
543 aa  80.1  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  35.75 
 
 
1107 aa  70.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2306  leucine-rich repeat-containing protein  28.7 
 
 
863 aa  70.1  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.98495 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2055  leucine-rich protein  25 
 
 
565 aa  68.2  0.0000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805099  normal  0.572158 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  32.05 
 
 
1351 aa  67.4  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32267  predicted protein  24.62 
 
 
640 aa  67  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46346  predicted protein  28.45 
 
 
716 aa  66.2  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0737232  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_39088  predicted protein  26.05 
 
 
685 aa  65.1  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.876501  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4909  Miro domain protein  30.74 
 
 
1015 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.903502 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19830  leucine-rich repeat protein  31.67 
 
 
531 aa  62  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1815  leucine-rich repeat-containing protein  31.84 
 
 
772 aa  61.2  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000180506  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0938  hypothetical protein  26.24 
 
 
1969 aa  60.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3798  small GTP-binding protein  27.62 
 
 
1041 aa  59.3  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0918  internalin-related protein  28.18 
 
 
399 aa  59.3  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.482168 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  29.19 
 
 
482 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1155  xyloglucanase  28.42 
 
 
1288 aa  57  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1158  leucine-rich repeat-containing protein  25.91 
 
 
539 aa  57.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0603774  normal  0.76428 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45913  predicted protein  25.97 
 
 
1012 aa  57.4  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3843  Leucine-rich repeat, ribonuclease inhibitor subtype  28.29 
 
 
474 aa  57  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  25.31 
 
 
354 aa  57.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2449  hypothetical protein  27.86 
 
 
886 aa  56.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0222  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3253  small GTP-binding protein  24.71 
 
 
867 aa  56.2  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67440  adenylate cyclase (ATP pyrophosphate-lyase) (Adenylyl cyclase)  29.24 
 
 
1749 aa  55.8  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_107  predicted protein  30.6 
 
 
601 aa  55.5  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.799153  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1864  leucine-rich protein  26.81 
 
 
1266 aa  54.7  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003060  serine/threonine protein kinase  29.87 
 
 
412 aa  55.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.673161  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49670  predicted protein  22.34 
 
 
454 aa  53.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.151645  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  24.81 
 
 
760 aa  53.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  26.29 
 
 
508 aa  54.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4041  small GTP-binding protein  28.5 
 
 
937 aa  54.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.668162  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3999  small GTP-binding protein  28.5 
 
 
937 aa  53.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19840  leucine-rich repeat protein  27.87 
 
 
284 aa  53.1  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0520  internalin  30.43 
 
 
1070 aa  52.8  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.753967  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0552  internalin  30.43 
 
 
1070 aa  52.8  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.166539  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0319  hypothetical protein  31.09 
 
 
448 aa  52.8  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1379  leucine-rich repeat-containing protein  26.16 
 
 
1052 aa  52.8  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02794  hypothetical protein  32 
 
 
414 aa  52.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_12550  predicted protein  26.9 
 
 
283 aa  52.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0459  internalin protein  30.43 
 
 
1112 aa  52.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.695574  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0607  internalin, putative  27.1 
 
 
1088 aa  52  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0938  hypothetical protein  28.18 
 
 
713 aa  51.6  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.102754  unclonable  0.000027622 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44011  predicted protein  27.02 
 
 
899 aa  51.6  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0173538  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0875  POPC protein  26.83 
 
 
1024 aa  51.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.287457  normal  0.0107238 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1444  internalin, putative  25.69 
 
 
755 aa  51.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.101045  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1220  internalin  25.52 
 
 
765 aa  51.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.359434  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0937  hypothetical protein  30.54 
 
 
757 aa  50.8  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.107315  hitchhiker  0.00034151 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  22.98 
 
 
296 aa  51.2  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0782  leucine-rich repeat-containing protein  24.29 
 
 
535 aa  51.2  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.200041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2223  hypothetical protein  34.69 
 
 
347 aa  51.2  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.173641 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44263  predicted protein  25.56 
 
 
1017 aa  51.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.243046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1419  putative internalin  25.52 
 
 
779 aa  51.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.131072 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1404  hypothetical protein  38.18 
 
 
1231 aa  50.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.868224 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3230  hypothetical protein  28.16 
 
 
718 aa  50.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00921587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1245  NEAr transporter  27.17 
 
 
766 aa  50.4  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_1196  predicted protein  36.36 
 
 
304 aa  50.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.51359  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_14518  predicted protein  27.27 
 
 
279 aa  50.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  32.87 
 
 
307 aa  49.7  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1195  putative leucine rich repeat protein  31.72 
 
 
204 aa  49.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03913  Adenylate cyclasePutative uncharacterized protein (EC 4.6.1.1); [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8NJJ8]  26.23 
 
 
2132 aa  48.9  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03670  adenylate cyclase, putative  24.43 
 
 
1344 aa  48.9  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.338751  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16430  hypothetical protein  26.72 
 
 
643 aa  48.9  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.425088  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1904  hypothetical protein  22.22 
 
 
1498 aa  48.9  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.748697 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1557  hypothetical protein  28.25 
 
 
498 aa  48.9  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000266916 
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_3656  predicted protein  28.51 
 
 
247 aa  48.9  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  25.94 
 
 
760 aa  48.9  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86229  predicted protein  29.75 
 
 
497 aa  48.5  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3007  leucine-rich repeat-containing protein  28.26 
 
 
789 aa  47.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.165879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3049  leucine-rich repeat-containing protein  28.26 
 
 
789 aa  47.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_5174  predicted protein  26.81 
 
 
242 aa  48.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1865  leucine-rich repeat-containing protein  29.63 
 
 
237 aa  47.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.956378  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1222  internalin  24.83 
 
 
772 aa  47.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.347362  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4099  leucine-rich repeat-containing protein  28.71 
 
 
1611 aa  47  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2585  hypothetical protein  26.96 
 
 
692 aa  47.4  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0674734  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1193  internalin-related protein  31.1 
 
 
400 aa  47.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0638484  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_67704  regulatory subunit for the mitotic function of type I protein phosphatase  26.09 
 
 
384 aa  47.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0854  immunoglobulin I-set domain-containing protein  27.98 
 
 
1607 aa  47.8  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4131  serine/threonine protein kinase  26.8 
 
 
445 aa  47.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1485  putative internalin  25.51 
 
 
766 aa  47.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011686  PHATRDRAFT_2593  predicted protein  31.41 
 
 
304 aa  47  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319799  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0588  internalin protein  28.51 
 
 
994 aa  47.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.887348  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5117  Carbohydrate binding family 6  24.83 
 
 
1132 aa  47.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.17685 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  31.46 
 
 
980 aa  46.6  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2056  hypothetical protein  23.03 
 
 
559 aa  46.6  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.809448  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4693  leucine-rich repeat-containing protein  31.88 
 
 
528 aa  47  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_4344  predicted protein  33.33 
 
 
169 aa  46.6  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  24.12 
 
 
1263 aa  46.6  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27807  predicted protein  29.86 
 
 
770 aa  46.2  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.555868 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2184  immunoglobulin I-set domain-containing protein  25.39 
 
 
1507 aa  46.2  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2608  hypothetical protein  37.5 
 
 
197 aa  46.2  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  24.6 
 
 
436 aa  46.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2212  leucine-rich repeat-containing protein  29 
 
 
1481 aa  46.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0837  leucine-rich repeat-containing protein  26.92 
 
 
1085 aa  45.8  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>