More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1280 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1280  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  302  1.0000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0345  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.75 
 
 
156 aa  103  9e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996245  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0383  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  42.76 
 
 
168 aa  99.4  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000492385 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0617  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.53 
 
 
158 aa  99  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.217435 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.3 
 
 
169 aa  96.3  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1097  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.38 
 
 
151 aa  94  6e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.282151  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0567  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.62 
 
 
147 aa  94  7e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1387  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.82 
 
 
175 aa  93.2  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0216  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  49.17 
 
 
163 aa  93.2  1e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0379234 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1548  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  58.97 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00345057  hitchhiker  0.00000000000000294624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0788  putative pilus assembly protein major pilin PilA  65 
 
 
79 aa  91.7  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0173637  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0802  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.13 
 
 
152 aa  90.1  9e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.964553  normal  0.826959 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1442  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  76.27 
 
 
155 aa  89  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.102563  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0651  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  61.04 
 
 
165 aa  88.6  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0015  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.81 
 
 
193 aa  87.8  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.170754  normal  0.192574 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0606  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  65.71 
 
 
156 aa  87.8  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000101189  hitchhiker  0.000000768083 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0210  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.63 
 
 
154 aa  87.4  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103934  normal  0.61486 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1488  hypothetical protein  62.35 
 
 
158 aa  87.4  6e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.109192  normal  0.403243 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0093  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.64 
 
 
169 aa  87  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0563183 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0765  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.49 
 
 
170 aa  87  9e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000473938  hitchhiker  1.49827e-16 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0668  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  61.64 
 
 
155 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000136734 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0096  hypothetical protein  59.46 
 
 
163 aa  86.7  1e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.062594 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0475  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  40.26 
 
 
171 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0204  type IV pilus assembly protein PilE  59.49 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0059  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.49 
 
 
151 aa  85.5  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.230525 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0571  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.53 
 
 
163 aa  85.5  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0613  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  68.42 
 
 
165 aa  85.5  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0934015 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1524  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  63.38 
 
 
159 aa  85.5  2e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000584644  unclonable  2.6975300000000003e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0482  general secretion pathway protein G  39.73 
 
 
171 aa  85.1  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00144077  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1495  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64.79 
 
 
167 aa  85.1  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.70798  normal  0.112729 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1371  hypothetical protein  61.73 
 
 
174 aa  85.1  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0926  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  57.14 
 
 
171 aa  84.7  4e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000619994  hitchhiker  8.71814e-18 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1487  fimbrial protein EcpC precursor  42.95 
 
 
164 aa  84.3  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0651614  normal  0.606044 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0265  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  41.1 
 
 
166 aa  84  7e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.319115  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1436  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  38.1 
 
 
171 aa  83.6  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0780  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  68.33 
 
 
157 aa  84  8e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0057  hypothetical protein  56 
 
 
169 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.266791 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1018  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  61.64 
 
 
161 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1161  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  64 
 
 
157 aa  82.8  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0800  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  43.67 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.346386  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0449  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  60.53 
 
 
167 aa  81.3  0.000000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000146857  hitchhiker  0.0000000193676 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1261  hypothetical protein  55.56 
 
 
168 aa  80.5  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0349  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  57.69 
 
 
179 aa  80.5  0.000000000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875622  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1058  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA-like protein  56.25 
 
 
176 aa  78.6  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.110537  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1421  Type II secretory pathway pseudopilin PulG-like protein  57.89 
 
 
172 aa  78.6  0.00000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0422  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.84 
 
 
163 aa  77.8  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.253002  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0807  hypothetical protein  56 
 
 
182 aa  78.2  0.00000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000505152 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0331  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  59.21 
 
 
172 aa  77.4  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0274  general secretion pathway protein H  69.64 
 
 
174 aa  76.3  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.560285  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0392  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  55.26 
 
 
175 aa  75.5  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000336485  hitchhiker  0.0000000727713 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0340  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  56.41 
 
 
165 aa  75.1  0.0000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0779  hypothetical protein  55.71 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0495  fimbrial protein EcpC precursor  49.43 
 
 
172 aa  72  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.014346  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1096  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  87.18 
 
 
157 aa  70.5  0.000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.292656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0682  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  54.05 
 
 
165 aa  70.1  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0723462  hitchhiker  0.000000000174273 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0681  hypothetical protein  67.35 
 
 
567 aa  70.5  0.000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000227256 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0669  fimbrial protein EcpC precursor  85.37 
 
 
48 aa  70.1  0.00000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185547 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0548  hypothetical protein  64.29 
 
 
169 aa  68.9  0.00000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0260  pilin polypeptide  63.16 
 
 
187 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0376  hypothetical protein  47.56 
 
 
174 aa  67.4  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000272235  hitchhiker  0.0000000000782624 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1230  hypothetical protein  59.65 
 
 
178 aa  67.4  0.00000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3584  fimbrial protein PilA  48.78 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.194411  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  39.6 
 
 
141 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2522  pilin  48.78 
 
 
176 aa  67.4  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0933  hypothetical protein  57.89 
 
 
527 aa  67  0.00000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000356044  hitchhiker  0.000000000476431 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0535  hypothetical protein  56.06 
 
 
634 aa  66.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000025366  normal  0.911782 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0148  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  33.11 
 
 
174 aa  67  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1024  hypothetical protein  41.27 
 
 
162 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0872  general secretion pathway protein H  50.82 
 
 
152 aa  65.1  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.854476  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0612  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  45.98 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3550  Tfp pilus assembly protein PilE  42.42 
 
 
164 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.844187  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1383  type IV pilin PilE  47.54 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.140998  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0692  hypothetical protein  36.5 
 
 
548 aa  63.5  0.0000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000140435  unclonable  7.26108e-19 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1299  Type IV pilus biogenesis protein PilE  52.38 
 
 
128 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.799661 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0526  hypothetical protein  47.83 
 
 
158 aa  63.5  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000137512  normal  0.350549 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  44.44 
 
 
136 aa  62  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  49.18 
 
 
138 aa  62.8  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2301  putative GSPG-related protein  35.92 
 
 
130 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.152629  normal  0.0321295 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  44.44 
 
 
136 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2882  methylation site containing protein  39.74 
 
 
138 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60320  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  46.03 
 
 
141 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000362369 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2275  general secretion pathway protein H  40.51 
 
 
164 aa  61.6  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1107  methylation site containing protein  46.03 
 
 
130 aa  60.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.963603 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0960  hypothetical protein  48.78 
 
 
186 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1164  type IV pilus biogenesis protein PilE  49.15 
 
 
130 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.536283 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  43.59 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0933  hypothetical protein  48.78 
 
 
186 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2949  methylation site containing protein  40 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0811797  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3031  methylation site containing protein  36.89 
 
 
133 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0126  Tfp pilus assembly protein PilE-like  41.67 
 
 
151 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0148502  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1202  type IV pilus biogenesis protein PilE  34.55 
 
 
130 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0676  type IV pilin  39.71 
 
 
144 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.256255  normal  0.685259 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1217  type IV pilus biogenesis protein PilE  35.04 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  41.98 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1062  type IV pilus biogenesis protein PilE  49.15 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1067  methylation site containing protein  44.44 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1857  N-terminal methylation  37.11 
 
 
140 aa  59.7  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.36825 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1507  Tfp pilus assembly protein PilE-like protein  39.77 
 
 
121 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2664  methylation  46.77 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1129  type IV pilus biogenesis protein PilE  49.15 
 
 
130 aa  59.7  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>