More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_0601 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  93.74 
 
 		 1426 aa  2384    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  83.63 
 
 		 1200 aa  1965    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  77.19 
 
 		 1411 aa  1986    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  76.93 
 
 		 1377 aa  1977    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  76.95 
 
 		 1411 aa  1979    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  75.49 
 
 		 682 aa  1006    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  76.61 
 
 		 1397 aa  1972    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  93.81 
 
 		 1426 aa  2388    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  73.5 
 
 		 1415 aa  2055    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1639  protein rhsD, truncation  92.47 
 
 		 1405 aa  2375    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  67.68 
 
 		 1405 aa  1754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1115  protein RhsA  68.95 
 
 		 1388 aa  1766    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  93.97 
 
 		 1429 aa  2417    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  75.26 
 
 		 1365 aa  1919    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  93.74 
 
 		 1426 aa  2384    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  75.63 
 
 		 1409 aa  1964    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  84.23 
 
 		 1216 aa  1998    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  76.87 
 
 		 1411 aa  1985    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  93.98 
 
 		 1268 aa  2385    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  76.61 
 
 		 1397 aa  1971    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  68.12 
 
 		 586 aa  769    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  76.85 
 
 		 1397 aa  1980    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  75.83 
 
 		 1410 aa  1959    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  76.85 
 
 		 1397 aa  1978    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  76.13 
 
 		 1308 aa  1969    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  75.71 
 
 		 1388 aa  1967    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  76.61 
 
 		 1394 aa  1974    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  100 
 
 		 1398 aa  2862    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2065  protein rhsD  96.97 
 
 		 1400 aa  2486    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.595023 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4081  YD repeat-containing protein  75.3 
 
 		 713 aa  759    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  76.71 
 
 		 1411 aa  1978    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  77.19 
 
 		 1411 aa  1986    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  82.76 
 
 		 1251 aa  2130    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  81.26 
 
 		 1199 aa  1764    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  76.69 
 
 		 1377 aa  1971    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  71.03 
 
 		 1417 aa  1929    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  76.31 
 
 		 1399 aa  1963    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3712  YD repeat-containing protein  37.87 
 
 		 1490 aa  730    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.913964 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  76.95 
 
 		 1411 aa  1986    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2521  YD repeat-containing protein  34.63 
 
 		 1509 aa  633  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0299  YD repeat-containing protein  34.45 
 
 		 1525 aa  632  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4482  YD repeat-containing protein  34.1 
 
 		 1528 aa  622  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  75.52 
 
 		 554 aa  610  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  79.43 
 
 		 502 aa  580  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  77.54 
 
 		 477 aa  537  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  76.92 
 
 		 477 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2934  RHS protein  77.54 
 
 		 477 aa  536  1e-150  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.375887  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  76.92 
 
 		 477 aa  533  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  76.92 
 
 		 477 aa  533  1e-150  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  77.23 
 
 		 477 aa  535  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00450  conserved protein, rhs-like protein  97.87 
 
 		 236 aa  489  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3111  RHS protein  97.87 
 
 		 236 aa  489  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.791839  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00455  hypothetical protein  97.87 
 
 		 236 aa  489  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0538  Rhs domain-containing protein  93.62 
 
 		 236 aa  474  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3751  YD repeat-containing protein  29.9 
 
 		 1677 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.457542 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3959  hypothetical protein  32.78 
 
 		 1319 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2049  YD repeat-containing protein  29.39 
 
 		 1770 aa  432  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29400  hypothetical protein  32.3 
 
 		 1317 aa  428  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4283  YD repeat-containing protein  35.14 
 
 		 1679 aa  373  1e-101  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  33.52 
 
 		 1791 aa  359  1.9999999999999998e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0353  YD repeat-containing protein  29.7 
 
 		 1547 aa  318  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4797  rhs-related transmembrane protein, YD repeat protein  29.5 
 
 		 1626 aa  308  4.0000000000000004e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1550 aa  307  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3481  YD repeat-containing protein  28.51 
 
 		 1586 aa  306  1.0000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130925  normal  0.269624 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3480  YD repeat-containing protein  29.04 
 
 		 1620 aa  305  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.219558 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3345  YD repeat-containing protein  26.9 
 
 		 1583 aa  305  5.000000000000001e-81  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.370886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3788  YD repeat-containing protein  28.86 
 
 		 1554 aa  300  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0253716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  28.18 
 
 		 1520 aa  296  2e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0499  YD repeat-containing protein  26.99 
 
 		 1604 aa  296  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  28.5 
 
 		 1609 aa  293  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0460  YD repeat-containing protein  27.86 
 
 		 1551 aa  288  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.61036  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0435  YD repeat-containing protein  27.96 
 
 		 1527 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763231 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  29.36 
 
 		 1379 aa  271  8.999999999999999e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3178  type VI secretion system Vgr family protein  28.76 
 
 		 1981 aa  269  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.568675 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3550  Rhs family protein  28.08 
 
 		 1560 aa  268  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.955949 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  29.73 
 
 		 1429 aa  263  3e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3802  Rhs family protein  71.26 
 
 		 314 aa  258  6e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276743  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4094  RHS domain-containing protein  71.26 
 
 		 314 aa  258  6e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.700312  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2434  RHS protein  27.09 
 
 		 1348 aa  257  1.0000000000000001e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03450  predicted Rhs-family protein  70.66 
 
 		 314 aa  256  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03401  hypothetical protein  70.66 
 
 		 233 aa  256  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  71.52 
 
 		 312 aa  254  9.000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0248  YD repeat protein  28.35 
 
 		 1434 aa  253  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116954  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3108  rhs-related protein  29.81 
 
 		 1385 aa  231  6e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.93941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2740  YD repeat-containing protein  26.44 
 
 		 1602 aa  229  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2081  YD repeat protein  28 
 
 		 1528 aa  227  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.359432  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4085  RHS family protein, putative  26.93 
 
 		 1530 aa  226  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.572678  normal  0.0133781 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4805  YD repeat-containing protein  28.81 
 
 		 1229 aa  224  9e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.739306  normal  0.809733 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0698  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  24.6 
 
 		 1492 aa  222  3e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.632091  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2615  YD repeat-containing protein  28.1 
 
 		 1400 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.160506 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  29.8 
 
 		 1362 aa  218  5e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2330  RHS protein  29.19 
 
 		 1573 aa  216  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.361613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0766  YD repeat-containing protein  24.15 
 
 		 1466 aa  214  9e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.668703  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05482  putative RHS-related transmembrane protein  28.34 
 
 		 1517 aa  213  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.489685  normal  0.876645 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6210  RHS protein  26.6 
 
 		 1421 aa  213  2e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0158165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1171  rhsD protein  27.15 
 
 		 1543 aa  213  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2520  YD repeat-containing protein  26.75 
 
 		 1411 aa  213  2e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0521301  normal  0.492732 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2806  YD repeat-/RHS repeat-containing protein  26.88 
 
 		 1552 aa  212  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3692  RHS/YD repeat-containing protein  28.18 
 
 		 1419 aa  208  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.333413  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0331  Rhs family protein  30.95 
 
 		 1568 aa  204  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>