221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0269 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0269  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 267 aa  533  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2369  TPR repeat-containing protein  68.3 
 
 		 271 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.551588 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3645  TPR repeat-containing protein  64.66 
 
 		 266 aa  358  7e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0132  TPR repeat-containing protein  38.87 
 
 		 267 aa  186  4e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0614  Tetratricopeptide domain protein  28.4 
 
 		 271 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924993 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1630  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 		 279 aa  90.5  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.374072  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1213  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 277 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3006  response regulator receiver domain-containing protein  28.48 
 
 		 451 aa  63.9  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.883991  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0439  Tetratricopeptide domain protein  23.19 
 
 		 272 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0769  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.11 
 
 		 265 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2717  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0212645  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  26.9 
 
 		 486 aa  58.2  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5584  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  22.99 
 
 		 681 aa  56.2  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1667  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00162147  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1136  Tetratricopeptide domain protein  30.08 
 
 		 302 aa  55.5  0.0000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.62 
 
 		 565 aa  55.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  26.44 
 
 		 797 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0755  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 662 aa  53.9  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.466717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 		 1061 aa  53.9  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2082  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 		 285 aa  53.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.468913  normal  0.0257738 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2476  TPR domain-containing protein  30.25 
 
 		 566 aa  53.5  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.834275  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02270  peroxisome targeting sequence binding protein, putative  30.72 
 
 		 799 aa  53.1  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.655025  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2994  hypothetical protein  29.17 
 
 		 417 aa  53.1  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.542641  normal  0.0105744 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  26.15 
 
 		 887 aa  52.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27 
 
 		 397 aa  51.6  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  30.1 
 
 		 1276 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 		 660 aa  51.6  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  28.87 
 
 		 878 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 3172 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  28.57 
 
 		 676 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 3035 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1202  TPR repeat-containing protein  29.29 
 
 		 632 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0737  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 		 229 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689615  normal  0.77842 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  35.24 
 
 		 465 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  27.87 
 
 		 315 aa  49.7  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  24 
 
 		 614 aa  49.7  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.87 
 
 		 2240 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1106  TPR repeat-containing protein  31.07 
 
 		 605 aa  49.7  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000356395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  28.57 
 
 		 832 aa  49.7  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  36.96 
 
 		 688 aa  49.3  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 		 708 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0532  tetratricopeptide TPR_4  31.2 
 
 		 2679 aa  48.9  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2073  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.68 
 
 		 214 aa  48.9  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0814777  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 4489 aa  48.9  0.00008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  25.95 
 
 		 623 aa  48.9  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  36.49 
 
 		 1406 aa  48.9  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.92 
 
 		 1034 aa  48.9  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0934  Tetratricopeptide domain protein  28.42 
 
 		 301 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0659  TPR repeat-containing protein  32.33 
 
 		 2651 aa  48.9  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2904  Tetratricopeptide domain protein  31.71 
 
 		 261 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  24.23 
 
 		 1067 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  26.67 
 
 		 3301 aa  48.1  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.79 
 
 		 810 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  22.63 
 
 		 1486 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0239  TPR repeat-containing protein  30.68 
 
 		 326 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  25 
 
 		 816 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2790  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.62 
 
 		 305 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  30.56 
 
 		 733 aa  48.5  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1408  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 		 285 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.320604  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 543 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1823  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  28.24 
 
 		 566 aa  47.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0687  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 2262 aa  47.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00419541 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1949  putative PAS/PAC sensor protein  23.57 
 
 		 461 aa  47.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.724461 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2326  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 254 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3167  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.9 
 
 		 294 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0391783 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0991  TPR repeat-containing protein  27.96 
 
 		 357 aa  47  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161827  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  23.26 
 
 		 927 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2173  TPR repeat-containing protein  27.52 
 
 		 421 aa  47  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 505 aa  47  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  31.52 
 
 		 742 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3719  tetratricopeptide TPR_2  31.25 
 
 		 267 aa  47  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.961452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 2262 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  24.81 
 
 		 265 aa  47  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  28.43 
 
 		 795 aa  46.6  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.23 
 
 		 1979 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5686  TPR domain-containing protein  30.85 
 
 		 279 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.471833  normal  0.415957 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3565  hypothetical protein  34.15 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.576229 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 1005 aa  46.6  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.24 
 
 		 632 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  28.26 
 
 		 968 aa  47  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4206  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.53 
 
 		 264 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.356132  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3581  tetratricopeptide TPR_4  29.91 
 
 		 272 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211804  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.73 
 
 		 3145 aa  46.2  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  27.37 
 
 		 1240 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0431  response regulator receiver  32.53 
 
 		 451 aa  46.2  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  25.62 
 
 		 1007 aa  45.8  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  26.28 
 
 		 1154 aa  46.2  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2362  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 		 256 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  23.13 
 
 		 602 aa  45.8  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0657  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.96 
 
 		 453 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000265417  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  22.46 
 
 		 1737 aa  45.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0637  Tetratricopeptide domain-containing protein  34.86 
 
 		 922 aa  45.8  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.694536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1669  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.53 
 
 		 476 aa  45.8  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2293  hypothetical protein  24 
 
 		 631 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0853546 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  24.43 
 
 		 267 aa  44.7  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2266  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 622 aa  45.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  23.37 
 
 		 748 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  22.46 
 
 		 820 aa  45.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>