15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0614 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0614  Tetratricopeptide domain protein  100 
 
 		 271 aa  543  1e-154  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924993 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1213  TPR repeat-containing protein  55.76 
 
 		 277 aa  293  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.576594 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1630  TPR repeat-containing protein  45.52 
 
 		 279 aa  237  2e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.374072  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0439  Tetratricopeptide domain protein  37.87 
 
 		 272 aa  163  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0269  TPR repeat-containing protein  28.4 
 
 		 267 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2369  TPR repeat-containing protein  27.03 
 
 		 271 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.551588 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3645  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1987  TPR domain-containing protein  40.66 
 
 		 864 aa  55.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0035  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 		 402 aa  50.8  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.446314  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.02 
 
 		 465 aa  45.8  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1144  stage V sporulation protein K  26.83 
 
 		 1930 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1078  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 		 423 aa  44.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.327406  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2688  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.78 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2176  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 116 aa  42.7  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2215  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 237 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.728261 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>