113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2176 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2176  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 116 aa  230  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1887  TPR repeat-containing protein  99.14 
 
 		 116 aa  228  2e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 750 aa  53.1  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02750  cytoplasm protein, putative  30.97 
 
 		 338 aa  49.7  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 258 aa  49.7  0.00001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 226 aa  48.9  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  30.91 
 
 		 576 aa  48.9  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  39.71 
 
 		 927 aa  48.1  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  43.55 
 
 		 243 aa  48.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 3035 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2441  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 		 687 aa  48.9  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0004983  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  39.44 
 
 		 602 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3107  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 219 aa  47.8  0.00006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 573 aa  47.4  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0163  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 		 356 aa  47.4  0.00007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00233758  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  38.1 
 
 		 1694 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3049  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 		 591 aa  47  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000157665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  29.2 
 
 		 1979 aa  47  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2318  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 245 aa  46.2  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  26.04 
 
 		 467 aa  46.2  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  31.53 
 
 		 828 aa  46.2  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  30.85 
 
 		 1297 aa  45.4  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 3145 aa  45.1  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  34.23 
 
 		 543 aa  45.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0192  TPR repeat-containing protein  40 
 
 		 349 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.906422  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  26.32 
 
 		 4489 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1603  TPR repeat-containing protein  34.83 
 
 		 804 aa  44.7  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.49 
 
 		 4079 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2421  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.33 
 
 		 199 aa  45.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  32.63 
 
 		 589 aa  44.7  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1345  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 332 aa  44.3  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0354  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 		 684 aa  44.3  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.431996  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0982  TPR domain-containing protein  33.67 
 
 		 750 aa  44.3  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.682285 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1241  hypothetical protein  28.26 
 
 		 575 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0044833  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3507  protein prenyltransferase, alpha subunit  33.33 
 
 		 1007 aa  43.9  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.223985 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_25206  predicted protein  31.58 
 
 		 477 aa  43.9  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00400677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4782  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36.67 
 
 		 746 aa  43.5  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.20458 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0235  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 554 aa  43.5  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  30.68 
 
 		 863 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0905  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.62 
 
 		 253 aa  43.9  0.0008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.341431  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 634 aa  43.5  0.0009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 		 1421 aa  43.5  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.79 
 
 		 707 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  26.85 
 
 		 198 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0900  TPR repeat-containing protein  27.84 
 
 		 172 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00123871  normal  0.293983 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0629  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 		 1049 aa  43.5  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  33.33 
 
 		 745 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1476  TPR repeat-containing protein  41.67 
 
 		 226 aa  43.1  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.818932  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  30.77 
 
 		 708 aa  43.5  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2761  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 468 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.594013  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4242  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 219 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1641  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.28 
 
 		 292 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1257  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.25 
 
 		 237 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.15 
 
 		 293 aa  43.5  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1669  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.57 
 
 		 476 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.42993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  22.52 
 
 		 465 aa  43.5  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4138  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 219 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 1827 aa  42.4  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  26.37 
 
 		 635 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0225  TPR repeat-containing protein  29.47 
 
 		 414 aa  42  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 3560 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.07 
 
 		 758 aa  42.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0110  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.43 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.563747 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2073  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.33 
 
 		 214 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0814777  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 466 aa  42.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.67 
 
 		 572 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  31.46 
 
 		 512 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0614  Tetratricopeptide domain protein  25.23 
 
 		 271 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00924993 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2496  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.45 
 
 		 222 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  35.21 
 
 		 534 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10281  serine/threonine protein phosphatase PPT1 (AFU_orthologue; AFUA_5G06700)  30.23 
 
 		 497 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  24.78 
 
 		 398 aa  42  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0229  tetratricopeptide TPR_3  27.36 
 
 		 689 aa  42  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0003  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 466 aa  41.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  37.88 
 
 		 957 aa  41.6  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  31.37 
 
 		 573 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1796  TPR repeat-containing protein  32.1 
 
 		 352 aa  42  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  27.78 
 
 		 730 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.67 
 
 		 572 aa  42  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4478  TPR domain-containing protein  27.91 
 
 		 219 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.404717  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 274 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0812  tetratricopeptide TPR_2  29.41 
 
 		 452 aa  41.6  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.159009  normal  0.340374 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00751  hypothetical protein  29.17 
 
 		 205 aa  41.2  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.499954 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  35.29 
 
 		 1056 aa  41.2  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1401  glycosyl transferase family protein  26.8 
 
 		 798 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_10519  predicted protein  23.66 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4845  putative signal transduction histidine kinase  37.36 
 
 		 568 aa  41.2  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.415309  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0930  TPR repeat-containing protein  26.79 
 
 		 329 aa  41.6  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.84 
 
 		 265 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4528  TPR domain protein  27.91 
 
 		 219 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000798973  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4515  TPR domain protein  27.91 
 
 		 219 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0721  TPR domain protein  27.91 
 
 		 219 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2400  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 520 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.38799 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4290  TPR domain-containing protein  27.91 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4127  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0499017  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  30.34 
 
 		 1138 aa  41.2  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4624  TPR domain-containing protein  27.91 
 
 		 219 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.472019  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1509  tetratricopeptide TPR_2  27.16 
 
 		 341 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1383  tetratricopeptide TPR_2  31.88 
 
 		 385 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1121  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 209 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.685815  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>