27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1383 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1383  tetratricopeptide TPR_2  100 
 
 		 385 aa  776    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1448  tetratricopeptide TPR_2  31.12 
 
 		 374 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0475  TPR repeat-containing protein  26.74 
 
 		 469 aa  105  1e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000269672  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3692  tetratricopeptide domain-containing protein  37.36 
 
 		 239 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000893452  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  39.73 
 
 		 201 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2552  putative lipoprotein  27 
 
 		 242 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0097  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.76 
 
 		 329 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000120969  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2419  TPR repeat-containing protein  25.43 
 
 		 792 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0484292  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2761  TPR repeat-containing protein  37.14 
 
 		 468 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.594013  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0729  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 255 aa  45.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.032974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2791  TPR repeat-containing protein  37.1 
 
 		 243 aa  45.4  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.185879 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2064  hypothetical protein  30 
 
 		 99 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1129  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 473 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1313  TPR repeat-containing protein  24.51 
 
 		 473 aa  44.3  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.010382  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002614  lipoprotein nlpI precursor  31.88 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.490991  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0813  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 262 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0133975  normal  0.688577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0877  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 262 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000691126  normal  0.439363 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0786  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 262 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000180184  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0846  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 262 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00125289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0498  hypothetical protein  30.34 
 
 		 368 aa  43.9  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0909  tol-pal system protein YbgF  28.57 
 
 		 262 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000119726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0603  lipoprotein NlpI  24.3 
 
 		 327 aa  43.5  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.297207  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03392  lipoprotein NlpI  31.88 
 
 		 307 aa  43.5  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  21.03 
 
 		 236 aa  43.1  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2937  tetratricopeptide TPR_2  24.55 
 
 		 251 aa  43.1  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0022329  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1637  TPR repeat-containing molluscan rhodopsin  29.49 
 
 		 488 aa  42.7  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1693  hypothetical protein  29.49 
 
 		 488 aa  42.7  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>