39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2064 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2064  hypothetical protein  100 
 
 
99 aa  204  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2668  TPR repeat-containing protein  42.42 
 
 
206 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000911518  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 
688 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1755  TPR repeat-containing protein  38.71 
 
 
647 aa  47.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0455441 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1318  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
534 aa  47.4  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000693072  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0180  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 
178 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.684496 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1855  sulfotransferase  39.06 
 
 
725 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0235  protein of unknown function DUF181  33.33 
 
 
572 aa  44.3  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 
1450 aa  44.3  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21321  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  33.87 
 
 
185 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.285628  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1261  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 
185 aa  43.5  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0414  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.82 
 
 
587 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1383  tetratricopeptide TPR_2  37.74 
 
 
385 aa  43.9  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4306  TPR repeat-containing protein  36.21 
 
 
174 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 
3035 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17891  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  28.92 
 
 
185 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0230228  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0681  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 
549 aa  41.6  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.607702  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3320  TPR repeat-containing protein  37.93 
 
 
180 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3467  Flp pilus assembly protein TadD  32.79 
 
 
535 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 
667 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1274  TPR repeat-containing protein  39.66 
 
 
175 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.891871 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0808  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
486 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224492  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00551  putative photosystem I assembly related protein Ycf37  28.05 
 
 
187 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1618  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
217 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366972 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  31.82 
 
 
878 aa  40.8  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1609  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 
194 aa  40.8  0.005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.994867  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  40 
 
 
715 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1782  TPR repeat-containing protein  38.1 
 
 
542 aa  41.2  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300078  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0917  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 
566 aa  40.8  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00563549 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1512  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
550 aa  40.8  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0206479  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  43.4 
 
 
201 aa  40.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0911  tetratricopeptide TPR_4  30.56 
 
 
875 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.379762  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3450  TPR repeat-containing protein  32.76 
 
 
174 aa  40.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0840  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.04 
 
 
199 aa  40.4  0.008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0595  TPR repeat-containing protein  38.33 
 
 
795 aa  40.4  0.008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 
1094 aa  40  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  33.87 
 
 
169 aa  40  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2261  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.93 
 
 
251 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463811 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2675  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 
203 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.679716  normal  0.152424 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>