289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0808 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0808  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 486 aa  1002    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224492  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3980  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.77 
 
 		 1023 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4174  serine/threonine protein kinase  26.77 
 
 		 990 aa  74.7  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.957673  normal  0.29957 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 		 2240 aa  72.4  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  26.25 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  27.43 
 
 		 573 aa  62.4  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.09 
 
 		 810 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  29.46 
 
 		 1154 aa  59.3  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  27.74 
 
 		 579 aa  59.7  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2187  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 571 aa  58.2  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  26.35 
 
 		 562 aa  57.8  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  25.31 
 
 		 4079 aa  57.4  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2423  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.99 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  26.34 
 
 		 448 aa  57  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0949  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 1121 aa  56.6  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849269  normal  0.0980091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.99 
 
 		 878 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0913  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 280 aa  56.6  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.249159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  27.67 
 
 		 887 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25 
 
 		 632 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 572 aa  55.1  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.3 
 
 		 397 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  27.88 
 
 		 573 aa  54.7  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20870  Tetratricopeptide repeat (TPR) protein  24.81 
 
 		 539 aa  55.1  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2418  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 		 827 aa  55.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  25.32 
 
 		 1486 aa  54.7  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 3560 aa  53.9  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  24.22 
 
 		 561 aa  53.9  0.000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 3035 aa  53.9  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 3145 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  25.1 
 
 		 1737 aa  53.9  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0531  TPR repeat-containing protein  28.69 
 
 		 287 aa  53.9  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.259397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0990  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.48 
 
 		 410 aa  53.9  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113297  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  26.42 
 
 		 575 aa  53.5  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  23.36 
 
 		 3172 aa  53.5  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.97 
 
 		 557 aa  53.5  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 585 aa  53.5  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  24.03 
 
 		 718 aa  53.5  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2224  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  36.08 
 
 		 884 aa  53.5  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 927 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4393  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  28.7 
 
 		 1019 aa  53.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.618951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1384  TPR repeat-containing protein  24.19 
 
 		 870 aa  53.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000149301  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.89 
 
 		 543 aa  53.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  21.11 
 
 		 391 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 968 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  25.62 
 
 		 677 aa  52.4  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0817  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 594 aa  52.4  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.02661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 		 573 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  27.04 
 
 		 573 aa  51.6  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  25.62 
 
 		 619 aa  51.6  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  25.69 
 
 		 733 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  24.37 
 
 		 409 aa  52  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0911  TPR repeat-containing protein  25.36 
 
 		 515 aa  52  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.19098  hitchhiker  0.00518464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1518  TPR repeat-containing protein  22.86 
 
 		 597 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00971618 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  23.6 
 
 		 561 aa  51.6  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  26.52 
 
 		 448 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1144  stage V sporulation protein K  24.39 
 
 		 1930 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  23.53 
 
 		 560 aa  50.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3815  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 399 aa  50.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3199  TPR repeat-containing protein  26.46 
 
 		 565 aa  50.8  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.714786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.15 
 
 		 581 aa  50.4  0.00007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2318  tetratricopeptide protein  24.41 
 
 		 573 aa  50.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.59 
 
 		 563 aa  50.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0738  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 323 aa  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00630781  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  25.25 
 
 		 556 aa  50.1  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0555  tetratricopeptide region  23.46 
 
 		 560 aa  50.1  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.45789  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  23.86 
 
 		 614 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  25.76 
 
 		 575 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  23.86 
 
 		 626 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  22.1 
 
 		 739 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  23.86 
 
 		 626 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  24.63 
 
 		 425 aa  49.7  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  23.05 
 
 		 505 aa  49.3  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  25.79 
 
 		 713 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  23.86 
 
 		 614 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 617 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0912  TPR repeat-containing protein  28.36 
 
 		 748 aa  49.7  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.795031  hitchhiker  0.00626987 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  21.62 
 
 		 583 aa  49.7  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 614 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  23.86 
 
 		 614 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  32.26 
 
 		 2401 aa  48.9  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5381  methyltransferase type 11  29.91 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.85 
 
 		 265 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 789 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.62 
 
 		 610 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  24.12 
 
 		 739 aa  49.3  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 566 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1062  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 503 aa  49.3  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0498001 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  25.62 
 
 		 610 aa  49.3  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 599 aa  48.9  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 614 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4236  tetratricopeptide TPR_2  26.9 
 
 		 824 aa  48.9  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.707034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 955 aa  49.3  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 722 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1011  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 		 800 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.926102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  25.48 
 
 		 584 aa  48.5  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  25.89 
 
 		 402 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 617 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11910  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 394 aa  48.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000944223  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1356  beta-lactamase domain-containing protein  25.42 
 
 		 833 aa  48.5  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  24.39 
 
 		 593 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>