More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4845 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4845  putative signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 568 aa  1140    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.415309  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4858  putative signal transduction histidine kinase  56.08 
 
 		 584 aa  618  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0030  putative signal transduction histidine kinase  36.84 
 
 		 572 aa  314  2.9999999999999996e-84  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.11045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0031  putative signal transduction histidine kinase  35.17 
 
 		 589 aa  282  1e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0655535  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0032  TPR repeat-containing protein  34.46 
 
 		 592 aa  261  3e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00127267  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08896  putative transmembrane protein  27.64 
 
 		 680 aa  148  3e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0793  histidine kinase  23.76 
 
 		 673 aa  124  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2085  putative signal transduction histidine kinase  25.22 
 
 		 680 aa  121  3.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0890651  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2388  histidine kinase  23.82 
 
 		 653 aa  80.9  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255891  normal  0.393123 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4503  histidine kinase  24.17 
 
 		 643 aa  74.3  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.604782 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6528  histidine kinase  26.8 
 
 		 592 aa  73.9  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4552  histidine kinase  25.36 
 
 		 738 aa  73.2  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00113459  normal  0.0314449 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2111  ATP-binding region ATPase domain protein  22.48 
 
 		 645 aa  70.9  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.184163  normal  0.230765 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5260  ComP, putative  27.36 
 
 		 772 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2127  sensor histidine kinase  20.24 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.289713  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1697  histidine kinase  25 
 
 		 664 aa  64.3  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.182651 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1902  histidine kinase  22.22 
 
 		 457 aa  63.9  0.000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.723867  normal  0.134322 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  24.06 
 
 		 782 aa  63.9  0.000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0289  transmembrane sensor kinase vsrA transcription regulator protein  28.8 
 
 		 474 aa  63.5  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.79349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3729  TPR-related region  29.25 
 
 		 340 aa  62.8  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0045227  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3614  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  20.49 
 
 		 298 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.753486  normal  0.27992 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2961  ATP-binding region ATPase domain protein  24.05 
 
 		 645 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.10084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4114  Signal transduction histidine kinase-like protein  21.32 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0990468  normal  0.0733806 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0213  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 795 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0443  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.59 
 
 		 795 aa  61.2  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.351986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2487  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.12 
 
 		 412 aa  60.8  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4277  histidine kinase  26.2 
 
 		 659 aa  60.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.186124 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3044  Sensor DegS domain protein  25.13 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000367044  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01475  histidine kinase sensor protein  25.55 
 
 		 668 aa  60.5  0.00000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.399099  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  22.16 
 
 		 797 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.79 
 
 		 1648 aa  60.5  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3248  histidine kinase  24.87 
 
 		 403 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.298805  normal  0.646005 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1145  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.894172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0939  histidine kinase  26.57 
 
 		 363 aa  59.3  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 1168 aa  59.3  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2136  histidine kinase  24.08 
 
 		 638 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.204065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1290  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 343 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38910  putative sensor kinase  26.83 
 
 		 216 aa  58.9  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2107  histidine kinase  26.54 
 
 		 379 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  23.04 
 
 		 571 aa  58.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0357  sensor histidine kinase  23.81 
 
 		 459 aa  57.8  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1006  histidine kinase  26.14 
 
 		 967 aa  57.8  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0092  histidine kinase  26.83 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0973  putative signal transduction histidine kinase  21.14 
 
 		 592 aa  57.8  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0709163  normal  0.0408636 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1894  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 546 aa  57.8  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.640259  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0448  putative signal transduction histidine kinase  22.86 
 
 		 615 aa  57.4  0.0000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.844769  normal  0.742785 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2171  histidine kinase  26.67 
 
 		 594 aa  57.4  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3308  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 718 aa  57.4  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.128236  hitchhiker  0.000709516 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4297  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 		 347 aa  57  0.0000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.330978  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  22.99 
 
 		 462 aa  56.2  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0711  histidine kinase  24.75 
 
 		 337 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4109  histidine kinase  28.42 
 
 		 439 aa  56.6  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0607  tetratricopeptide TPR_2  31.29 
 
 		 957 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.21285 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  25.81 
 
 		 799 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1345  histidine kinase  23.66 
 
 		 338 aa  56.6  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000383255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4131  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  24.02 
 
 		 401 aa  56.6  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.771261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  21 
 
 		 345 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 513 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.4 
 
 		 748 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2294  histidine kinase  28.72 
 
 		 381 aa  56.2  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.02124  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4858  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  19.92 
 
 		 382 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.935263  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1092  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.11 
 
 		 493 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.614695 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1098  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 		 398 aa  55.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4486  GAF sensor signal transduction histidine kinase  22.55 
 
 		 582 aa  56.2  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  24.88 
 
 		 391 aa  56.2  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 799 aa  55.5  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 		 594 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2542  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  23.71 
 
 		 476 aa  55.1  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0866412  normal  0.0241376 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 		 517 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3087  PAS sensor signal transduction histidine kinase  22.77 
 
 		 312 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.230742  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0763  sensor histidine kinase  26.94 
 
 		 763 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0673199  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5256  histidine kinase  23.85 
 
 		 1063 aa  55.1  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.015523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1863  putative PAS/PAC sensor protein  29.27 
 
 		 547 aa  54.7  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  23.71 
 
 		 961 aa  54.3  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  21.88 
 
 		 397 aa  54.7  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6490  ATP-binding region ATPase domain protein  26.11 
 
 		 636 aa  54.3  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0142  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.6 
 
 		 485 aa  54.3  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.843077 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2086  GAF sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 		 372 aa  54.3  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0443237  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0442  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.29 
 
 		 485 aa  54.3  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.12569  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0150  histidine kinase  25.6 
 
 		 485 aa  53.9  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1524  Signal transduction histidine kinase-like protein  23.08 
 
 		 370 aa  54.3  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.750952  normal  0.0186176 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.06 
 
 		 384 aa  53.9  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 		 594 aa  53.9  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0696  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 790 aa  53.9  0.000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 		 456 aa  53.9  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0768  TPR repeat-containing protein  32.62 
 
 		 258 aa  53.9  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.638517  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0321  sensor histidine kinase, putative  25.49 
 
 		 339 aa  53.9  0.000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  28.42 
 
 		 1809 aa  53.9  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4793  cyclic nucleotide-binding protein  26.8 
 
 		 795 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2344  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  22.54 
 
 		 480 aa  53.9  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.165919 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3079  sensor histidine kinase  25.64 
 
 		 372 aa  53.9  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000507367 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 		 421 aa  53.5  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0754  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 384 aa  53.5  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.961024  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0440  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 		 795 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6579  Histidine kinase  23.15 
 
 		 689 aa  53.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.218867  normal  0.148163 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6402  putative signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 271 aa  53.5  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.274276 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1236  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 		 692 aa  53.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2527  histidine kinase  21.46 
 
 		 247 aa  53.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.56527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0614  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  24.75 
 
 		 583 aa  53.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.797988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>