159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1355 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1355  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  967    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  33.77 
 
 		 4334 aa  85.1  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  32.34 
 
 		 2954 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1242  Hemolysin-type calcium-binding region  31.68 
 
 		 1400 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  28.38 
 
 		 2667 aa  73.2  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  30.43 
 
 		 946 aa  72  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  32.62 
 
 		 3954 aa  70.9  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.63 
 
 		 1236 aa  67.4  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1623  hypothetical protein  31.19 
 
 		 613 aa  67.4  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.54291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1871  Hemolysin-type calcium-binding region  35.22 
 
 		 1855 aa  67  0.0000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0127507  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1355  hemolysin-type calcium-binding region  26.74 
 
 		 623 aa  67  0.0000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2034  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  30.43 
 
 		 1363 aa  66.6  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  0.277467 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  30.38 
 
 		 589 aa  66.6  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  27.33 
 
 		 824 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  32.38 
 
 		 1164 aa  65.1  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4192  hemolysin-type calcium-binding region  30.08 
 
 		 1287 aa  64.7  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.055815  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  32.11 
 
 		 595 aa  64.3  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  36.59 
 
 		 3619 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  28.47 
 
 		 742 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  30.06 
 
 		 1279 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4644  Allergen V5/Tpx-1 related  27.32 
 
 		 833 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.738369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2502  Hemolysin-type calcium-binding region  34.43 
 
 		 361 aa  60.8  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.263018  normal  0.592505 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2775  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.256809  normal  0.811903 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  32.42 
 
 		 1895 aa  60.1  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3374  hemolysin-type calcium-binding region  32.77 
 
 		 491 aa  59.3  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.337821 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  31.73 
 
 		 1534 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4070  hemolysin-type calcium-binding region  32.07 
 
 		 385 aa  59.7  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1247  Hemolysin-type calcium-binding region  28.57 
 
 		 965 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  30.77 
 
 		 518 aa  60.1  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1113  hemolysin-type calcium-binding region; RTX toxin  30.61 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  32.32 
 
 		 795 aa  58.2  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1981  hemolysin-type calcium-binding region  32.49 
 
 		 734 aa  57.8  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  33.99 
 
 		 982 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4004  hemolysin-type calcium-binding region  33.9 
 
 		 424 aa  58.2  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  39.47 
 
 		 3619 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1287  VCBS  30.93 
 
 		 610 aa  57  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.535504  normal  0.448224 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  29.49 
 
 		 2145 aa  57  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  34.93 
 
 		 2105 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1834  RTX toxins and related Ca2+-binding proteins-like  34.55 
 
 		 867 aa  57  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.738226 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1504  cadherin  36.11 
 
 		 1421 aa  56.6  0.0000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0750801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3467  hemolysin-type calcium-binding region  32.93 
 
 		 1175 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.29 
 
 		 3427 aa  56.6  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.78 
 
 		 1963 aa  56.6  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5032  hemolysin-type calcium-binding region  32.03 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.867375 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  30.85 
 
 		 2775 aa  56.6  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3629  hemolysin-type calcium-binding region  25.92 
 
 		 589 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.170344 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  32.04 
 
 		 1712 aa  55.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1367  hemolysin-type calcium-binding protein  34.72 
 
 		 757 aa  55.1  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0102  putative calcium binding hemolysin protein  29.25 
 
 		 1217 aa  54.7  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  33.15 
 
 		 950 aa  54.7  0.000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1795  Allergen V5/Tpx-1 family protein  29.15 
 
 		 421 aa  54.3  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.797719 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0640  Hemolysin-type calcium-binding region  31.88 
 
 		 572 aa  54.3  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.128085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6438  hypothetical protein  31.92 
 
 		 680 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.541051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4582  Hemolysin-type calcium-binding region  29.72 
 
 		 639 aa  53.9  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.518219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0004  hypothetical protein  28.27 
 
 		 414 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5716  CHRD domain containing protein  31.34 
 
 		 460 aa  53.9  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0405  hemolysin-type calcium-binding region  31.28 
 
 		 709 aa  53.5  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  33.47 
 
 		 526 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4711  putative secreted calcium-binding protein  36.36 
 
 		 219 aa  53.5  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.779916  normal  0.14825 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0991  hypothetical protein  34.72 
 
 		 679 aa  53.5  0.000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  29.11 
 
 		 813 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2593  periplasmic protein TonB links inner and outer membranes-like  30.09 
 
 		 1197 aa  53.5  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0238559  normal  0.0624657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2793  Hemolysin-type calcium-binding region  32.18 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0234899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0281  protein of unknown function DUF839  34.85 
 
 		 686 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1664  hemolysin-type calcium-binding region  31.65 
 
 		 741 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.273862  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2570  hemolysin-type calcium-binding region  32.18 
 
 		 361 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.804479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  41 
 
 		 4798 aa  52.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0822  peptidase domain-containing protein  29.65 
 
 		 820 aa  52.4  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0508  Hemolysin-type calcium-binding region  31.06 
 
 		 534 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  26.96 
 
 		 3209 aa  51.6  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1884  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.73 
 
 		 588 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0760067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1710  hemolysin-type calcium-binding region  33.33 
 
 		 1582 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1701  5'-nucleotidase domain-containing protein  31.14 
 
 		 980 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.507606  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  32.24 
 
 		 615 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4753  Hemolysin-type calcium-binding region  27.3 
 
 		 724 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.321529  normal  0.052918 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5002  hemolysin-type calcium-binding region  30.73 
 
 		 1532 aa  51.2  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0763111  normal  0.53255 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3435  hemolysin-type calcium-binding region  35.76 
 
 		 219 aa  50.8  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.489484  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1697  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.84 
 
 		 1795 aa  50.4  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  32.77 
 
 		 4800 aa  50.4  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0902  hypothetical protein  31.05 
 
 		 319 aa  50.1  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.643951  hitchhiker  0.00894746 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0560  hemolysin-type calcium-binding region  26.86 
 
 		 1079 aa  50.1  0.00009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545421  normal  0.459398 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  29.07 
 
 		 942 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0162  Hemolysin-type calcium-binding protein  27.59 
 
 		 833 aa  49.7  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  43.96 
 
 		 1814 aa  49.7  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  32.97 
 
 		 561 aa  49.7  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0721  hemolysin-type calcium-binding region  30.81 
 
 		 1764 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2426  Hemolysin-type calcium-binding region  32.71 
 
 		 1884 aa  49.7  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.484615  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4058  hemolysin-type calcium-binding region  26.3 
 
 		 1072 aa  50.1  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.402749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0131  hemolysin-type calcium-binding region  31.47 
 
 		 357 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4727  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30 
 
 		 1027 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1167  putative outer membrane adhesin like proteiin  28.21 
 
 		 1884 aa  48.9  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3353  heme peroxidase  31.79 
 
 		 3608 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0262  Hemolysin-type calcium-binding region  28.81 
 
 		 729 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4310  Hemolysin-type calcium-binding region  31.73 
 
 		 620 aa  48.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4725  polymorphic membrane protein  27.93 
 
 		 1037 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.708929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2710  hemolysin-type calcium-binding region  34.22 
 
 		 327 aa  48.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0827574  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  30.57 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1114  hemolysin-type calcium-binding toxin  37.5 
 
 		 280 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.437868  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  29.28 
 
 		 1145 aa  47.8  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2439  hemolysin-type calcium-binding region  23.18 
 
 		 1286 aa  47.4  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.220432 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>