More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1029 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1793  type II secretion system protein  77.45 
 
 		 408 aa  660    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.88206 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1029  type II secretion system protein  100 
 
 		 405 aa  830    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.142759 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1997  Type II secretion system F domain protein  54.59 
 
 		 407 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1409  type II secretion system protein  49.02 
 
 		 405 aa  419  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000205741  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0757  type II secretion system protein  36.45 
 
 		 409 aa  284  2.0000000000000002e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.659493  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0728  general secretion pathway protein F  39.51 
 
 		 409 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164597  normal  0.206561 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3659  type II secretion system protein  35.24 
 
 		 406 aa  275  9e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.151178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3482  type II secretion system protein  34.74 
 
 		 406 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05990  Tfp pilus biogenesis protein PilC  34 
 
 		 401 aa  269  5.9999999999999995e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4108  MSHA biogenesis protein MshG  35.48 
 
 		 406 aa  268  1e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3747  type II secretion system protein  33 
 
 		 404 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1104  Type II secretion system F domain protein  35.09 
 
 		 401 aa  265  8.999999999999999e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.250932  decreased coverage  0.00579509 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0880  type II secretion system protein  35.78 
 
 		 406 aa  265  1e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.12464 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1105  type II secretion system protein  34.92 
 
 		 404 aa  264  2e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0187302  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1506  type II secretion system protein  35.32 
 
 		 403 aa  264  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000781072  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0564  type II secretion system protein  34.74 
 
 		 406 aa  265  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4413  type II secretion system protein  33.58 
 
 		 406 aa  264  2e-69  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00834233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0970  type II secretion system protein  36.78 
 
 		 417 aa  264  3e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3343  type II secretion system protein  34.41 
 
 		 405 aa  263  4e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000142203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1552  type II secretion system protein  34.09 
 
 		 402 aa  263  4.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0298839 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0470  type II secretion system protein  34.74 
 
 		 406 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3831  type II secretion system protein  34.74 
 
 		 406 aa  261  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00398408  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0458  MSHA biogenesis protein MshG  34.48 
 
 		 406 aa  261  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.954592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0512  type II secretion system protein  34.49 
 
 		 406 aa  260  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0331644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0509  type II secretion system protein  34.49 
 
 		 406 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.013646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0488  type II secretion system protein  34.49 
 
 		 406 aa  260  3e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00834812  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1633  type II secretion system protein  32.43 
 
 		 406 aa  259  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0393  type II secretion system protein  33.66 
 
 		 405 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.510231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2512  type II secretion system protein  32 
 
 		 405 aa  257  2e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4184  type II secretion system protein  35 
 
 		 404 aa  258  2e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.130479 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3764  type II secretion system protein  34 
 
 		 406 aa  257  3e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000373455  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0684  general secretion pathway protein F  37.07 
 
 		 409 aa  256  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0548  type II secretion system protein  33.75 
 
 		 406 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00110848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0719  general secretion pathway protein F  37.32 
 
 		 409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.975907  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0718  general secretion pathway protein F  37.32 
 
 		 409 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1493  type IV pilus biogenesis protein PilC  32.33 
 
 		 405 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.181113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2593  type II secretion system protein  32.43 
 
 		 407 aa  252  7e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002372  MSHA biogenesis protein MshG  32.59 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0406716  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1759  type II secretion system protein  34.42 
 
 		 401 aa  250  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2610  general secretion pathway protein F  33.25 
 
 		 412 aa  249  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.555556  normal  0.906322 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1395  type II secretion system protein  31.83 
 
 		 405 aa  249  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03694  hypothetical protein  33.01 
 
 		 407 aa  249  7e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4826  Type II secretion system F domain protein  32 
 
 		 403 aa  249  8e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.590317 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0757  type II secretion system protein  32.75 
 
 		 406 aa  248  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0118  type II secretion system protein  34.07 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.423729  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3270  general secretory pathway protein F  35.14 
 
 		 406 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.741471  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0753  type II secretory pathway component PulF  33.99 
 
 		 407 aa  247  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.347223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1655  type II secretion system protein  32 
 
 		 404 aa  247  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1612  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 404 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2136  Type II secretion system F domain protein  33.42 
 
 		 408 aa  246  8e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.909569  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1638  type II secretion system protein  33.5 
 
 		 404 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2560  type II secretion system protein  34.81 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0658  type II secretion system protein  31.47 
 
 		 417 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0658  type II secretion system protein  31.47 
 
 		 417 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0407  type II secretion system protein  32.32 
 
 		 419 aa  244  3e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0624  type II secretion system protein  31.47 
 
 		 417 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0174  type II secretion system protein  32.08 
 
 		 405 aa  243  6e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1723  Type II secretion system F domain protein  34.5 
 
 		 409 aa  242  7.999999999999999e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0325  type II secretion system protein  33.42 
 
 		 406 aa  242  9e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0496164  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2680  type II secretion system protein  30.27 
 
 		 405 aa  242  9e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0473  type IV pilus, mannose-sensitive hemagglutinin protein  30.49 
 
 		 408 aa  241  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.615107  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0374  type II secretion system protein  34.9 
 
 		 407 aa  241  2e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.777573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1584  type II secretion system protein  34.67 
 
 		 422 aa  239  6.999999999999999e-62  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.738971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1320  type II secretion system protein  33.74 
 
 		 409 aa  239  6.999999999999999e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0145546 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2569  type II secretion system protein F  31.76 
 
 		 401 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2136  type II secretion system protein  33.42 
 
 		 406 aa  238  2e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.428649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2147  putative general protein secretion protein  32.25 
 
 		 405 aa  237  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2271  type II secretion system protein F  31.51 
 
 		 401 aa  238  2e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1390  type II secretion system protein  30.15 
 
 		 404 aa  236  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.387943  normal  0.0225351 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2824  MSHA biogenesis protein MshG  33 
 
 		 407 aa  235  1.0000000000000001e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0890  Type II secretion system F domain protein  34.74 
 
 		 403 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1036  type II secretion system protein  32.16 
 
 		 401 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1968  Type II secretion system F domain-containing protein  34.58 
 
 		 407 aa  233  7.000000000000001e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04887  pilin biogenesis protein  31.34 
 
 		 419 aa  231  1e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0389  general secretory pathway protein F  31.57 
 
 		 408 aa  230  3e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000589087  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3098  type II secretion system protein  32.61 
 
 		 412 aa  229  6e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4697  type II secretion system protein  32.35 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.818253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1139  MSHA biogenesis protein MshG  30.79 
 
 		 406 aa  228  1e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1164  type II secretion system protein  33.25 
 
 		 403 aa  228  1e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0875  type II secretion system protein  33.17 
 
 		 409 aa  228  2e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2849  type II secretion system protein  31.41 
 
 		 403 aa  227  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0669  type II secretion system protein  31.16 
 
 		 419 aa  227  3e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0398046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0302  Type II secretion system F domain protein  33.5 
 
 		 412 aa  227  3e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.923196  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2101  type II secretion system protein  32.75 
 
 		 404 aa  226  5.0000000000000005e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2069  fimbrial assembly protein PilC-like  32.1 
 
 		 410 aa  226  7e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3086  type II secretion system protein  32.95 
 
 		 439 aa  225  1e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.128855 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12080  type IV pilus biogenesis protein  30.58 
 
 		 405 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.192731  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00255  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshG (pilus type IV)  31.77 
 
 		 411 aa  225  1e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5489  type II secretion system protein  30.85 
 
 		 405 aa  224  3e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.759932  normal  0.0666494 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3361  type II secretion system protein  34.23 
 
 		 412 aa  224  3e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1352  pilin biogenesis protein, putative  31.42 
 
 		 401 aa  223  4e-57  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.291747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3681  type II secretion system protein  30.33 
 
 		 405 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0533  type II secretion system protein  31.19 
 
 		 402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2412  type II secretion system protein  30.62 
 
 		 405 aa  222  9e-57  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1169  type II secretion system protein  31.68 
 
 		 400 aa  222  9e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2707  type II secretion system protein  30.89 
 
 		 401 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.315565 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1345  type II secretion system protein  33 
 
 		 410 aa  222  9.999999999999999e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0311  type II secretion system protein F  29.82 
 
 		 406 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3177  type II secretion system protein  31.09 
 
 		 419 aa  220  3e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1745  type II secretion system protein  35.88 
 
 		 377 aa  220  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41063  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>