More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_0141 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011661  Dtur_0141  histone deacetylase superfamily  100 
 
 		 315 aa  646    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.100578  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2224  histone deacetylase superfamily protein  46.96 
 
 		 327 aa  310  2e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0321153  normal  0.223213 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0962  histone deacetylase superfamily protein  47.1 
 
 		 321 aa  290  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.109144  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0750  histone deacetylase superfamily  41.03 
 
 		 374 aa  231  1e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3338  histone deacetylase superfamily protein  39.93 
 
 		 388 aa  206  5e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0263491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0461  acetoin utilization protein AcuC  37.95 
 
 		 388 aa  203  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000567246 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4778  acetoin utilization protein AcuC  38.57 
 
 		 388 aa  202  8e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4804  acetoin utilization protein AcuC  38.57 
 
 		 388 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4563  acetoin utilization protein AcuC  38.57 
 
 		 388 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4414  acetoin utilization protein  38.57 
 
 		 388 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4918  acetoin utilization protein AcuC  38.57 
 
 		 388 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4783  acetoin utilization protein AcuC  38.57 
 
 		 388 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1012  Histone deacetylase  39.68 
 
 		 351 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4397  acetoin utilization protein  38.23 
 
 		 388 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0708  Histone deacetylase  35.64 
 
 		 389 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1014  histone deacetylase superfamily protein  38.97 
 
 		 387 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0102767  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4800  acetoin utilization protein AcuC  38.23 
 
 		 388 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4496  histone deacetylase superfamily protein  38.57 
 
 		 388 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2732  histone deacetylase superfamily  36.24 
 
 		 396 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1425  histone deacetylase superfamily protein  36.39 
 
 		 370 aa  189  8e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1832  Histone deacetylase  33.64 
 
 		 410 aa  188  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.201599  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0535  Histone deacetylase  35.03 
 
 		 387 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0570  histone deacetylase superfamily protein  36.83 
 
 		 360 aa  181  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1468  histone deacetylase superfamily  35.14 
 
 		 397 aa  180  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0799038  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3143  histone deacetylase superfamily  33.23 
 
 		 403 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.170732 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24430  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  33.85 
 
 		 406 aa  178  1e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.653116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3345  histone deacetylase superfamily protein  33.65 
 
 		 407 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27490  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  36.45 
 
 		 393 aa  176  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1239  histone deacetylase superfamily protein  33.96 
 
 		 435 aa  176  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.127152  hitchhiker  0.00245204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0483  histone deacetylase superfamily protein  32.11 
 
 		 394 aa  175  9.999999999999999e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.275495  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0963  Histone deacetylase  34.1 
 
 		 378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.469516  normal  0.273215 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2236  Histone deacetylase  33.22 
 
 		 414 aa  173  3.9999999999999995e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0118609  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0250  histone deacetylase superfamily  35.93 
 
 		 387 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358933  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0834  histone deacetylase superfamily  33.02 
 
 		 378 aa  170  2e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4452  Histone deacetylase  34.68 
 
 		 412 aa  170  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18020  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  34 
 
 		 417 aa  169  5e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.738077  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0533  histone deacetylase superfamily protein  37.32 
 
 		 348 aa  168  9e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.072372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3788  Histone deacetylase  31.96 
 
 		 393 aa  167  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0376544  normal  0.295517 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0246  histone deacetylase superfamily protein  32.65 
 
 		 392 aa  167  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0467298  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2745  Histone deacetylase  35.69 
 
 		 406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.799904  hitchhiker  0.000342865 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3565  Histone deacetylase  33.67 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1790  histone deacetylase superfamily protein  33.44 
 
 		 389 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.252673  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1825  histone deacetylase superfamily protein  33.44 
 
 		 389 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000197961  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24330  deacetylase, histone deacetylase/acetoin utilization protein  31.34 
 
 		 424 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1461  histone deacetylase superfamily protein  32.81 
 
 		 393 aa  162  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.111852  normal  0.224977 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3503  histone deacetylase superfamily protein  31.43 
 
 		 426 aa  162  9e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.678052  normal  0.280253 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0112  histone deacetylase superfamily  31.83 
 
 		 378 aa  160  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.833129  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0507  histone deacetylase superfamily  32.45 
 
 		 395 aa  156  4e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0375455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0936  histone deacetylase superfamily protein  32.34 
 
 		 316 aa  155  7e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2707  putative acetoin utilization protein  33.66 
 
 		 392 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1422  histone deacetylase superfamily protein  31.55 
 
 		 393 aa  149  5e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000379462 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5005  Histone deacetylase  31.25 
 
 		 396 aa  149  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.983537  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0430  histone deacetylase superfamily  30.07 
 
 		 390 aa  148  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188853  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0517  histone deacetylase superfamily  31.89 
 
 		 383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0611  histone deacetylase superfamily  33.56 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.571257  normal  0.0511061 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2798  histone deacetylase superfamily protein  31.31 
 
 		 324 aa  142  5e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1739  histone deacetylase superfamily protein  30.12 
 
 		 385 aa  142  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.558289 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1137  histone deacetylase family protein  31.31 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3268  histone deacetylase superfamily  30.6 
 
 		 411 aa  141  1.9999999999999998e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0684517  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0653  Histone deacetylase  28.53 
 
 		 406 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.625383  normal  0.171491 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0262  histone deacetylase superfamily protein  30.82 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3125  histone deacetylase superfamily  31.44 
 
 		 385 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5232  histone deacetylase superfamily protein  31.52 
 
 		 369 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.428227 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1024  histone deacetylase superfamily  33.57 
 
 		 309 aa  139  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.448612  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2297  histone deacetylase superfamily protein  29.1 
 
 		 385 aa  139  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1137  Histone deacetylase  31.44 
 
 		 385 aa  139  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1919  histone deacetylase superfamily protein  31.88 
 
 		 369 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2789  histone deacetylase superfamily protein  31.54 
 
 		 307 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.403843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1785  histone deacetylase superfamily protein  33.1 
 
 		 379 aa  138  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000374535  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1212  histone deacetylase superfamily  34.64 
 
 		 306 aa  138  1e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6148  histone deacetylase superfamily protein  31.16 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7122  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1931  histone deacetylase superfamily protein  31.16 
 
 		 369 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.206813  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0643  histone deacetylase superfamily  29.57 
 
 		 379 aa  136  5e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000282204  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0091  histone deacetylase superfamily protein  29.35 
 
 		 307 aa  136  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.827237 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5804  histone deacetylase superfamily protein  30.38 
 
 		 315 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.365459  normal  0.341823 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1222  histone deacetylase/AcuC/AphA family protein  29.5 
 
 		 385 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0627011  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1954  histone deacetylase superfamily protein  30.43 
 
 		 369 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00466177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0989  histone deacetylase superfamily protein  30.96 
 
 		 326 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4303  histone deacetylase superfamily protein  32.52 
 
 		 309 aa  132  5e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.490284  normal  0.261711 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2090  Histone deacetylase  35.48 
 
 		 345 aa  132  6e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1276  histone deacetylase superfamily protein  32.62 
 
 		 370 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.296162 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03520  histone deacetylase 1 (hd1), putative  31.1 
 
 		 621 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1341  histone deacetylase superfamily protein  31.16 
 
 		 373 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0145717 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2481  putative deacetylase  30.17 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0780  histone deacetylase superfamily protein  30.56 
 
 		 309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4458  histone deacetylase superfamily protein  32.52 
 
 		 309 aa  129  7.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0695577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0555  histone deacetylase superfamily protein  30.58 
 
 		 379 aa  129  8.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3190  histone deacetylase superfamily protein  28.68 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3248  histone deacetylase superfamily protein  30.55 
 
 		 369 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000895974 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0676  histone deacetylase superfamily protein  29.01 
 
 		 344 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.401062  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2656  putative acetylpolyamine aminohydrolase  28.04 
 
 		 371 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0856  histone deacetylase superfamily  30.72 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0895485  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119545  histone deacetylase  28.67 
 
 		 487 aa  127  3e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0929  histone deacetylase superfamily protein  29.63 
 
 		 364 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00399276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2753  histone deacetylase superfamily protein  31.38 
 
 		 309 aa  127  3e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.277237  normal  0.113351 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2375  histone deacetylase family protein putative  30.43 
 
 		 369 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2491  histone deacetylase family protein  30.43 
 
 		 340 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.625994  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0611  histone deacetylase superfamily  28.9 
 
 		 311 aa  126  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.240972 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2162  histone deacetylase superfamily  28.94 
 
 		 404 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.654849  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0570  histone deacetylase superfamily  28.24 
 
 		 311 aa  126  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.22937  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>