More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_1925 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013216  Dtox_2021  acriflavin resistance protein  37.31 
 
 		 1038 aa  679    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.86587  normal  0.343149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1020 aa  2051    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  31.88 
 
 		 1035 aa  528  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  30.05 
 
 		 1014 aa  494  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  30.29 
 
 		 1026 aa  481  1e-134  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2563  AcrB/AcrD/AcrF family protein  33.24 
 
 		 1019 aa  478  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  30.97 
 
 		 1030 aa  479  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  28.99 
 
 		 1028 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  30.48 
 
 		 1020 aa  468  9.999999999999999e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1118  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1009 aa  462  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3232  acriflavin resistance protein  29.42 
 
 		 1029 aa  457  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.133576  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3001  cation-multidrug efflux pump  31.29 
 
 		 1025 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2427  acriflavin resistance protein  30.82 
 
 		 1019 aa  448  1.0000000000000001e-124  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000179675 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0745  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.15 
 
 		 1027 aa  445  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5032  AcrB/AcrD/AcrF family protein  30.16 
 
 		 1024 aa  446  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  30.55 
 
 		 1050 aa  442  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 		 1043 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2235  acriflavin resistance protein  30.5 
 
 		 1022 aa  433  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6008  acriflavin resistance protein  30.61 
 
 		 1026 aa  427  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  29.42 
 
 		 1043 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2568  acriflavin resistance protein  29.71 
 
 		 1020 aa  414  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.456395  normal  0.0553814 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  28.88 
 
 		 1008 aa  414  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  28.78 
 
 		 1011 aa  410  1e-113  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4735  acriflavin resistance protein  27.84 
 
 		 1029 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.130909  normal  0.265642 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3774  acriflavin resistance protein  28.81 
 
 		 1050 aa  410  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.693497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0187  acriflavin resistance protein  27.5 
 
 		 1027 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  28.25 
 
 		 1044 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003809  transporter AcrB/D/F family  28.72 
 
 		 1036 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  28.84 
 
 		 1047 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3469  acriflavin resistance protein  29.19 
 
 		 1048 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1654  transmembrane drug efflux protein  27.68 
 
 		 1039 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.556775 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01877  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1036 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4928  acriflavin resistance protein  29.12 
 
 		 1019 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0792  acriflavin resistance protein  28.43 
 
 		 1013 aa  399  1e-109  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3350  acriflavin resistance protein  28.43 
 
 		 1024 aa  399  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.497047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1463  RND efflux transporter  28.6 
 
 		 1025 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1563  acriflavin resistance protein  27.65 
 
 		 1039 aa  398  1e-109  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.324661  normal  0.366734 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  27.8 
 
 		 1036 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  28.24 
 
 		 1034 aa  397  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1215  acriflavin resistance protein  27.74 
 
 		 1092 aa  399  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.735499  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3460  acriflavin resistance protein  27.92 
 
 		 1073 aa  393  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1080  acriflavin resistance protein  29.77 
 
 		 1022 aa  396  1e-108  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.756494 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1357  acriflavin resistance protein  26.69 
 
 		 1046 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.776005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4101  acriflavin resistance protein  28.98 
 
 		 1021 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.585633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1892  acriflavin resistance protein  27.46 
 
 		 1039 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.71237  normal  0.251919 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1278  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  28.72 
 
 		 1032 aa  393  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1461  acriflavin resistance protein  27.5 
 
 		 1067 aa  395  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.680288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1373  acriflavin resistance protein  26.84 
 
 		 1036 aa  393  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167404  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2531  transmembrane drug efflux protein  26.8 
 
 		 1022 aa  392  1e-107  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.231236  normal  0.199392 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2023  acriflavin resistance protein  28.18 
 
 		 1015 aa  392  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0990325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2546  acriflavin resistance protein  26.9 
 
 		 1047 aa  391  1e-107  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0226103 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1353  putative multi-drug efflux protein  27.93 
 
 		 1025 aa  392  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.434424  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16820  putative efflux transmembrane protein  28.21 
 
 		 1025 aa  392  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.522228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  26.95 
 
 		 1031 aa  387  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0670  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  26.39 
 
 		 1010 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3431  acriflavin resistance protein  26.08 
 
 		 1143 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.204539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2902  acriflavin resistance protein  29.64 
 
 		 1236 aa  387  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1517  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 		 1021 aa  383  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.850738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4206  acriflavin resistance protein  28.77 
 
 		 1021 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.355818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1145  acriflavin resistance protein  26.69 
 
 		 1191 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000258261  normal  0.148502 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1315  acriflavin resistance protein  30.02 
 
 		 1029 aa  386  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.549537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4073  acriflavin resistance protein  26.6 
 
 		 1046 aa  386  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1311  acriflavin resistance protein  27.54 
 
 		 1023 aa  385  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000226  transporter AcrB/D/F family  28.1 
 
 		 1019 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.486029  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05963  hypothetical protein  28.32 
 
 		 1019 aa  384  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2215  RND efflux transporter  26.65 
 
 		 1046 aa  385  1e-105  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12162  normal  0.156003 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1147  acriflavin resistance protein  26.81 
 
 		 1021 aa  385  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4901  acriflavin resistance protein  26.74 
 
 		 1045 aa  386  1e-105  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.626163  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3222  acriflavin resistance protein  27.68 
 
 		 1020 aa  381  1e-104  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2172  acriflavin resistance protein  27.97 
 
 		 1016 aa  382  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4221  acriflavin resistance protein  26.11 
 
 		 1046 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592622  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2039  acriflavin resistance protein  28.45 
 
 		 1018 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0940765 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1082  acriflavin resistance protein  26.25 
 
 		 1044 aa  381  1e-104  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4376  acriflavin resistance protein  26.69 
 
 		 1041 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.980623  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2294  acriflavin resistance protein  28.81 
 
 		 1012 aa  382  1e-104  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1207  acriflavin resistance protein  27.71 
 
 		 1049 aa  380  1e-104  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.372484 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4145  acriflavin resistance protein  28.35 
 
 		 1021 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.452141 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  27.02 
 
 		 1038 aa  379  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1126  acriflavin resistance protein  27.62 
 
 		 1049 aa  378  1e-103  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0566476  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3409  acriflavin resistance protein  28.14 
 
 		 1018 aa  379  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.532755 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1123  acriflavin resistance protein  28.96 
 
 		 1021 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1509  acriflavin resistance protein  27.33 
 
 		 1023 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.83923  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1729  acriflavin resistance protein  28.52 
 
 		 1041 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5275  acriflavin resistance protein  27.57 
 
 		 1054 aa  375  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0105172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1047  acriflavin resistance protein  26.61 
 
 		 1021 aa  375  1e-102  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0882711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5504  acriflavin resistance protein  26.37 
 
 		 1146 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2751  acriflavin resistance protein  27.75 
 
 		 1041 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.212655  normal  0.287815 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  26.87 
 
 		 1065 aa  374  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1311  acriflavin resistance protein  26.94 
 
 		 1039 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.203129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1277  acriflavin resistance protein  27.41 
 
 		 1023 aa  375  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00411319  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2513  cation/multidrug efflux pump  26.9 
 
 		 1134 aa  375  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.422561  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1862  acriflavin resistance protein  26.63 
 
 		 1035 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635777 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1266  acriflavin resistance protein  26.78 
 
 		 1040 aa  375  1e-102  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1393  acriflavin resistance protein  26.03 
 
 		 1014 aa  375  1e-102  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2509  acriflavin resistance protein  27.84 
 
 		 1051 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1569  acriflavin resistance protein  26.52 
 
 		 1026 aa  371  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  28.31 
 
 		 1044 aa  372  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  27.59 
 
 		 1069 aa  371  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1290  putative transmembrane drug efflux protein  27.48 
 
 		 1041 aa  372  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0890171 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01970  putative RND efflux transporter  27.39 
 
 		 1015 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.335832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>