More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0858 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_0858  ABC transporter related  100 
 
 		 230 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.269038  normal  0.152569 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5099  ABC transporter related  68.26 
 
 		 229 aa  305  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.999414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2233  ABC transporter related  62.11 
 
 		 228 aa  291  5e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4397  ABC transporter related  56.84 
 
 		 233 aa  258  6e-68  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3272  hypothetical protein  59.55 
 
 		 230 aa  250  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2456  ABC transporter related  53.36 
 
 		 237 aa  242  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4207  ABC transporter related  54.7 
 
 		 232 aa  240  1e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.391697  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0790  ABC transporter-related protein  52.52 
 
 		 239 aa  239  2e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.166269 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0990  ABC transporter related  52.52 
 
 		 237 aa  240  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000228508 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4047  ABC transporter related  54.85 
 
 		 236 aa  239  2.9999999999999997e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0736  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  50 
 
 		 234 aa  237  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3639  ABC transporter related  52.56 
 
 		 233 aa  237  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400597  normal  0.0302985 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2124  ABC transporter-like protein  54.31 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4002  ABC transporter related  50 
 
 		 232 aa  232  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0795353  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1208  ABC transporter related  50.85 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.430361  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3826  ABC transporter related  54.66 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4484  ABC transporter related  52.52 
 
 		 237 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0632  ABC transporter related  51.05 
 
 		 242 aa  222  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.445134  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3170  ABC transporter-related protein  51.48 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00314839  normal  0.639262 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4606  ABC transporter related  52.54 
 
 		 235 aa  219  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0362  ABC transporter related  53.94 
 
 		 243 aa  219  3e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0179  ABC transporter related  51.11 
 
 		 233 aa  217  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.505105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1988  ABC transporter related  48.1 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.69422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4818  ABC transporter related  50.21 
 
 		 243 aa  216  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.23625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4367  ABC transporter related  52.74 
 
 		 236 aa  214  7e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.583666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4658  ABC transporter related  53.16 
 
 		 236 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.387595  normal  0.829022 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5131  ABC transporter related  47.26 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.138859  normal  0.0107113 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  50 
 
 		 234 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  47.09 
 
 		 236 aa  208  6e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  49.57 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  49.57 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  46.64 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  48.26 
 
 		 233 aa  205  5e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4748  ABC transporter related  48.29 
 
 		 237 aa  204  8e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.597836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2450  ABC transporter related  52.73 
 
 		 233 aa  203  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  47.83 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0197  ABC transporter related  47.03 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  47.83 
 
 		 233 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1903  ABC transporter related  49.57 
 
 		 244 aa  202  3e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.638808  normal  0.412761 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2057  ABC transporter related  52.73 
 
 		 233 aa  201  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2989  ABC transporter related  48.29 
 
 		 246 aa  201  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.455823  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2306  ABC transporter related protein  43.4 
 
 		 236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0081  ABC transporter related  51.64 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  49.13 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1618  ABC transporter related  47.44 
 
 		 237 aa  199  3.9999999999999996e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.458838 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2768  ABC transporter related  46.15 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0458182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5703  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  47.41 
 
 		 238 aa  198  7e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.507716 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  46.96 
 
 		 234 aa  197  7.999999999999999e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0477  ABC transporter related  46.96 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.96 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3085  ABC transporter related  45.73 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4268  ABC transporter related  47.64 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1020  ABC transporter related  47.11 
 
 		 240 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2245  ABC transporter ATP-binding protein  51.82 
 
 		 233 aa  194  7e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.310243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1333  ABC transporter related  47.88 
 
 		 237 aa  194  7e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.529108  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  46.09 
 
 		 233 aa  194  9e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1230  ABC transporter-related protein  49.08 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0606758  normal  0.0611511 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4555  ABC transporter related  47.21 
 
 		 238 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  44.07 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1002  ABC transporter related  49.32 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3131  ABC transporter related  48.15 
 
 		 237 aa  192  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4778  high-affinity branched-chain amino acid transport protein of the ABC transporter ATP binding  50.71 
 
 		 233 aa  191  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000236786  normal  0.704554 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  46.78 
 
 		 235 aa  191  1e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0732  ABC transporter related  46.22 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2954  ABC transporter related  46.19 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.124902 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1979  ABC transporter related  46.55 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3649  ABC transporter-related protein  45.92 
 
 		 237 aa  188  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0083  ABC transporter related  46.08 
 
 		 233 aa  188  8e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6326  ABC transporter related  43.1 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0210  ABC transporter related  44.64 
 
 		 237 aa  187  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2182  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  46.64 
 
 		 238 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1696  ABC transporter-related protein  47.09 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0250061  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1767  ABC transporter related  47.09 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.428045  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0572  ABC transporter related  46.54 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129058  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2580  ABC transporter related protein  47.14 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.630043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1244  ABC transporter related  45.45 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0761  ABC transporter related  48.47 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5146  ABC transporter related  47.44 
 
 		 245 aa  185  5e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.239082 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  42.31 
 
 		 234 aa  185  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0113  ABC transporter related  40.85 
 
 		 236 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4816  hypothetical protein  49.28 
 
 		 739 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2686  ABC transporter-like protein  48 
 
 		 484 aa  183  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.473658  normal  0.293946 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4819  ABC transporter related  46.93 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0621647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0419  ABC transporter-like protein  46.96 
 
 		 240 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1685  ABC transporter related  44.93 
 
 		 239 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  44.59 
 
 		 236 aa  182  6e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1590  ABC transporter related  48.07 
 
 		 240 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6215  ABC transporter related  45.76 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  45.96 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2726  ABC transporter related  46.98 
 
 		 235 aa  181  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.936769  normal  0.0467281 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  42.49 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  45.79 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4464  ABC transporter related  42.37 
 
 		 237 aa  179  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.335127  normal  0.326178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3236  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  43.72 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0457332  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0683  ABC transporter related protein  43.38 
 
 		 244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000101053  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  39.19 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6135  ABC transporter related  43.59 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.112796  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5448  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  45.87 
 
 		 235 aa  178  4.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.359118  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2334  ABC transporter related protein  44.59 
 
 		 234 aa  179  4.999999999999999e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.486602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  41.44 
 
 		 236 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>