More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1517 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1147  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.66 
 
 		 670 aa  682    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0890  DNA ligase, NAD-dependent  51.74 
 
 		 670 aa  663    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0538  DNA ligase, NAD-dependent  53.58 
 
 		 662 aa  697    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0683  DNA ligase, NAD-dependent  51.78 
 
 		 684 aa  654    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.992096  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1442  DNA ligase, NAD-dependent  50.38 
 
 		 665 aa  656    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.474438  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0335  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.77 
 
 		 669 aa  699    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1617  DNA ligase, NAD-dependent  54.86 
 
 		 672 aa  697    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.755766  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0292  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.92 
 
 		 669 aa  701    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0276  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.61 
 
 		 669 aa  697    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0279  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.61 
 
 		 669 aa  697    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1993  DNA ligase, NAD-dependent  50.15 
 
 		 667 aa  660    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1618  DNA ligase, NAD-dependent  51.45 
 
 		 673 aa  681    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164842  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4968  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.92 
 
 		 669 aa  701    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1959  DNA ligase, NAD-dependent  50.15 
 
 		 667 aa  660    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2728  NAD-dependent DNA ligase C4-type  51.82 
 
 		 671 aa  665    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0352  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.77 
 
 		 669 aa  699    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0306  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.92 
 
 		 669 aa  701    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2013  DNA ligase, NAD-dependent  58.86 
 
 		 666 aa  751    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0763  DNA ligase, NAD-dependent  54.77 
 
 		 677 aa  699    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000192603  normal  0.836157 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0378  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.92 
 
 		 669 aa  701    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1094  DNA ligase, NAD-dependent  54.85 
 
 		 672 aa  717    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.878392  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0271  NAD-dependent DNA ligase LigA  55.64 
 
 		 670 aa  710    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2346  DNA ligase, NAD-dependent  56.82 
 
 		 670 aa  764    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0286  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.45 
 
 		 669 aa  704    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0337  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.77 
 
 		 669 aa  701    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02300  DNA ligase, NAD-dependent  54.15 
 
 		 670 aa  707    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000139643  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1517  DNA ligase, NAD-dependent  100 
 
 		 659 aa  1341    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000611736  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0462  DNA ligase, NAD-dependent  51.74 
 
 		 663 aa  669    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0369  DNA ligase (NAD(+))  51.75 
 
 		 661 aa  668    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1035  DNA ligase, NAD-dependent  52.19 
 
 		 663 aa  679    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0287  NAD-dependent DNA ligase LigA  54.16 
 
 		 669 aa  692    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2948  DNA ligase, NAD-dependent  50.53 
 
 		 668 aa  634  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1305  DNA ligase, NAD-dependent  51.52 
 
 		 672 aa  635  1e-180  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.617786  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1336  DNA ligase, NAD-dependent  50.08 
 
 		 668 aa  632  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26670  DNA ligase, NAD-dependent  48.02 
 
 		 708 aa  627  1e-178  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000046682  normal  0.968488 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0182  DNA ligase, NAD-dependent  47.71 
 
 		 681 aa  626  1e-178  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2024  DNA ligase (NAD(+))  49.55 
 
 		 675 aa  623  1e-177  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00334946  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2438  DNA ligase, NAD-dependent  48.95 
 
 		 673 aa  620  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2213  DNA ligase, NAD-dependent  49.85 
 
 		 671 aa  617  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000618814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2927  DNA ligase, NAD-dependent  49.03 
 
 		 683 aa  615  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000591487  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1575  DNA ligase, NAD-dependent  48.17 
 
 		 697 aa  617  1e-175  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0681  DNA ligase, NAD-dependent  49.02 
 
 		 673 aa  615  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.295891  normal  0.841285 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0824  DNA ligase, NAD-dependent  47.66 
 
 		 688 aa  609  1e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0847  DNA ligase, NAD-dependent  47.66 
 
 		 688 aa  609  1e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1734  NAD-dependent DNA ligase  49.11 
 
 		 683 aa  608  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.39998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4656  DNA ligase, NAD-dependent  46.55 
 
 		 673 aa  606  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.203554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1343  DNA ligase, NAD-dependent  47.89 
 
 		 683 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.584756  normal  0.20338 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1886  NAD-dependent DNA ligase  48.53 
 
 		 711 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0136067  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3660  DNA ligase, NAD-dependent  48.52 
 
 		 681 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0589668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1167  DNA ligase, NAD-dependent  48.8 
 
 		 678 aa  604  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.140803  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04740  DNA ligase, NAD-dependent  47.35 
 
 		 725 aa  599  1e-170  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.113755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2044  DNA ligase, NAD-dependent  47.84 
 
 		 691 aa  598  1e-170  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0277  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.98 
 
 		 679 aa  599  1e-170  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1111  DNA ligase, NAD-dependent  46.52 
 
 		 705 aa  601  1e-170  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.878311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1676  NAD-dependent DNA ligase  47.91 
 
 		 688 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.194979  normal  0.0666248 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2698  DNA ligase, NAD-dependent  45.71 
 
 		 674 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6053  DNA ligase, NAD-dependent  47.99 
 
 		 746 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.255704  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2461  DNA ligase, NAD-dependent  47.61 
 
 		 688 aa  600  1e-170  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0455112  hitchhiker  0.000280706 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2024  DNA ligase, NAD-dependent  47.99 
 
 		 691 aa  600  1e-170  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2062  DNA ligase, NAD-dependent  47.19 
 
 		 691 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.631088  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1560  DNA ligase, NAD-dependent  47.19 
 
 		 691 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.436833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1334  DNA ligase, NAD-dependent  47.19 
 
 		 691 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.538237  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2588  DNA ligase, NAD-dependent  47.19 
 
 		 691 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.245296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2442  DNA ligase, NAD-dependent  47.19 
 
 		 691 aa  595  1e-169  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.414068  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5334  DNA ligase (NAD+)  47.99 
 
 		 691 aa  598  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.373441  normal  0.204139 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2499  DNA ligase, NAD-dependent  47.19 
 
 		 691 aa  596  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1511  DNA ligase, NAD-dependent  45.23 
 
 		 662 aa  595  1e-169  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0217425  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1428  DNA ligase, NAD-dependent  47.14 
 
 		 721 aa  597  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223913 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2205  DNA ligase, NAD-dependent  47 
 
 		 708 aa  596  1e-169  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3418  DNA ligase, NAD-dependent  46.32 
 
 		 674 aa  597  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3249  DNA ligase, NAD-dependent  47.19 
 
 		 691 aa  597  1e-169  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0996  DNA ligase, NAD-dependent  46.73 
 
 		 668 aa  593  1e-168  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1926  DNA ligase, NAD-dependent  47.69 
 
 		 691 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.55791  normal  0.279266 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1252  DNA ligase, NAD-dependent  46.95 
 
 		 691 aa  592  1e-168  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0258025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2022  DNA ligase, NAD-dependent  46.81 
 
 		 691 aa  594  1e-168  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1575  DNA ligase, NAD-dependent  46.89 
 
 		 690 aa  592  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0209027  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2057  DNA ligase, NAD-dependent  47.69 
 
 		 691 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.258192  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0472  NAD-dependent DNA ligase LigA  44.62 
 
 		 686 aa  593  1e-168  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2883  DNA ligase, NAD-dependent  44.61 
 
 		 678 aa  594  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.745192 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2896  DNA ligase, NAD-dependent  46.74 
 
 		 689 aa  589  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1444  DNA ligase, NAD-dependent  44.51 
 
 		 680 aa  590  1e-167  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0179686  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1455  DNA ligase, NAD-dependent  46.84 
 
 		 671 aa  590  1e-167  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0313  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.11 
 
 		 676 aa  590  1e-167  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0275  NAD-dependent DNA ligase  46.1 
 
 		 667 aa  591  1e-167  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0703  DNA ligase, NAD-dependent  47.89 
 
 		 691 aa  590  1e-167  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0877  DNA ligase, NAD-dependent  47.05 
 
 		 718 aa  590  1e-167  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00627604  hitchhiker  0.0000000262982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0810  DNA ligase, NAD-dependent  48.26 
 
 		 673 aa  590  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1508  DNA ligase, NAD-dependent  46.89 
 
 		 690 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000647513  hitchhiker  0.000000119836 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2461  DNA ligase, NAD-dependent  46.03 
 
 		 670 aa  590  1e-167  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.360751  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1513  NAD-dependent DNA ligase LigA  47.09 
 
 		 648 aa  591  1e-167  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1428  DNA ligase, NAD-dependent  46.39 
 
 		 694 aa  591  1e-167  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0176599  normal  0.198216 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1569  DNA ligase, NAD-dependent  46.89 
 
 		 691 aa  589  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0515781  unclonable  0.000000000191104 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1250  DNA ligase, NAD-dependent  46.94 
 
 		 671 aa  587  1e-166  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000262994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2546  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.94 
 
 		 671 aa  588  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  6.01558e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0503  DNA ligase, NAD-dependent  46.08 
 
 		 671 aa  587  1e-166  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.720163  normal  0.76832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4515  DNA ligase, NAD-dependent  46.62 
 
 		 726 aa  586  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1522  NAD-dependent DNA ligase  46.39 
 
 		 673 aa  587  1e-166  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2592  DNA ligase, NAD-dependent  46.84 
 
 		 706 aa  586  1e-166  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.457213 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3642  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.8 
 
 		 671 aa  586  1e-166  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000402344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2566  NAD-dependent DNA ligase LigA  46.94 
 
 		 671 aa  588  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000140501  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>