More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2104 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2483  glycoside hydrolase family protein  56.29 
 
 		 623 aa  636    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.455341  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2104  glycoside hydrolase family protein  100 
 
 		 627 aa  1269    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2021  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  50.93 
 
 		 640 aa  595  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1940  glycoside hydrolase family protein  47.91 
 
 		 593 aa  554  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.590979  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4107  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  48.62 
 
 		 595 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32470  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  45.1 
 
 		 710 aa  493  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0309  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  46.47 
 
 		 604 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.83969  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4066  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  39.04 
 
 		 590 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03200  conserved hypothetical protein  39.97 
 
 		 645 aa  409  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0625836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2878  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  38.2 
 
 		 614 aa  349  9e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00832134 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0966  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  37.75 
 
 		 621 aa  333  7.000000000000001e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0165303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1086  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  38.28 
 
 		 614 aa  325  1e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.358579 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07790  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  35.74 
 
 		 651 aa  314  2.9999999999999996e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.883217  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3194  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.49 
 
 		 905 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.163194  normal  0.106396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0134  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.28 
 
 		 884 aa  278  3e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0084  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.27 
 
 		 614 aa  278  3e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  37.69 
 
 		 575 aa  277  5e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.290276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2024  glycoside hydrolase family protein  32.26 
 
 		 603 aa  275  2.0000000000000002e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0247  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.82 
 
 		 620 aa  272  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6173  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  30.79 
 
 		 614 aa  268  2e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.873861  normal  0.124893 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1750  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.5 
 
 		 799 aa  263  8e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2605  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  31.85 
 
 		 757 aa  258  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0289193 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1816  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.99 
 
 		 800 aa  253  9.000000000000001e-66  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0827193  decreased coverage  0.000000000316153 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3794  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.49 
 
 		 623 aa  251  2e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.012505  normal  0.0216504 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6190  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.95 
 
 		 640 aa  251  3e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4492  Beta-galactosidase  33.1 
 
 		 889 aa  249  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.00800189  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1591  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  34.71 
 
 		 932 aa  247  4.9999999999999997e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.149874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0061  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.72 
 
 		 901 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22300  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  32.31 
 
 		 602 aa  243  6e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0671399  normal  0.394797 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0022  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  32.65 
 
 		 609 aa  242  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20590  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  36.51 
 
 		 892 aa  242  2e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14310  beta-galactosidase/beta-glucuronidase  35.79 
 
 		 864 aa  240  6.999999999999999e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.17 
 
 		 1064 aa  238  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1730  glycosy hydrolase family protein  29.91 
 
 		 600 aa  233  9e-60  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0782233  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0711  glycoside hydrolase family protein  29.06 
 
 		 626 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1202  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  33.44 
 
 		 619 aa  224  3e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.302396  normal  0.234387 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  33.12 
 
 		 980 aa  217  5.9999999999999996e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3323  Beta-galactosidase  31.96 
 
 		 584 aa  205  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0719598  normal  0.43752 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02395  hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14520)  31.2 
 
 		 613 aa  197  4.0000000000000005e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.265336  normal  0.18645 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0430  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  30.08 
 
 		 923 aa  194  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3622  glycoside hydrolase family protein  29.15 
 
 		 945 aa  190  5e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2927  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.85 
 
 		 619 aa  164  4.0000000000000004e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.817001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1095  Beta-galactosidase  28.57 
 
 		 743 aa  132  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2419  Beta-galactosidase  27.34 
 
 		 686 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  0.49724 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3195  beta-D-glucuronidase  28.66 
 
 		 590 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0006  glycoside hydrolase family protein  28.12 
 
 		 734 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3122  Beta-galactosidase  29.2 
 
 		 972 aa  115  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4197  glycoside hydrolase family protein  27.46 
 
 		 803 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20490  Beta-galactosidase  27.23 
 
 		 750 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000040433  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3226  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  26.5 
 
 		 1033 aa  112  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.553706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1185  Beta-glucuronidase  30 
 
 		 604 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2609  Beta-galactosidase  27.37 
 
 		 738 aa  110  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2632  HflK  25.48 
 
 		 607 aa  108  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000143868  normal  0.498277 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2051  glycoside hydrolase family protein  32.39 
 
 		 766 aa  108  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0684  DNA primase  26.78 
 
 		 785 aa  108  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.113069  hitchhiker  0.000000509357 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4208  Beta-galactosidase  28.53 
 
 		 587 aa  108  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  26.63 
 
 		 928 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2082  Beta-glucuronidase  24.58 
 
 		 600 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4198  glycoside hydrolase family protein  22.84 
 
 		 598 aa  107  6e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.161808  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0857  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  27.12 
 
 		 837 aa  107  9e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1667  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.08 
 
 		 858 aa  107  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.611357  normal  0.331093 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0826  glycosy hydrolase family protein  28.3 
 
 		 804 aa  105  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.241156  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2717  Beta-galactosidase  24.46 
 
 		 1045 aa  105  3e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.945973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3255  beta-D-glucuronidase  27.06 
 
 		 598 aa  103  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0779  glycoside hydrolase family protein  22.37 
 
 		 827 aa  101  3e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2520  glycoside hydrolase family protein  25.36 
 
 		 925 aa  102  3e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05361  beta-1,4-mannosidase (Eurofung)  25.16 
 
 		 644 aa  101  4e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.124619  normal  0.368896 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3903  Beta-galactosidase  26.36 
 
 		 1063 aa  100  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.120366  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1292  Beta-galactosidase  26.45 
 
 		 862 aa  100  7e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.016367  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2025  Beta-glucuronidase  26.55 
 
 		 603 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0602766  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1825  beta-D-glucuronidase  26.55 
 
 		 603 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0815  beta-galactosidase  27.75 
 
 		 804 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.57434  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2013  beta-D-glucuronidase  26.55 
 
 		 603 aa  100  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.73903 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3173  beta-D-galactosidase  29.11 
 
 		 1029 aa  99  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00462554  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2041  Beta-glucuronidase  21.67 
 
 		 601 aa  99.8  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00438067  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4139  Beta-galactosidase  26.87 
 
 		 1129 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.852691 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0530  Beta-galactosidase  23.61 
 
 		 591 aa  99.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1692  beta-D-glucuronidase  26.55 
 
 		 603 aa  99.4  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4039  glycoside hydrolase family 2 sugar binding protein  27.92 
 
 		 811 aa  99  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0580  glycoside hydrolase family protein  24.04 
 
 		 1077 aa  98.6  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1386  Beta-glucuronidase  26.24 
 
 		 558 aa  98.6  3e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3313  beta-D-glucuronidase  25.87 
 
 		 603 aa  98.2  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1670  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  22.84 
 
 		 598 aa  97.8  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4225  glycoside hydrolase family protein  25.93 
 
 		 951 aa  97.4  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.812558  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  27.27 
 
 		 1015 aa  97.4  8e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0928  beta-D-galactosidase  26.14 
 
 		 1028 aa  97.1  9e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000620353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1016  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  25.12 
 
 		 805 aa  97.1  9e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2842  Beta-glucuronidase  27.09 
 
 		 568 aa  96.3  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0277834  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0290  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  24.35 
 
 		 986 aa  95.9  2e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1582  beta-D-glucuronidase  26.12 
 
 		 603 aa  95.1  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3338  glycoside hydrolase family protein  23.69 
 
 		 781 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0252466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1285  Beta-galactosidase/beta-glucuronidase-like  26.46 
 
 		 824 aa  95.1  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0951  glycoside hydrolase family 2 TIM barrel  23.62 
 
 		 741 aa  94.7  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  2.87628e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1804  beta-D-glucuronidase  25.91 
 
 		 603 aa  94.7  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.521015  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0106  Beta-galactosidase  26.78 
 
 		 815 aa  94.7  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0375  beta-D-galactosidase  26.91 
 
 		 1024 aa  94.4  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000167859  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1457  glycoside hydrolase family 2 immunoglobulin domain protein beta-sandwich  30.67 
 
 		 940 aa  94.7  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2111  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  28.47 
 
 		 787 aa  94  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2038  Beta-galactosidase  23.51 
 
 		 1046 aa  93.6  9e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2086  Beta-glucuronidase  27.68 
 
 		 512 aa  93.2  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000473091  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>