191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0573 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0573  carboxynorspermidine decarboxylase  100 
 
 		 391 aa  804    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2515  carboxynorspermidine decarboxylase  67.85 
 
 		 390 aa  541  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721977  normal  0.472801 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1532  carboxynorspermidine decarboxylase  67.82 
 
 		 405 aa  539  9.999999999999999e-153  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2319  carboxynorspermidine decarboxylase  64.23 
 
 		 389 aa  508  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2538  carboxynorspermidine decarboxylase  61.54 
 
 		 400 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0903  carboxynorspermidine decarboxylase  60.48 
 
 		 384 aa  478  1e-134  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000370822 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0982  carboxynorspermidine decarboxylase  60.21 
 
 		 384 aa  475  1e-133  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1677  carboxynorspermidine decarboxylase  59.15 
 
 		 384 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000607636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2096  carboxynorspermidine decarboxylase  59.68 
 
 		 397 aa  462  1e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0124  carboxynorspermidine decarboxylase  58.6 
 
 		 406 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1921  carboxynorspermidine decarboxylase  60.1 
 
 		 378 aa  458  9.999999999999999e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.380806  hitchhiker  0.00337134 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2609  carboxynorspermidine decarboxylase  59.63 
 
 		 392 aa  458  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1556  carboxynorspermidine decarboxylase  56.4 
 
 		 376 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000119518  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1129  carboxynorspermidine decarboxylase  54.57 
 
 		 382 aa  457  1e-127  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2917  carboxynorspermidine decarboxylase  56.5 
 
 		 384 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1308  carboxynorspermidine decarboxylase  57.29 
 
 		 384 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000618886 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1596  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  53.63 
 
 		 387 aa  443  1e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00157002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3051  carboxynorspermidine decarboxylase  52.33 
 
 		 379 aa  434  1e-120  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6505  carboxynorspermidine decarboxylase  53.89 
 
 		 399 aa  417  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.136453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1180  carboxynorspermidine decarboxylase  47.92 
 
 		 382 aa  378  1e-104  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477804  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1317  carboxynorspermidine decarboxylase  50.89 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03352  Carboxynorspermidine decarboxylase  49.34 
 
 		 376 aa  375  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.16649  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1153  carboxynorspermidine decarboxylase  46.11 
 
 		 385 aa  370  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  0.177678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3524  carboxynorspermidine decarboxylase  48.03 
 
 		 386 aa  362  8e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0747  carboxynorspermidine decarboxylase  46.7 
 
 		 375 aa  349  4e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4441  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  47.57 
 
 		 390 aa  346  3e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1792  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  47.36 
 
 		 399 aa  343  2e-93  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0396  carboxynorspermidine decarboxylase  43.38 
 
 		 380 aa  343  2.9999999999999997e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000394285  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1198  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  45.78 
 
 		 390 aa  342  5e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2141  carboxynorspermidine decarboxylase  43.98 
 
 		 379 aa  342  8e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1688  carboxynorspermidine decarboxylase  40.72 
 
 		 382 aa  330  2e-89  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0811745  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0338  carboxynorspermidine decarboxylase  40.31 
 
 		 377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1082  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  45.73 
 
 		 390 aa  326  4.0000000000000003e-88  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177671 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0118  carboxynorspermidine decarboxylase  40 
 
 		 408 aa  326  6e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1507  carboxynorspermidine decarboxylase  40.46 
 
 		 382 aa  325  7e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1867  carboxynorspermidine decarboxylase  39.95 
 
 		 382 aa  323  3e-87  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2140  carboxynorspermidine decarboxylase  44.47 
 
 		 380 aa  318  7.999999999999999e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1657  carboxynorspermidine decarboxylase  44.17 
 
 		 400 aa  311  2e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0238429 
 
 
-
 
NC_002950  PG0152  carboxynorspermidine decarboxylase  42.41 
 
 		 378 aa  309  5.9999999999999995e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0354  carboxynorspermidine decarboxylase  38.96 
 
 		 387 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.434135  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0334  carboxynorspermidine decarboxylase  40.11 
 
 		 365 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0351  carboxynorspermidine decarboxylase  39.84 
 
 		 365 aa  280  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0437  carboxynorspermidine decarboxylase  40.26 
 
 		 389 aa  280  4e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378018  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2126  carboxynorspermidine decarboxylase  38.52 
 
 		 365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.934479  normal  0.236457 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1716  carboxynorspermidine decarboxylase  39.03 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00171564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1381  carboxynorspermidine decarboxylase  37.73 
 
 		 365 aa  271  1e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000914545  normal  0.67918 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2843  carboxynorspermidine decarboxylase  38.26 
 
 		 365 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.239369 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4156  carboxynorspermidine decarboxylase  40 
 
 		 365 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0736127  normal  0.854388 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2929  carboxynorspermidine decarboxylase  37.99 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2763  carboxynorspermidine decarboxylase  37.99 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5843  carboxynorspermidine decarboxylase  38.79 
 
 		 365 aa  264  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.883697  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0987  carboxynorspermidine decarboxylase  37.2 
 
 		 365 aa  263  3e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.728912  hitchhiker  0.0000164001 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2883  carboxynorspermidine decarboxylase  38.62 
 
 		 365 aa  263  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1474  putative carboxynorspermidine decarboxylase protein  38.36 
 
 		 365 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0125  carboxynorspermidine decarboxylase  38.1 
 
 		 365 aa  255  7e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.416541 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2956  carboxynorspermidine decarboxylase  38.68 
 
 		 368 aa  254  2.0000000000000002e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.64779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0913  pyridoxal-dependent decarboxylase  35.12 
 
 		 417 aa  251  2e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1502  Orn/DAP/Arg decarboxylase 2  34.56 
 
 		 414 aa  248  9e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0029  carboxynorspermidine decarboxylase  35.16 
 
 		 365 aa  246  4.9999999999999997e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2136  carboxynorspermidine decarboxylase  34.02 
 
 		 381 aa  241  1e-62  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0231313  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0795  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  38.03 
 
 		 1055 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0550  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  38.03 
 
 		 1113 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0661  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  38.03 
 
 		 1086 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1615  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  38.03 
 
 		 1058 aa  241  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374514  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0479  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  38.03 
 
 		 1076 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.303637  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2063  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  38.03 
 
 		 1110 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1968  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein /carboxynorspermidine decarboxylase  38.03 
 
 		 1134 aa  240  4e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278028  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1230  carboxynorspermidine decarboxylase  35.01 
 
 		 387 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000654114  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02739  hypothetical protein  33.68 
 
 		 377 aa  228  9e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003103  carboxynorspermidine decarboxylase putative  33.95 
 
 		 377 aa  228  1e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0984903  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2290  carboxynorspermidine decarboxylase  33.07 
 
 		 376 aa  228  2e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2593  carboxynorspermidine decarboxylase  36.22 
 
 		 375 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1746  diaminopimelate decarboxylase  23.08 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.147436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  27.12 
 
 		 420 aa  61.2  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  25.62 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3059  diaminopimelate decarboxylase  23.76 
 
 		 431 aa  58.9  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.038181  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  25.26 
 
 		 415 aa  58.2  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  24.48 
 
 		 414 aa  58.2  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  25.25 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0318  diaminopimelate decarboxylase  24.02 
 
 		 394 aa  57.4  0.0000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.833211 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0729  diaminopimelate decarboxylase  26.17 
 
 		 421 aa  56.6  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2991  diaminopimelate decarboxylase  20.05 
 
 		 435 aa  56.6  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000347646  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2967  diaminopimelate decarboxylase  22.6 
 
 		 409 aa  55.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2384  diaminopimelate decarboxylase  26.17 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.193755  normal  0.99015 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2448  diaminopimelate decarboxylase  26.58 
 
 		 421 aa  55.8  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.147668  normal  0.347917 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  24.23 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1600  diaminopimelate decarboxylase  27.01 
 
 		 422 aa  55.1  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.458641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  22.94 
 
 		 434 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  22.66 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  22.59 
 
 		 417 aa  53.5  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_475  diaminopimelate decarboxylase  24.23 
 
 		 434 aa  53.5  0.000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  25.86 
 
 		 415 aa  53.5  0.000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0745  diaminopimelate decarboxylase  23 
 
 		 440 aa  53.1  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.300133  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3289  diaminopimelate decarboxylase  21.68 
 
 		 410 aa  53.1  0.000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.721852 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  24.5 
 
 		 418 aa  52.4  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2942  diaminopimelate decarboxylase  21.2 
 
 		 430 aa  52  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000269013  normal  0.385916 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  22.98 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  24.57 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  24.57 
 
 		 414 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0322  diaminopimelate decarboxylase  24.22 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475449  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>