More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1801 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 216 aa  437  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0425  transcriptional regulator, TetR family  40.1 
 
 		 199 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.154596 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 191 aa  128  6e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 192 aa  123  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2028  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 194 aa  116  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.937171  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2002  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 191 aa  112  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0595533  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 189 aa  97.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2329  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 186 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000143879 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1987  TetR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3127  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 187 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 225 aa  58.2  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3888  TetR family transcriptional regulator  22.84 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0944552  normal  0.0941974 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2627  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5533  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.445482  normal  0.987341 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3617  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4750  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0204514 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 219 aa  55.1  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4654  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 199 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0425  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.752712  normal  0.122961 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0679  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 211 aa  54.7  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0314  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1017  repressor protein  27.62 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2337  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 191 aa  54.3  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000766652  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0538  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 254 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0057  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.62 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0609  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.62 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.780096  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2443  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.62 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0852  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.62 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0857  multidrug efflux pump repressor protein BpeR  27.62 
 
 		 211 aa  53.9  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  27.88 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1906  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.812491 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2508  TetR family transcriptional regulator  22.88 
 
 		 195 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0332011  normal  0.924216 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3926  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 258 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4259  regulatory protein TetR  27.56 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.344931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2079  transcriptional regulator, TetR family  31.5 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.674297  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  53.06 
 
 		 220 aa  52.8  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 205 aa  52.8  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 183 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7097  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 206 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 219 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  22.89 
 
 		 241 aa  52  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4630  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 206 aa  52  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.110827  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 217 aa  51.6  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3937  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 185 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0170  TetR family transcriptional regulator  26.27 
 
 		 233 aa  51.6  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000323068 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9308  putative transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 231 aa  51.6  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0733541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  48.98 
 
 		 286 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2617  transcriptional regulator, TetR family  37.33 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000000311719  normal  0.0685304 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  27.85 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3871  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 235 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05966  hypothetical protein  44.68 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2692  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.728372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1714  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 		 211 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.058675  normal  0.0438262 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  44.68 
 
 		 242 aa  51.2  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2015  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.997895  normal  0.682792 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 248 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 218 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1307  transcriptional regulator, TetR family  26.62 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0245614  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1543  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 238 aa  50.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.176522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 214 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5316  transcriptional regulator, TetR family  31.86 
 
 		 215 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.505659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  38 
 
 		 246 aa  50.4  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1742  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.666045  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  24.67 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2872  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4133  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.110099 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1988  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2602  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.157273  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4597  TetR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 217 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00568004 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0081  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5785  TetR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.558716 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3723  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 187 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000134359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  25.21 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1921  transcriptional regulator, TetR family  27.97 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0409606  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1604  AcrR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 221 aa  50.1  0.00003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.388293  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 195 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 194 aa  49.7  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2815  transcriptional regulator, TetR family  36.9 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000266483 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>