More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3726 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3726  hypothetical protein  100 
 
 		 222 aa  461  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.01295  hitchhiker  0.00196674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3720  YD repeat-containing protein  86.41 
 
 		 1301 aa  194  9e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.148361  decreased coverage  0.000379992 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3724  Rhs family protein-like protein  89.8 
 
 		 285 aa  185  4e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0108015  hitchhiker  0.00111387 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3727  hypothetical protein  76.7 
 
 		 187 aa  166  2e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00259449  hitchhiker  0.0064722 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2437  YD repeat-containing protein  41.54 
 
 		 690 aa  92.4  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0941  YD repeat protein  53.66 
 
 		 1467 aa  88.2  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.125138  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0748  RhsC protein  32.11 
 
 		 1397 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0727  protein rhsA precursor  32.11 
 
 		 1397 aa  86.3  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2955  YD repeat-containing protein  32.11 
 
 		 1397 aa  85.9  4e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2936  YD repeat protein  32.11 
 
 		 1397 aa  85.9  5e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2322  YD repeat-containing protein  42 
 
 		 913 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.330208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0130  Rhs family protein-like protein  50.59 
 
 		 303 aa  84  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2441  hypothetical protein  54.55 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00355  putative RHS-related transmembrane protein  41.58 
 
 		 741 aa  82  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00658  rhsC element core protein RshC  32.11 
 
 		 554 aa  81.6  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05526  putative RHS-related protein  40.95 
 
 		 705 aa  81.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2298  YD repeat protein  44.68 
 
 		 1338 aa  79.7  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04849  RhsD protein  41.51 
 
 		 917 aa  80.1  0.00000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0148662  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0252  RHS Repeat family protein  43.52 
 
 		 1410 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.661469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20520  hypothetical protein  41.24 
 
 		 903 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000061545  normal  0.488224 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0548  RhsC protein  56.25 
 
 		 1308 aa  79.3  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03331  rhsB element core protein RshB  60 
 
 		 1411 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0233  YD repeat protein  60 
 
 		 1411 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3681  RhsB protein  60 
 
 		 1411 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03284  hypothetical protein  60 
 
 		 1411 aa  79.3  0.00000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0234  YD repeat-containing protein  60 
 
 		 1411 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4092  protein rhsB precursor  60 
 
 		 1411 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.576153  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2213  RhsD protein precursor  62.3 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.017753  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04760  putative RHS-related protein  36.07 
 
 		 788 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05695  putative RHS-related protein  36.07 
 
 		 788 aa  78.6  0.00000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3233  YD repeat protein  37.8 
 
 		 1639 aa  78.6  0.00000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.471244  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05537  putative RHS-related protein  42 
 
 		 764 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.285743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4010  protein rhsA precursor  54.41 
 
 		 1388 aa  77.4  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0173  Rhs family protein  57.38 
 
 		 1381 aa  78.2  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03448  rhsA element core protein RshA  32.53 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0115  YD repeat protein  57.38 
 
 		 1377 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0794  RHS repeat protein  51.39 
 
 		 1399 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03399  hypothetical protein  32.53 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0120  YD repeat-containing protein  57.38 
 
 		 1377 aa  77  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0368  YD repeat-containing protein  39.42 
 
 		 1520 aa  77  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.268176  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0403  YD repeat-containing protein  51.95 
 
 		 1390 aa  77  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4965  Rhs family protein  54.41 
 
 		 1409 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.832182  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00908  putative RSH-related protein  39.09 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.303359 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2443  YD repeat-containing protein  48.05 
 
 		 927 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1946  YD repeat-containing protein  53.73 
 
 		 1433 aa  76.6  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.465933  normal  0.94223 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0246  Rhs protein  57.38 
 
 		 1415 aa  76.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0330  RHS/YD repeat-containing protein  52.63 
 
 		 1402 aa  76.3  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.581458  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0254  RhsG core protein with extension  50 
 
 		 502 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.814194 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0333  RHS/YD repeat-containing protein  51.32 
 
 		 1418 aa  75.9  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1235  hypothetical protein  48.65 
 
 		 1405 aa  75.5  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.617923 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01414  rhsE element core protein RshE  57.38 
 
 		 1200 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2190  RHS protein  57.38 
 
 		 682 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0179088  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4473  protein rhsA precursor  56.67 
 
 		 1365 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01426  hypothetical protein  57.38 
 
 		 1216 aa  75.1  0.0000000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03450  predicted Rhs-family protein  54.41 
 
 		 314 aa  74.7  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1826  Rhs family protein  48.53 
 
 		 1429 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.831768  normal  0.546607 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3802  Rhs family protein  54.41 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.276743  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5395  RHS Repeat family protein  56.67 
 
 		 1394 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.037802  normal  0.495388 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4094  RHS domain-containing protein  54.41 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.700312  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0384  YD repeat-containing protein  53.85 
 
 		 1550 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0258  RHS Repeat family protein  59.02 
 
 		 586 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03401  hypothetical protein  54.41 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0118  RHS protein  54.41 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.604872  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00448  rhsD element protein  59.32 
 
 		 1426 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00660  conserved protein, rhs-like protein  53.97 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2934  RHS protein  53.97 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.375887  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3113  YD repeat protein  59.32 
 
 		 1426 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.637043  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00453  hypothetical protein  59.32 
 
 		 1426 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0536  RhsD protein precursor  59.32 
 
 		 1429 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0749  RHS repeat-containing protein  53.97 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00294679  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1403  substrate-binding repeat-containing protein  53.97 
 
 		 1541 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00651  hypothetical protein  53.97 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2293  RhsD protein  57.38 
 
 		 187 aa  73.9  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4426  Rhs family protein  41.18 
 
 		 1362 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.479042 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0244  protein RhsH  46.99 
 
 		 1417 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1945  YD repeat-containing protein  48.05 
 
 		 605 aa  73.6  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.312246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0601  RHS Repeat family protein  57.63 
 
 		 1398 aa  73.6  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5681  RHS protein  38.61 
 
 		 1609 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2953  RHS protein  53.97 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.944321  normal  0.880791 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4008  YD repeat-containing protein  52.46 
 
 		 1791 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0728  RHS domain-containing protein  53.97 
 
 		 477 aa  73.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2201  YD repeat-containing protein  53.97 
 
 		 1268 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0347  YD repeat protein  49.41 
 
 		 1379 aa  73.2  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5510  YD repeat-containing protein  38.38 
 
 		 1390 aa  73.2  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.162905  normal  0.931179 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0437  YD repeat-containing protein  48.72 
 
 		 598 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.161008 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1322  substrate-binding repeat-containing protein  52.38 
 
 		 1541 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2570  YD repeat-containing protein  52.38 
 
 		 1541 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1059  YD repeat-containing protein  52.38 
 
 		 1541 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0509  YD repeat-containing protein  52.38 
 
 		 1541 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0575036  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0321  Rhs family protein  41.84 
 
 		 1359 aa  72.4  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.73436  hitchhiker  0.000636537 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4081  YD repeat-containing protein  56.67 
 
 		 713 aa  72.4  0.000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0238  YD repeat-containing protein  52.38 
 
 		 1541 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.691901  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1266  YD repeat-containing protein  52.38 
 
 		 1381 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2813  YD repeat protein  54.55 
 
 		 1673 aa  72  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0360  guanine-specific ribonuclease N1 and T1  44.79 
 
 		 306 aa  71.6  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1653  YD repeat-containing protein  54.1 
 
 		 1251 aa  71.6  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000538479 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1434  YD repeat-containing protein  52.38 
 
 		 1553 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.16383  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1667  YD repeat-containing protein  58.62 
 
 		 1199 aa  71.6  0.000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.620432 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1825  Rhs family protein  40.2 
 
 		 190 aa  71.6  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.337988  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2818  YD repeat protein  44.05 
 
 		 1679 aa  71.6  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>