91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2134 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2134  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 		 412 aa  830    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.331611 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2954  hypothetical protein  35.97 
 
 		 415 aa  183  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.189818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3394  hypothetical protein  26.15 
 
 		 407 aa  89.7  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3822  Extracellular ligand-binding receptor  25.6 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000102798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4244  Extracellular ligand-binding receptor  30 
 
 		 411 aa  58.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0432  Extracellular ligand-binding receptor  26.27 
 
 		 412 aa  57.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.290998  normal  0.0381447 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7650  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  22.7 
 
 		 395 aa  57.4  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1739  extracellular ligand-binding receptor  31.97 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.152869 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0038  extracellular ligand-binding receptor  30.33 
 
 		 406 aa  56.2  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1740  extracellular ligand-binding receptor  25.52 
 
 		 435 aa  55.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.398941  normal  0.157953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  35.09 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0583  Extracellular ligand-binding receptor  29.51 
 
 		 406 aa  55.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.981919  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3559  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 		 418 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0888701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7080  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  26.39 
 
 		 404 aa  53.9  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.476664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3240  urea ABC transporter, urea binding protein  34.23 
 
 		 405 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00360419  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0121  extracellular ligand-binding receptor  29.51 
 
 		 406 aa  53.5  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.455844 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1898  extracellular ligand-binding receptor  24.42 
 
 		 411 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.193262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5667  putative Leu/Ile/Val/Thr-binding protein precursor; putative signal peptide  22.37 
 
 		 447 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7651  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  28.46 
 
 		 415 aa  50.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99279  normal  0.165016 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3560  extracellular ligand-binding receptor  29.51 
 
 		 411 aa  50.8  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.726041  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8852  amino acid/amide ABC transporter substrate- binding protein, HAAT family  21.24 
 
 		 448 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1005  extracellular ligand-binding receptor  23.4 
 
 		 407 aa  50.1  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4245  ABC transporter substrate-binding protein  28.69 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0701  extracellular ligand-binding receptor  25.19 
 
 		 423 aa  50.1  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.161591  normal  0.175564 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 		 385 aa  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1848  extracellular ligand-binding receptor  26.25 
 
 		 389 aa  50.1  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0671771  normal  0.122571 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2379  Extracellular ligand-binding receptor  20.62 
 
 		 397 aa  49.7  0.00009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0666  ABC transporter substrate-binding protein  28.69 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.112312 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1322  extracellular ligand-binding receptor  24.1 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0679703  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3566  extracellular ligand-binding receptor  28.33 
 
 		 411 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172998  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7081  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  26.19 
 
 		 407 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5560  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  24.29 
 
 		 408 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2148  extracellular ligand-binding receptor  33.62 
 
 		 390 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.7 
 
 		 425 aa  48.9  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1941  Extracellular ligand-binding receptor  23.57 
 
 		 416 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2001  Extracellular ligand-binding receptor  27.5 
 
 		 411 aa  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1650  extracellular ligand-binding receptor  24.85 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.154413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3964  Extracellular ligand-binding receptor  42.68 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7082  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  27.92 
 
 		 407 aa  48.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4381  Extracellular ligand-binding receptor  22.57 
 
 		 407 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5154  putative branched-chain amino acid ABC transport system substrate-binding protein  27.12 
 
 		 399 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210774  normal  0.0422274 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1738  leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  27.05 
 
 		 409 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0827731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2733  Extracellular ligand-binding receptor  30.17 
 
 		 407 aa  47.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0668  extracellular ligand-binding receptor  32.82 
 
 		 392 aa  46.6  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.431771  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3208  Extracellular ligand-binding receptor  23.08 
 
 		 376 aa  47  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4103  extracellular ligand-binding receptor  25.62 
 
 		 401 aa  47  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.742112  normal  0.0857946 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4000  Extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 		 403 aa  46.6  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0874  putative amino-acid ABC transport system, periplasmic binding protein  24.68 
 
 		 406 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.034766  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3839  extracellular ligand-binding receptor  42.5 
 
 		 405 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2445  Extracellular ligand-binding receptor  22.35 
 
 		 397 aa  46.2  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3562  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  27.05 
 
 		 409 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1979  cytochrome c, putative  27.27 
 
 		 516 aa  46.2  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.67916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3455  putative lipoprotein  25.69 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.235747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3994  extracellular ligand-binding receptor  30.15 
 
 		 339 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000070067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4684  extracellular ligand-binding receptor  29.17 
 
 		 406 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0833  extracellular ligand-binding receptor  29.1 
 
 		 383 aa  45.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000252201  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4549  Extracellular ligand-binding receptor  29.41 
 
 		 393 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0229  Extracellular ligand-binding receptor  35.79 
 
 		 441 aa  45.1  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00108704  normal  0.192891 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0735  extracellular ligand-binding receptor  24.82 
 
 		 385 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3347  amino acid/amide ABC transporter substrate- binding protein, HAAT family  19.95 
 
 		 466 aa  45.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.716666  normal  0.862215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3823  Extracellular ligand-binding receptor  25.2 
 
 		 394 aa  45.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00025514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2778  urea ABC transporter, urea binding protein  26.67 
 
 		 418 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  26.98 
 
 		 399 aa  45.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4923  extracellular ligand-binding receptor  23.75 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000164326 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4269  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  19.24 
 
 		 438 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000244738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3317  Extracellular ligand-binding receptor  24.93 
 
 		 401 aa  44.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4745  extracellular ligand-binding receptor  23.75 
 
 		 378 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000119526 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4867  extracellular ligand-binding receptor  23.75 
 
 		 378 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0924005  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3679  extracellular ligand-binding receptor  22.16 
 
 		 407 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5294  putative ABC-type branched-chain amino acid transporter, periplasmic binding protein  26.89 
 
 		 406 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  30.33 
 
 		 419 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0352  extracellular ligand-binding receptor  21.64 
 
 		 410 aa  44.3  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  34.67 
 
 		 384 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4246  Extracellular ligand-binding receptor  25.41 
 
 		 409 aa  44.3  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2248  Extracellular ligand-binding receptor  25.83 
 
 		 410 aa  43.9  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4018  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like  21.63 
 
 		 481 aa  43.9  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2131  extracellular ligand-binding receptor  32.11 
 
 		 379 aa  43.5  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0617424  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1594  Extracellular ligand-binding receptor  21.99 
 
 		 394 aa  43.9  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4394  extracellular ligand-binding receptor  26.05 
 
 		 406 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1861  Extracellular ligand-binding receptor  23.65 
 
 		 379 aa  43.5  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.571716  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0752  extracellular ligand-binding receptor  20.19 
 
 		 405 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.284007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3561  extracellular ligand-binding receptor  30.86 
 
 		 409 aa  43.5  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4659  extracellular ligand-binding receptor  23.44 
 
 		 378 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580673 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4069  extracellular ligand-binding receptor  31.07 
 
 		 393 aa  43.1  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.236469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7508  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  26.92 
 
 		 384 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3498  urea ABC transporter, urea binding protein  34.65 
 
 		 419 aa  43.1  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4361  extracellular ligand-binding receptor  34.62 
 
 		 438 aa  43.1  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000367621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3798  extracellular ligand-binding receptor  29.36 
 
 		 402 aa  42.7  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1557  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  32 
 
 		 441 aa  43.1  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1674  urea ABC transporter, urea binding protein  31.37 
 
 		 407 aa  43.1  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0482  extracellular ligand-binding receptor  22.55 
 
 		 412 aa  43.1  0.01  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>