More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4381 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4381  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
407 aa  817    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6099  Extracellular ligand-binding receptor  36.34 
 
 
390 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2793  Extracellular ligand-binding receptor  37.5 
 
 
412 aa  217  2.9999999999999998e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0849253 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2636  Extracellular ligand-binding receptor  36.94 
 
 
422 aa  215  9.999999999999999e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0870735 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5345  extracellular ligand-binding receptor  30.73 
 
 
390 aa  169  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040092  normal  0.403221 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4487  extracellular ligand-binding receptor  27.61 
 
 
384 aa  140  4.999999999999999e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00567759  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3294  hypothetical protein  28.19 
 
 
383 aa  127  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.953272  normal  0.0380984 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3728  extracellular ligand-binding receptor  30.3 
 
 
392 aa  113  6e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.172455  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0805  Extracellular ligand-binding receptor  25.99 
 
 
384 aa  107  3e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.822655  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2019  extracellular ligand-binding receptor  27.42 
 
 
374 aa  106  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3057  Extracellular ligand-binding receptor  24.09 
 
 
398 aa  106  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2556  branched chain amino acid ABC transporter (substrate-binding protein)  25.26 
 
 
392 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00169682  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4416  extracellular ligand-binding receptor  24.36 
 
 
402 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.859568  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0932  Extracellular ligand-binding receptor  23.58 
 
 
376 aa  99.8  7e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000568006  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4261  ABC branched chain amino acid transporter, periplasmic ligand binding protein  24.65 
 
 
404 aa  97.4  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2240  extracellular ligand-binding receptor  25.51 
 
 
394 aa  95.9  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4416  Extracellular ligand-binding receptor  24.08 
 
 
404 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4395  Extracellular ligand-binding receptor  24.36 
 
 
404 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.817669  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0398  ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  27.72 
 
 
391 aa  92.4  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000849541  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0523  Extracellular ligand-binding receptor  23.69 
 
 
390 aa  92  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0215267  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2306  Extracellular ligand-binding receptor  24.65 
 
 
419 aa  90.1  6e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.110917  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1388  Extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
390 aa  90.1  6e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0615347  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0611  Extracellular ligand-binding receptor  24.44 
 
 
371 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2020  extracellular ligand-binding receptor  24.79 
 
 
384 aa  88.6  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.168799 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5391  Extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
417 aa  87.8  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.59544  normal  0.2602 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2502  extracellular ligand-binding receptor  23.64 
 
 
399 aa  87.8  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.101059  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1720  extracellular ligand-binding receptor  23.86 
 
 
396 aa  87.8  4e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.565956  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0635  Extracellular ligand-binding receptor  26.16 
 
 
378 aa  87  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0000043194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3401  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  23.55 
 
 
396 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.232513  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0486  extracellular ligand-binding receptor  23.81 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.853674  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1582  branched-chain amino acid ABC transporter, amino acid-binding protein  23.87 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000809144  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1392  Extracellular ligand-binding receptor  26.58 
 
 
382 aa  83.6  0.000000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.54413  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1429  Extracellular ligand-binding receptor  22.05 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0505624  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2113  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  22.08 
 
 
399 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2306  extracellular ligand-binding receptor  24.03 
 
 
376 aa  82.8  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2935  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
386 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.412779  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2663  putative UreA/short-chain amide transport system substrate-binding protein precursor  25.24 
 
 
412 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0749447  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3328  extracellular ligand-binding receptor  23.68 
 
 
366 aa  82  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0862  extracellular ligand-binding receptor  26.16 
 
 
375 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05343  hypothetical protein  22.4 
 
 
391 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0836  extracellular ligand-binding receptor  23.25 
 
 
390 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0783302 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1175  extracellular ligand-binding receptor  25.08 
 
 
371 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.343144  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1050  extracellular ligand-binding receptor  26.11 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.464924 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1141  extracellular ligand-binding receptor  25.08 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.209837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1139  urea ABC transporter, urea binding protein  26.04 
 
 
413 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1131  extracellular ligand-binding receptor  25.83 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3202  putative aliphatic amidase expression-regulating protein, amiC  24.16 
 
 
412 aa  77  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.836908 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0727  extracellular ligand-binding receptor  26.99 
 
 
370 aa  76.6  0.0000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0014  branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein, putative  23.32 
 
 
368 aa  75.5  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1775  twin-arginine translocation pathway signal  23.28 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.185236  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1310  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.77 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.381196  normal  0.934076 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1065  Extracellular ligand-binding receptor  25.71 
 
 
381 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000196823  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1681  extracellular ligand-binding receptor  23.75 
 
 
385 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.681493  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1934  Extracellular ligand-binding receptor  22.62 
 
 
397 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000937878  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0809  Extracellular ligand-binding receptor  25.08 
 
 
414 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3905  extracellular ligand-binding receptor  23.87 
 
 
388 aa  73.9  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.504593  normal  0.521585 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0514  extracellular ligand-binding receptor  26.3 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1741  Extracellular ligand-binding receptor  23.53 
 
 
375 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.734186  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3020  putative urea/short-chain amide transport system substrate-binding protein  23.27 
 
 
412 aa  73.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.692302 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4127  extracellular ligand-binding receptor  24.86 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.515914  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0012  putative branched-chain amino acid ABC transporter, perisplasmic amino acid-binding protein  23.32 
 
 
368 aa  73.2  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.318461  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1111  branched-chain amino-acid ABC transporter, periplasmic binding protein  21.1 
 
 
371 aa  73.2  0.000000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3322  putative UreA/short-chain amide transport system substrate-binding protein precursor  24.6 
 
 
415 aa  72.8  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.12992  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4910  extracellular ligand-binding receptor  25.23 
 
 
397 aa  72.8  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4276  extracellular ligand-binding receptor  24.22 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1200  urea ABC transporter, urea binding protein  25.44 
 
 
413 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5900  extracellular ligand-binding receptor  25.83 
 
 
384 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.137338 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1137  Extracellular ligand-binding receptor  25.09 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0165472  normal  0.816566 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3597  extracellular ligand-binding receptor  25.12 
 
 
398 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1158  extracellular ligand-binding receptor  24.22 
 
 
371 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0616664  normal  0.0422789 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3836  extracellular ligand-binding receptor  25.63 
 
 
410 aa  72.8  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.335848  normal  0.119891 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3551  extracellular ligand-binding receptor  24.63 
 
 
389 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6487  extracellular ligand-binding receptor  23.71 
 
 
415 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.203833  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4303  branched-chain amino acid transport protein BraC  25 
 
 
373 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0095  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.37 
 
 
399 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.237273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1360  urea ABC transporter, urea binding protein  25.44 
 
 
413 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396806  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5857  extracellular ligand-binding receptor  23.92 
 
 
411 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.101493  normal  0.03083 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0042  extracellular ligand-binding receptor  23.81 
 
 
368 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.538449  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1443  urea ABC transporter, urea binding protein  23.59 
 
 
420 aa  71.2  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1248  extracellular ligand-binding receptor  22.83 
 
 
375 aa  70.5  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1490  Extracellular ligand-binding receptor  24.42 
 
 
372 aa  70.5  0.00000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000299787  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2862  urea ABC transporter, urea binding protein  24.72 
 
 
443 aa  70.5  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2491  extracellular ligand-binding receptor  22.54 
 
 
373 aa  70.5  0.00000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.946067  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3937  extracellular ligand-binding receptor  24.42 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.108497  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50520  branched-chain amino acid transport protein BraC  25 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592692 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3583  extracellular ligand-binding receptor  24.42 
 
 
397 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.160701  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2733  Extracellular ligand-binding receptor  23.05 
 
 
407 aa  69.7  0.00000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1387  extracellular ligand-binding receptor  23.61 
 
 
373 aa  69.7  0.00000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.279691 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2205  extracellular ligand-binding receptor  26.17 
 
 
393 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3572  ABC transporter substrate-binding protein  24.28 
 
 
422 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.536665  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2428  Extracellular ligand-binding receptor  22.31 
 
 
381 aa  68.9  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.632762  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3864  amide-urea binding protein  24.66 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2283  Extracellular ligand-binding receptor  23.04 
 
 
395 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000119381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3017  extracellular ligand-binding receptor  27.44 
 
 
426 aa  69.3  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2086  Extracellular ligand-binding receptor  22.7 
 
 
372 aa  68.9  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4646  extracellular ligand-binding receptor  23.45 
 
 
384 aa  69.7  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7952  Extracellular ligand-binding receptor  22.6 
 
 
384 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351177  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3381  ABC transporter substrate-binding protein  24.28 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3690  urea ABC transporter, urea binding protein  24.28 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5317  extracellular ligand-binding receptor  24.19 
 
 
397 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.862776  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>