158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1143 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  100 
 
 		 523 aa  1089    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  58.46 
 
 		 532 aa  605  9.999999999999999e-173  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3545  Alpha-N-arabinofuranosidase  52.15 
 
 		 547 aa  538  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0270111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  53.48 
 
 		 546 aa  526  1e-148  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.789253 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  50.28 
 
 		 550 aa  511  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.6 
 
 		 541 aa  489  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  48.07 
 
 		 537 aa  476  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  48.52 
 
 		 541 aa  478  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  47.88 
 
 		 537 aa  474  1e-132  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  48.03 
 
 		 540 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  44.93 
 
 		 514 aa  455  1e-127  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0457  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.55 
 
 		 539 aa  438  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0354643 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3334  Alpha-N-arabinofuranosidase  44.61 
 
 		 536 aa  433  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.783434  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2996  Alpha-N-arabinofuranosidase  42.46 
 
 		 559 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  43.78 
 
 		 539 aa  410  1e-113  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2504  Xylan 1,4-beta-xylosidase  38.45 
 
 		 558 aa  376  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1291  Beta-xylosidase  35.75 
 
 		 553 aa  341  2e-92  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0848  Beta-xylosidase  35.08 
 
 		 552 aa  334  2e-90  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.168219  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2518  glycoside hydrolase family protein  37.21 
 
 		 516 aa  306  7e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  35.76 
 
 		 512 aa  301  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  38.14 
 
 		 512 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  35.59 
 
 		 519 aa  283  6.000000000000001e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1400  glycoside hydrolase family 43  34.34 
 
 		 517 aa  250  6e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.587173  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  32.21 
 
 		 636 aa  249  1e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3011  Alpha-N-arabinofuranosidase  32.97 
 
 		 538 aa  246  6e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  33.33 
 
 		 563 aa  246  9e-64  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4322  glycoside hydrolase family protein  33.09 
 
 		 581 aa  241  2e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0842  Alpha-L-arabinofuranosidase  33.08 
 
 		 546 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.122484  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0598  Alpha-L-arabinofuranosidase  31.79 
 
 		 577 aa  231  2e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  34.46 
 
 		 497 aa  231  3e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20520  beta-xylosidase  34.67 
 
 		 542 aa  231  3e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.129044  normal  0.254652 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1655  translation initiation factor IF-1  32.12 
 
 		 566 aa  230  5e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0976225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3048  Alpha-N-arabinofuranosidase  31.31 
 
 		 515 aa  224  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0608814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  38.84 
 
 		 484 aa  217  2.9999999999999998e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2699  glycoside hydrolase family 43  31.42 
 
 		 496 aa  213  4.9999999999999996e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.276179  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  32.75 
 
 		 492 aa  205  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1423  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.94 
 
 		 558 aa  203  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.423704 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2028  glycoside hydrolase family protein  30.26 
 
 		 498 aa  200  3.9999999999999996e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03855  xylosidase; arabinosidase  30.96 
 
 		 556 aa  195  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  39.74 
 
 		 497 aa  194  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  40.88 
 
 		 488 aa  193  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  40.75 
 
 		 526 aa  188  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0431  glycoside hydrolase family protein  39.25 
 
 		 451 aa  185  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2532  glycoside hydrolase family 43  38.98 
 
 		 586 aa  180  7e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3880  glycoside hydrolase family protein  27.51 
 
 		 571 aa  176  9.999999999999999e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08477  xylosidase : arabinofuranosidase (AFU_orthologue; AFUA_2G13190)  29.33 
 
 		 546 aa  174  2.9999999999999996e-42  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06751  glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G06110)  32.57 
 
 		 591 aa  168  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.326162 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3042  twin-arginine translocation pathway signal  33.41 
 
 		 537 aa  163  8.000000000000001e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.351967  normal  0.568346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4021  glycoside hydrolase family protein  29.21 
 
 		 537 aa  157  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.701147 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4249  glycoside hydrolase family protein  28.39 
 
 		 532 aa  154  2.9999999999999998e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158619  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2914  glycoside hydrolase family protein  29.77 
 
 		 547 aa  153  8.999999999999999e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3522  glycoside hydrolase family protein  32.23 
 
 		 534 aa  149  1.0000000000000001e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653851  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4289  glycoside hydrolase family protein  27.65 
 
 		 572 aa  149  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.786059  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3718  glycoside hydrolase family protein  28.63 
 
 		 504 aa  147  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.456589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  34.95 
 
 		 511 aa  143  6e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  28.34 
 
 		 536 aa  141  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3622  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.21 
 
 		 540 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.573352  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  28.37 
 
 		 551 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3811  glycoside hydrolase family 43  28.04 
 
 		 535 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1435  glycoside hydrolase family 43  25.41 
 
 		 545 aa  134  5e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2044  beta-xylosidase/alpha-L-arabinofuranosidase- like protein  25.76 
 
 		 1474 aa  133  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  30.55 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.3 
 
 		 562 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  29.07 
 
 		 746 aa  130  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0700  glycoside hydrolase family 43  28.05 
 
 		 522 aa  130  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1251  glycoside hydrolase family protein  27.29 
 
 		 665 aa  128  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  27.6 
 
 		 525 aa  124  4e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3237  glycoside hydrolase family protein  27.14 
 
 		 1195 aa  124  6e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.414155 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2108  glycoside hydrolase family 43  24.48 
 
 		 650 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000141623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  29.77 
 
 		 1338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  27.4 
 
 		 522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0935  glycoside hydrolase family 43  28.02 
 
 		 522 aa  120  7.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1068  glycoside hydrolase family 43  26.58 
 
 		 797 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000256501  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  27.67 
 
 		 543 aa  118  3e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2114  glycoside hydrolase family 43  26.8 
 
 		 518 aa  115  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.554254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1420  glycoside hydrolase family 43  28.25 
 
 		 530 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.394008  normal  0.931127 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1879  beta-xylosidase  27.02 
 
 		 590 aa  109  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  29.15 
 
 		 527 aa  106  9e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2413  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 		 521 aa  106  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.333908  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3302  glycoside hydrolase family 43  27.05 
 
 		 532 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00567592  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3875  glycoside hydrolase family protein  25.05 
 
 		 518 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  29.19 
 
 		 1585 aa  100  5e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  27.17 
 
 		 495 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3618  glycoside hydrolase family protein  25.13 
 
 		 508 aa  98.6  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000797588  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  26.1 
 
 		 522 aa  98.2  3e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  23.32 
 
 		 501 aa  95.5  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1257  glycoside hydrolase family 43  27.32 
 
 		 500 aa  94.7  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  25.43 
 
 		 472 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  26.9 
 
 		 524 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1280  glycoside hydrolase family 43  24.24 
 
 		 691 aa  87.4  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.286369  hitchhiker  0.00183728 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03261  xylosidase  27.59 
 
 		 365 aa  85.1  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.687612  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07275  xylosidase/glycosyl hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G00930)  25.54 
 
 		 503 aa  81.6  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000188631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  30.39 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  29.03 
 
 		 304 aa  77.4  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1661  endo-1,4-beta-xylanase/Beta-xylosidase  26.63 
 
 		 901 aa  76.6  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  25.3 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01043  conserved hypothetical protein  36.84 
 
 		 343 aa  72.8  0.00000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  28.08 
 
 		 324 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  25.71 
 
 		 330 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  28.62 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>