141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4331 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_4331  amidohydrolase 2  100 
 
 
326 aa  676    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.639652  normal  0.0344092 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4525  amidohydrolase 2  44.31 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.273896  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3105  amidohydrolase 2  37.54 
 
 
317 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0508507  normal  0.867387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1036  amidohydrolase 2  41.82 
 
 
340 aa  211  1e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105862  normal  0.443407 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3500  amidohydrolase 2  35.33 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0215706 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3785  amidohydrolase 2  36.59 
 
 
320 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07911  conserved hypothetical protein  36.03 
 
 
331 aa  186  3e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2602  amidohydrolase 2  34.22 
 
 
336 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2656  amidohydrolase 2  34.22 
 
 
336 aa  186  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2054  amidohydrolase 2  36.17 
 
 
336 aa  187  3e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.452903  normal  0.40157 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02118  conserved hypothetical protein  35.44 
 
 
337 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4292  amidohydrolase 2  35.84 
 
 
331 aa  182  8.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0258  amidohydrolase 2  32.95 
 
 
326 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5311  amidohydrolase 2  33.53 
 
 
325 aa  177  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.523586  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5726  amidohydrolase 2  33.43 
 
 
326 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2061  amidohydrolase 2  34.43 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00000112186  normal  0.166362 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0060  amidohydrolase 2  30.66 
 
 
358 aa  172  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3061  amidohydrolase 2  33.43 
 
 
330 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.491062  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1503  o-pyrocatechuate decarboxylase  30.27 
 
 
330 aa  155  7e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06723  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G05840)  32.12 
 
 
338 aa  155  8e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2163  amidohydrolase  33.55 
 
 
297 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0799  amidohydrolase 2  30.16 
 
 
351 aa  149  8e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2603  hypothetical protein  29.97 
 
 
339 aa  140  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1683  amidohydrolase 2  29.31 
 
 
372 aa  103  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.617368  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2152  2-amino-3-carboxymuconate-6-semialdehyde decarboxylase  27.88 
 
 
345 aa  103  6e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2308  amidohydrolase 2  26.3 
 
 
354 aa  102  1e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00976958 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5929  amidohydrolase 2  28.24 
 
 
338 aa  97.8  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.901897  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7137  amidohydrolase 2  28.33 
 
 
350 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.032027  normal  0.227522 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0847  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.69 
 
 
350 aa  90.5  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2293  amidohydrolase 2  29.18 
 
 
312 aa  89.7  7e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0594  hypothetical protein  27.46 
 
 
361 aa  87.8  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.114324  normal  0.2203 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1788  amidohydrolase 2  26.67 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5604  amidohydrolase 2  26.97 
 
 
336 aa  87.4  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.210789  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1616  amidohydrolase 2  27.53 
 
 
323 aa  87  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2820  amidohydrolase 2  27.78 
 
 
313 aa  85.5  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00050  iso-orotate decarboxylase (Eurofung)  24.63 
 
 
381 aa  82  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0110807  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3521  amidohydrolase 2  24.33 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3896  amidohydrolase 2  24.75 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.271019 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2274  amidohydrolase 2  31.12 
 
 
335 aa  80.1  0.00000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.345046  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4912  amidohydrolase 2  26.98 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2240  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.72 
 
 
339 aa  78.2  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4213  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.89 
 
 
342 aa  77  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.634881  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0292  metal-dependent hydrolase of the TIM-barrel fold  21.33 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.951151  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3548  amidohydrolase 2  22.99 
 
 
358 aa  75.9  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9109  tryptophan 2,3-dioxygenase  25.86 
 
 
323 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0650  putative hydrolase  24.04 
 
 
364 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60927  normal  0.264449 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1929  amidohydrolase 2  25.17 
 
 
358 aa  72.8  0.000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.51746  normal  0.799765 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4794  amidohydrolase 2  23.61 
 
 
334 aa  69.7  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0707579  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4102  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.79 
 
 
383 aa  68.2  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.13287  normal  0.0312348 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3524  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.94 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.635162  normal  0.292382 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4307  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.03 
 
 
351 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0158  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.92 
 
 
346 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2549  amidohydrolase 2  24.12 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.910264  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5140  amidohydrolase 2  22.65 
 
 
334 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.073212 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3888  amidohydrolase 2  23.15 
 
 
339 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2313  amidohydrolase 2  25.23 
 
 
353 aa  65.1  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3063  amidohydrolase 2  22.61 
 
 
333 aa  63.9  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.249503 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1832  amidohydrolase 2  23.49 
 
 
348 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5776  amidohydrolase 2  23.84 
 
 
337 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2814  amidohydrolase 2  24.62 
 
 
341 aa  60.8  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162302  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0682  tryptophan 2,3-dioxygenase  23.08 
 
 
629 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.431731  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4761  amidohydrolase 2  26.96 
 
 
357 aa  60.8  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.174286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4454  amidohydrolase 2  24.13 
 
 
393 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5503  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.38 
 
 
337 aa  60.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5915  amidohydrolase 2  22.15 
 
 
395 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.366016  normal  0.0743655 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1808  amidohydrolase 2  23.62 
 
 
337 aa  60.1  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0190647 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3833  amidohydrolase 2  24.07 
 
 
336 aa  59.3  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.183747  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3097  amidohydrolase 2  24.83 
 
 
279 aa  59.3  0.00000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4901  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  26.14 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4262  hypothetical protein  26.16 
 
 
365 aa  58.5  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7640  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  23.31 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6458  amidohydrolase 2  22.67 
 
 
366 aa  58.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0823861  normal  0.151509 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2697  4-oxalomesaconate hydratase  21.32 
 
 
341 aa  58.5  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.745573  normal  0.611025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3602  hypothetical protein  25.38 
 
 
410 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110191  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3274  amidohydrolase 2  23.89 
 
 
343 aa  57  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000324384 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6117  amidohydrolase 2  23.49 
 
 
349 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2147  amidohydrolase 2  23.96 
 
 
286 aa  56.6  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3915  amidohydrolase 2  21.05 
 
 
353 aa  56.2  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0150149  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2721  metal-dependent hydrolase  20.21 
 
 
356 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.277634  normal  0.08915 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1931  amidohydrolase 2  23.51 
 
 
342 aa  56.2  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.502037  normal  0.58926 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3705  4-oxalomesaconate hydratase  22.09 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0366284 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1407  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  20.28 
 
 
339 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03238  4-oxalomesaconate hydratase  23.53 
 
 
340 aa  54.7  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1753  amidohydrolase 2  20.89 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1617  amidohydrolase 2  23.51 
 
 
389 aa  53.5  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.927592  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0619  amidohydrolase 2  27.02 
 
 
402 aa  53.5  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.6071  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0987  amidohydrolase 2  21.11 
 
 
342 aa  53.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0849631  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0383  amidohydrolase 2  27.41 
 
 
413 aa  53.5  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.885201  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5178  amidohydrolase 2  21.11 
 
 
342 aa  53.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2314  putative 4-oxalomesaconate hydratase  22.03 
 
 
349 aa  52.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.44483  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2954  amidohydrolase 2  24.29 
 
 
316 aa  52.8  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4717  Aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  22.97 
 
 
358 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5738  amidohydrolase 2  22.83 
 
 
362 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0877  amidohydrolase 2  20.37 
 
 
342 aa  52.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.51327  normal  0.385928 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0621  putative hydrolase  24.04 
 
 
341 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.148858 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5743  amidohydrolase 2  22 
 
 
342 aa  51.2  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.311436  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5212  aminocarboxymuconate-semialdehyde decarboxylase  20.42 
 
 
333 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.473622  normal  0.325543 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3322  amidohydrolase 2  23.86 
 
 
395 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.883646 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2987  amidohydrolase 2  20.97 
 
 
315 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.390637  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1956  amidohydrolase 2  20.3 
 
 
321 aa  49.7  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.0037729  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>