More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2183 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2183  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 		 778 aa  1615    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480779  normal  0.0613811 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0595  outer membrane protein A  25.06 
 
 		 734 aa  206  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00808098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0109  OmpA/MotB domain protein  30.21 
 
 		 585 aa  171  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.012333  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5272  OmpA/MotB domain protein  28.41 
 
 		 613 aa  162  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00153444  normal  0.0517848 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1699  OmpA/MotB domain protein  29.62 
 
 		 650 aa  159  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1647  OmpA/MotB domain-containing protein  30.36 
 
 		 666 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5752  OmpA/MotB domain protein  28.76 
 
 		 677 aa  157  6e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.219859  normal  0.716064 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04495  OmpA family protein  28.54 
 
 		 626 aa  156  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.30865  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4338  OmpA/MotB domain protein  30 
 
 		 648 aa  153  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.553848 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3950  OmpA/MotB domain-containing protein  28.67 
 
 		 653 aa  150  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2715  peptidoglycan-associated lipoprotein  25.55 
 
 		 673 aa  149  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0234601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1311  OmpA/MotB domain protein  29.5 
 
 		 757 aa  148  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.191554  normal  0.469378 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4540  OmpA/MotB domain-containing protein  29.75 
 
 		 643 aa  146  1e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1700  OmpA/MotB domain protein  28.95 
 
 		 660 aa  145  3e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3584  OmpA/MotB domain protein  33.85 
 
 		 798 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.302775  normal  0.682864 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3476  OmpA/MotB domain-containing protein  29.69 
 
 		 645 aa  143  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.41488  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13643  OmpA family protein  28.38 
 
 		 665 aa  141  4.999999999999999e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.830628  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2275  OmpA/MotB domain-containing protein  34.09 
 
 		 712 aa  139  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3973  OmpA/MotB domain-containing protein  27.62 
 
 		 642 aa  137  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5203  OmpA/MotB domain protein  28.11 
 
 		 668 aa  137  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.543853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4945  OmpA/MotB domain protein  27.1 
 
 		 813 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3625  WD40 domain protein beta Propeller  27.98 
 
 		 471 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.13359  hitchhiker  0.000473153 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1796  outer membrane protein 3a  44.74 
 
 		 903 aa  127  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.446296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  42.26 
 
 		 631 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  37.95 
 
 		 638 aa  117  8.999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3744  OmpA/MotB domain protein  43.54 
 
 		 679 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000811796  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01035  OmpA family protein  40.41 
 
 		 630 aa  115  4.0000000000000004e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0125  outer membrane protein, peptidoglycan-associated lipoprotein  37.23 
 
 		 656 aa  115  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.40578 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1558  outer membrane protein  40.36 
 
 		 519 aa  114  5e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0547  OmpA/MotB domain protein  27.31 
 
 		 671 aa  114  7.000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1561  OmpA family outer membrane protein  38.46 
 
 		 641 aa  111  5e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.322672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2714  outer membrane protein  34.13 
 
 		 648 aa  108  4e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.882447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1781  OmpA/MotB domain protein  37.91 
 
 		 658 aa  107  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.973049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1741  OmpA/MotB domain protein  32.32 
 
 		 586 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2198  OmpA/MotB domain protein  25.26 
 
 		 594 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000013848  decreased coverage  0.000000000020207 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1710  OmpA family peptidoglycan-associated lipoprotein  39.76 
 
 		 640 aa  105  4e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00224676  normal  0.770798 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1325  hypothetical protein  35.9 
 
 		 656 aa  102  4e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.532479 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  38.04 
 
 		 620 aa  97.4  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  37.59 
 
 		 710 aa  96.3  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1713  outer membrane protein  33.75 
 
 		 631 aa  92.8  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0180372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  39.26 
 
 		 630 aa  90.5  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_002950  PG1058  OmpA family protein  29.9 
 
 		 672 aa  88.6  4e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0880702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  33.81 
 
 		 704 aa  74.3  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2993  outer membrane protein  29.8 
 
 		 712 aa  72  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2084  WD40 domain protein beta Propeller  37.61 
 
 		 293 aa  70.1  0.0000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243995 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  35.86 
 
 		 509 aa  70.5  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  35.96 
 
 		 670 aa  70.9  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3541  OmpA/MotB  29.57 
 
 		 193 aa  68.6  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.09094e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0313  OmpA/MotB domain-containing protein  38.78 
 
 		 537 aa  67.4  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0125359  hitchhiker  0.00574347 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0217  outer membrane protein, porin F precursor  32.59 
 
 		 669 aa  67.4  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.440167 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0490  OmpA/MotB domain-containing protein  41.98 
 
 		 200 aa  66.6  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0962072  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0393  OmpA/MotB domain protein  32.93 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  38.75 
 
 		 623 aa  64.7  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5107  OmpA/MotB domain protein  31.52 
 
 		 673 aa  64.7  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0634849 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4295  OmpA/MotB domain-containing protein  35.78 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.331314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  36.46 
 
 		 296 aa  63.9  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0024  OmpA domain-containing protein  29.01 
 
 		 194 aa  63.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000404844  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1705  OmpA/MotB domain protein  27.93 
 
 		 340 aa  63.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.597429  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0181  OmpA/MotB domain protein  34.45 
 
 		 263 aa  63.2  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.833655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02523  OmpA family outer membrane protein  38.46 
 
 		 365 aa  62.4  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.654383  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1454  outer membrane protein  31.76 
 
 		 504 aa  62.8  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.298256  normal  0.596382 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  31.37 
 
 		 537 aa  62.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0202  OmpA/MotB domain-containing protein  32.48 
 
 		 194 aa  62.4  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000181939  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1121  OmpA/MotB domain protein  34.86 
 
 		 230 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.372182  hitchhiker  0.00000554839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1157  OmpA/MotB domain-containing protein  34.86 
 
 		 230 aa  62  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02820  hypothetical protein  32.84 
 
 		 263 aa  62  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0282  OmpA/MotB domain protein  38.89 
 
 		 230 aa  62  0.00000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000802819  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  37.11 
 
 		 294 aa  61.6  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2769  OmpA/MotB domain protein  34.29 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0363  OmpA/MotB domain-containing protein  37.35 
 
 		 167 aa  60.8  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.658698  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3173  OmpA/MotB  34.4 
 
 		 230 aa  60.5  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08086  hypothetical protein  30.09 
 
 		 366 aa  60.5  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1805  OmpA/OmpF family outer membrane protein  38.03 
 
 		 217 aa  59.7  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0695  OmpA/MotB  33.09 
 
 		 165 aa  60.1  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0519  OmpA/MotB domain-containing protein  28.19 
 
 		 199 aa  60.1  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2087  OmpA/MotB  38.03 
 
 		 217 aa  59.7  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3101  OmpA/MotB  32.11 
 
 		 230 aa  59.3  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.282577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  36.84 
 
 		 525 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  37.65 
 
 		 266 aa  58.9  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  33.02 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_013061  Phep_4274  OmpA/MotB domain protein  39.02 
 
 		 568 aa  58.9  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.24355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1947  OmpA/MotB domain protein  39.08 
 
 		 490 aa  58.9  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  normal  0.0242284 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06262  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  59.3  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03195  Thrombospondin type 3 repeat:OmpA/MotB  35.9 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.889374  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  33.33 
 
 		 321 aa  58.9  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  32.99 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0908  OmpA/MotB domain-containing protein  34.57 
 
 		 224 aa  58.5  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.685511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1142  OmpA/MotB domain-containing protein  33.03 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.679829 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2359  peptidoglycan-associated lipoprotein  33.64 
 
 		 170 aa  58.2  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.12328 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3675  OmpA/MotB domain-containing protein  38.27 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000026276  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48650  OmpA/MotB family protein  28.99 
 
 		 261 aa  57.8  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0700  OmpA/MotB domain protein  38.27 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0709  OmpA/MotB domain-containing protein  38.27 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000940918  normal  0.29399 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0679  OmpA/MotB domain-containing protein  38.27 
 
 		 230 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0519812  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2347  OmpA/MotB  32.38 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0708  OmpA/MotB domain-containing protein  37.04 
 
 		 228 aa  57.8  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.808623  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1770  WD40 domain protein beta Propeller  30.43 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.332161 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0800  OmpA/MotB domain protein  35.37 
 
 		 362 aa  57.4  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.193954  normal  0.0761778 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  33.03 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0823  OmpA/MotB  44.59 
 
 		 248 aa  57.4  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>