221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0785 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0785  peptidase M28  100 
 
 		 301 aa  621  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.164886 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3007  peptidase M28  48.73 
 
 		 318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.191323 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3463  peptidase M28  45.42 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.25105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1025  peptidase M28  38.21 
 
 		 319 aa  209  5e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.409556 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3713  peptidase M28  36.01 
 
 		 323 aa  162  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0161881  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0532  peptidase M28  38.13 
 
 		 342 aa  152  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2702  M28 family peptidase  33.85 
 
 		 325 aa  152  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0637  peptidase M28  37.68 
 
 		 352 aa  149  5e-35  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.40358  normal  0.0226987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3594  peptidase M28  34.54 
 
 		 346 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0567  peptidase M28  33.1 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3316  peptidase M28  34.8 
 
 		 341 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0540148  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0529  peptidase M28  33.55 
 
 		 346 aa  144  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0584  peptidase M28  32.66 
 
 		 398 aa  144  2e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4032  hypothetical protein  36.98 
 
 		 347 aa  144  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0553  peptidase M28  32 
 
 		 384 aa  143  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2047  peptidase M28  34.31 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3423  peptidase M28  33.22 
 
 		 346 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3756  peptidase M28  31.31 
 
 		 386 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0346  peptidase M28  34.24 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0132197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0578  peptidase M28  31.89 
 
 		 393 aa  136  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0371405 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4028  peptidase M28  33.86 
 
 		 353 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000100923 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2381  peptidase M28  31 
 
 		 407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.534474 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2670  peptidase M28  32.44 
 
 		 330 aa  122  6e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6610  peptidase M28  31.12 
 
 		 315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.431289  normal  0.0352472 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4661  peptidase M28  29.19 
 
 		 341 aa  117  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0862  peptidase M28  31.09 
 
 		 574 aa  112  7.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.104433  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08756  aminopeptidase  30.55 
 
 		 334 aa  112  8.000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1583  peptidase M28  36.63 
 
 		 424 aa  112  9e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0469907 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0600  peptidase M28  36.15 
 
 		 555 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284248 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0032  aminopeptidase  36.02 
 
 		 394 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0112983  normal  0.0236971 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3899  peptidase M28  34.72 
 
 		 674 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0513  peptidase M28  35.71 
 
 		 341 aa  107  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.95991 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3822  peptidase M28  31.03 
 
 		 528 aa  107  3e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.116923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0546  peptidase M28  31.88 
 
 		 579 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.62656  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0017  peptidase M28  39.63 
 
 		 546 aa  104  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5214  peptidase M28  31.28 
 
 		 531 aa  100  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3483  peptidase M28  33.33 
 
 		 598 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4102  peptidase M28  31.75 
 
 		 420 aa  101  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0454  peptidase M28  27.31 
 
 		 325 aa  100  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5038  peptidase M28  35.68 
 
 		 944 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.705528 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1287  peptidase M28  38.81 
 
 		 529 aa  99.4  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.132857  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02720  putative Glutamate carboxypeptidase II  34.62 
 
 		 555 aa  97.8  2e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3397  peptidase M28  30.2 
 
 		 546 aa  97.1  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4201  peptidase M28  33.16 
 
 		 346 aa  97.1  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.920242  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1866  peptidase M28  32.67 
 
 		 503 aa  95.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.139821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2954  peptidase M28  32.79 
 
 		 547 aa  94.7  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000316234  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0092  peptidase M28  40.12 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3091  M23B family peptidase  33.7 
 
 		 552 aa  94  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.141544  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0474  peptidase M28  31.48 
 
 		 422 aa  94  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2197  peptidase M28  33.64 
 
 		 541 aa  93.2  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2274  peptidase M28  33.64 
 
 		 541 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.362777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1832  peptidase M28  32.06 
 
 		 540 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.018471  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2445  peptidase M28  32.06 
 
 		 532 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00447449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1880  peptidase M28  32.06 
 
 		 540 aa  92  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0206545  normal  0.978624 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1031  peptidase M28  33.51 
 
 		 563 aa  91.3  2e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.418542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2407  peptidase M28  33.18 
 
 		 541 aa  90.9  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.438723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2846  peptidase M28  34.21 
 
 		 623 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0223512  normal  0.0909725 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0419  peptidase M28  32.76 
 
 		 549 aa  90.5  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0797301 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1020  aminopeptidase  29.17 
 
 		 533 aa  90.5  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2198  aminopeptidase  33.18 
 
 		 506 aa  90.1  4e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00045  probable aminopeptidase  31.31 
 
 		 545 aa  90.1  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1101  aminopeptidase  31.43 
 
 		 529 aa  90.1  4e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.252939 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1742  peptidase M28  35.57 
 
 		 532 aa  89.7  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3653  peptidase M28  33.17 
 
 		 506 aa  89  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0164431 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1846  peptidase M28  31.46 
 
 		 540 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0255812  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4272  peptidase M28  36.67 
 
 		 552 aa  88.2  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.43547 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0359  peptidase M28  33.14 
 
 		 567 aa  87.8  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.48939  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08546  Probable aminopeptidase  34.65 
 
 		 491 aa  88.2  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0029  peptidase M28  30.56 
 
 		 548 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.204643  normal  0.983563 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1952  peptidase M28  30.6 
 
 		 552 aa  87.4  3e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0806  peptidase M28  31.92 
 
 		 563 aa  87  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.661029 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4866  peptidase M28  35.43 
 
 		 539 aa  87  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.846109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1045  peptidase M28  32.09 
 
 		 560 aa  85.1  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.268975 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2592  peptidase M28  31.82 
 
 		 528 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03544  peptidase  33.71 
 
 		 603 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2030  M20/M25/M40 family peptidase  33.33 
 
 		 552 aa  84.3  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.236841  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2401  peptidase M28  33.33 
 
 		 549 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2521  peptidase M28  29.01 
 
 		 551 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.536283  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1510  peptidase M28  32.96 
 
 		 553 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0562258  normal  0.317169 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1252  peptidase M28  41.44 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000518672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1604  peptidase M28  31.22 
 
 		 552 aa  82.8  0.000000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000577255  n/a   
 
 
 
NC_011071  Smal_0301  peptidase M28  34.07 
 
 		 571 aa  82.8  0.000000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.613732  decreased coverage  0.00132855 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2825  peptidase M28  31.45 
 
 		 539 aa  82.4  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.741116  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1459  peptidase M28  28.57 
 
 		 1103 aa  82.4  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.246557  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2436  peptidase M28  34.94 
 
 		 548 aa  81.3  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2383  peptidase M28  31.52 
 
 		 557 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2455  peptidase M28  31.52 
 
 		 557 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.548528  normal  0.0292846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0655  peptidase M28  38.74 
 
 		 550 aa  80.5  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.215111  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2548  peptidase M28  31.52 
 
 		 557 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0139782  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04145  aminopeptidase  29.49 
 
 		 549 aa  79.7  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0405  peptidase M28  31.73 
 
 		 550 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.446061  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1727  peptidase M28  29.11 
 
 		 558 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00112053  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0042  peptidase M28  30.34 
 
 		 552 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1770  peptidase M28  29.11 
 
 		 558 aa  79.3  0.00000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0255993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2100  hypothetical protein  31.32 
 
 		 542 aa  79  0.00000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.544432 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2766  hypothetical protein  29.89 
 
 		 522 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0660  hypothetical protein  28.13 
 
 		 568 aa  78.6  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.61826 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1593  peptidase M28  29.89 
 
 		 557 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000339237  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0652  hypothetical protein  28.23 
 
 		 591 aa  77.8  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1732  peptidase M28  30.43 
 
 		 558 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00148499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>