More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2766 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2766  MATE efflux family protein  100 
 
 		 453 aa  906    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0984562  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0279  MATE efflux family protein  39.04 
 
 		 445 aa  327  4.0000000000000003e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2514  MATE efflux family protein  37.05 
 
 		 463 aa  323  4e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2828  MATE efflux family protein  36.83 
 
 		 463 aa  322  6e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1981  MATE efflux family protein  35.62 
 
 		 455 aa  297  2e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0830  MATE efflux family protein  36.26 
 
 		 445 aa  295  1e-78  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.000000918772  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0621  MATE efflux family protein  35.06 
 
 		 460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.27098  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0897  MATE efflux family protein  36.85 
 
 		 453 aa  280  4e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000262958  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1138  MATE efflux family protein  34.75 
 
 		 450 aa  278  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000318212  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0848  MATE efflux family protein  35.19 
 
 		 458 aa  273  6e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.720761  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0857  MATE efflux family protein  35.19 
 
 		 458 aa  272  1e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1116  MATE efflux family protein  33.78 
 
 		 456 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0330  MATE efflux family protein  34.97 
 
 		 479 aa  259  6e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05715  Na+-driven multidrug efflux pump  33.33 
 
 		 461 aa  249  9e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2022  multidrug efflux pump  33.55 
 
 		 459 aa  249  1e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.54695  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000109  adhesin  33.19 
 
 		 461 aa  248  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.466925  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0522  MATE efflux family protein  31.96 
 
 		 461 aa  244  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1237  hypothetical protein  31.28 
 
 		 458 aa  240  2.9999999999999997e-62  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0290804  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02650  hypothetical protein  32.3 
 
 		 458 aa  239  5.999999999999999e-62  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003772  Na+ driven multidrug efflux pump  31.8 
 
 		 458 aa  236  7e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0994  MATE efflux family protein  31.58 
 
 		 449 aa  229  1e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0537  hypothetical protein  30.67 
 
 		 460 aa  218  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3712  MATE efflux family protein  32.22 
 
 		 454 aa  195  1e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0743  MATE efflux family protein  29.54 
 
 		 484 aa  186  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000192336  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2425  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 461 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.264518  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2475  MATE efflux family protein  26.13 
 
 		 463 aa  150  6e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.211957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  25.38 
 
 		 453 aa  146  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0596  hypothetical protein  28.84 
 
 		 449 aa  142  9.999999999999999e-33  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.207285  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 464 aa  134  3e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  25.62 
 
 		 464 aa  134  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0981  MATE efflux family protein  23.76 
 
 		 456 aa  128  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.730082  normal  0.0880752 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  23.49 
 
 		 469 aa  127  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0597  hypothetical protein  23.46 
 
 		 444 aa  127  6e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0691  MATE efflux family protein  26.59 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4103  Na+ driven multidrug efflux pump  26.45 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0660054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2630  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 472 aa  124  3e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18490  MATE efflux family protein  24.56 
 
 		 442 aa  124  3e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000174233  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1415  MATE efflux family protein  26.56 
 
 		 466 aa  123  7e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.167041 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  26.74 
 
 		 468 aa  123  7e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1343  MATE efflux family protein  25 
 
 		 464 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000317655  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5035  MATE efflux family protein  24.68 
 
 		 469 aa  121  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.88746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0901  MATE efflux family protein  24.59 
 
 		 463 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000627796  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1106  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 464 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000560081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1088  efflux protein  24.77 
 
 		 464 aa  121  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000024435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1082  efflux protein  24.77 
 
 		 464 aa  121  3e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000125629  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0764  MATE family efflux pump NorM  25.23 
 
 		 451 aa  120  3e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1196  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 464 aa  121  3e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000655029  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 458 aa  121  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2423  MATE efflux family protein  25.23 
 
 		 451 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0441886  normal  0.25868 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1266  MATE efflux family protein  24.77 
 
 		 464 aa  119  9e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1305  MATE efflux family protein  25.12 
 
 		 464 aa  119  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.40401  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0723  multidrug resistance protein  25.28 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1239  MATE efflux family protein  25.75 
 
 		 464 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.238085  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1506  MATE efflux family protein  24.73 
 
 		 450 aa  117  3e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1094  MATE efflux family protein  24.18 
 
 		 464 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000923462  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0651  MATE efflux family protein  25.6 
 
 		 446 aa  117  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000388571  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0299  MATE efflux family protein  26.83 
 
 		 456 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000180901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0162  MATE efflux family protein  29.45 
 
 		 486 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  25.66 
 
 		 445 aa  113  6e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0427  MATE efflux family protein  23.66 
 
 		 446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.744275  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1269  multidrug efflux protein  23.6 
 
 		 453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.801506  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0411  MATE efflux family protein  25.77 
 
 		 453 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1501  multidrug efflux protein  24.15 
 
 		 454 aa  110  5e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3419  MATE efflux family protein  25.71 
 
 		 504 aa  110  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1267  multidrug efflux protein  23.36 
 
 		 453 aa  110  6e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1472  multidrug efflux protein  23.11 
 
 		 453 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1295  multidrug efflux protein  22.87 
 
 		 453 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0578421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1402  multidrug efflux protein  22.87 
 
 		 453 aa  107  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4055  MATE efflux family protein  26.44 
 
 		 483 aa  107  5e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0254154 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3909  multidrug efflux protein  23.36 
 
 		 452 aa  106  7e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3565  MATE efflux family protein  23.88 
 
 		 452 aa  106  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  22.86 
 
 		 438 aa  106  8e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0536  mate efflux family protein  22.81 
 
 		 440 aa  106  8e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1199  MATE efflux family protein  25.24 
 
 		 450 aa  106  8e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0538393  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2243  MATE efflux family protein  25.5 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1435  multidrug efflux protein  23.36 
 
 		 452 aa  103  6e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.602082  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  24.78 
 
 		 453 aa  103  7e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  21.35 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  21.35 
 
 		 469 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0998  MATE efflux family protein  23.44 
 
 		 500 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.280475  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  22 
 
 		 469 aa  101  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1659  hypothetical protein  20.95 
 
 		 495 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.000000439345  normal  0.0451104 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  24.5 
 
 		 462 aa  101  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0687  DNA damage inducible protein - mate transporter family  23.41 
 
 		 540 aa  100  4e-20  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  22 
 
 		 469 aa  100  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  22 
 
 		 469 aa  100  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  22 
 
 		 469 aa  100  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4023  putative transporter  23.17 
 
 		 477 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.343891  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1109  multidrug efflux protein  22.81 
 
 		 452 aa  100  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.654532  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2267  hypothetical protein  20.72 
 
 		 546 aa  100  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000010697  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46680  putative transporter  23.17 
 
 		 477 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.013844  hitchhiker  0.0000129498 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01896  predicted multidrug efflux system  20.72 
 
 		 547 aa  100  7e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0202846  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  25.11 
 
 		 492 aa  100  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1139  hypothetical protein  20.72 
 
 		 484 aa  100  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000023845  hitchhiker  0.0000334983 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01885  hypothetical protein  20.72 
 
 		 547 aa  100  7e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0187925  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1669  MATE efflux family protein  20.72 
 
 		 495 aa  99.8  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000135228  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  22.22 
 
 		 469 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1225  multidrug efflux pump, NorM, MATE family  22.93 
 
 		 455 aa  99  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000329619  normal  0.0233556 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4462  MATE efflux family protein  27.18 
 
 		 470 aa  99.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  22.66 
 
 		 469 aa  99  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>