107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1175 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1175  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 348 aa  727    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.913807  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2384  Radical SAM domain protein  41.72 
 
 		 364 aa  311  2e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0891  hypothetical protein  26.28 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.416371  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0419  radical SAM domain-containing protein  27.69 
 
 		 337 aa  95.5  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3357  radical SAM family protein  25.65 
 
 		 384 aa  88.2  2e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.158709  normal  0.0575022 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3720  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 344 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0048621  normal  0.524582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0858  Radical SAM domain protein  22.13 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3375  radical SAM family protein  33.09 
 
 		 640 aa  80.1  0.00000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1384  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 		 330 aa  79.7  0.00000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.472126  hitchhiker  0.00082809 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1611  Radical SAM domain protein  26.46 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.413154  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2181  hypothetical protein  23.58 
 
 		 355 aa  75.5  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0928383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2162  radical SAM domain-containing protein  23.46 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.211612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0390  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 		 331 aa  70.1  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000824452  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2394  radical SAM domain-containing protein  30.14 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0924  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 		 340 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  30.57 
 
 		 380 aa  60.1  0.00000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  37.29 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  29.19 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  36.11 
 
 		 423 aa  57  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  29.22 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  36.11 
 
 		 423 aa  56.6  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1410  Radical SAM domain protein  24.03 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11712  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0426  Radical SAM domain protein  34.26 
 
 		 420 aa  56.2  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  32.46 
 
 		 384 aa  55.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.03 
 
 		 394 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  28.49 
 
 		 398 aa  54.7  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  36.52 
 
 		 356 aa  55.1  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 		 496 aa  54.7  0.000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4074  Radical SAM domain protein  35.77 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4113  Radical SAM domain protein  35.77 
 
 		 329 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00130178  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1805  radical SAM domain-containing protein  28.47 
 
 		 273 aa  54.3  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.644596  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3799  radical SAM family protein  36.51 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 		 349 aa  53.9  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  35.4 
 
 		 480 aa  53.9  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  33.09 
 
 		 342 aa  53.5  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  27.91 
 
 		 393 aa  53.5  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3059  Radical SAM domain protein  35.14 
 
 		 418 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.699008  normal  0.88782 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1215  Radical SAM domain protein  30.12 
 
 		 367 aa  53.5  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154309  hitchhiker  0.00000759697 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  31.17 
 
 		 333 aa  52.8  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1335  Radical SAM domain protein  45.07 
 
 		 337 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0945  hypothetical protein  35.64 
 
 		 324 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  27.59 
 
 		 359 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 		 327 aa  50.4  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1988  radical SAM family protein  44.93 
 
 		 328 aa  50.1  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.252976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 377 aa  49.7  0.00007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1679  Radical SAM domain protein  32.11 
 
 		 364 aa  49.7  0.00008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.830639 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 316 aa  49.3  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  32.14 
 
 		 390 aa  48.9  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  29.63 
 
 		 491 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1628  putative radical SAM superfamily protein  39.34 
 
 		 320 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00346391  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0829  radical SAM domain-containing protein  42.31 
 
 		 351 aa  48.1  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  24.59 
 
 		 366 aa  48.5  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0900  Radical SAM domain protein  23.74 
 
 		 292 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.39 
 
 		 389 aa  47.8  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  30.13 
 
 		 332 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1862  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 491 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27199  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1743  heme biosynthesis protein  25.26 
 
 		 491 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 		 347 aa  47.4  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0870  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 491 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1157  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 491 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.43485  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0390  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 491 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2134  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 491 aa  47.4  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0509  radical SAM domain-containing protein  35 
 
 		 359 aa  47  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294869  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  29.45 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0792  Radical SAM domain protein  27.84 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  26.5 
 
 		 378 aa  47  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0298  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 491 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  30.77 
 
 		 330 aa  47  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2228  Radical SAM domain protein  33.65 
 
 		 332 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.419306 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1728  Radical SAM domain protein  26.75 
 
 		 380 aa  47  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0999  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 		 399 aa  46.6  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1779  L-asparaginase II  35.35 
 
 		 317 aa  46.2  0.0007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.251936  normal  0.0342174 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2181  radical SAM domain-containing protein  25.26 
 
 		 491 aa  46.6  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.161056  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1611  radical SAM family protein  30.34 
 
 		 320 aa  45.8  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  26.74 
 
 		 399 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2221  hypothetical protein  30.56 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1762  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.68 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.114768 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5552  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 482 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.789613 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0078  hypothetical protein  33.87 
 
 		 314 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0516  radical SAM domain-containing protein  33.87 
 
 		 343 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0941  radical SAM domain-containing protein  27.38 
 
 		 367 aa  44.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.31277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  29.48 
 
 		 349 aa  43.9  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0221  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.33 
 
 		 322 aa  43.9  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  35.48 
 
 		 800 aa  43.9  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2498  Radical SAM domain protein  29.25 
 
 		 402 aa  43.9  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.608052  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0915  Radical SAM domain protein  38.98 
 
 		 351 aa  43.9  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0031  Radical SAM domain protein  26.35 
 
 		 372 aa  43.9  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.082628  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 		 394 aa  43.9  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 330 aa  44.3  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0011  Radical SAM domain protein  29.09 
 
 		 338 aa  43.9  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0638  hypothetical protein  42.37 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06651  Fe-S oxidoreductase  42.37 
 
 		 310 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  29.87 
 
 		 346 aa  43.5  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1583  radical SAM domain-containing protein  26.06 
 
 		 364 aa  43.5  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  29.21 
 
 		 1000 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0459  Radical SAM domain protein  23.28 
 
 		 375 aa  43.1  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000994889  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1160  hypothetical protein  39.34 
 
 		 322 aa  42.7  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0866  L-asparaginase II  38.67 
 
 		 314 aa  42.7  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>