More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0244 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0244  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 187 aa  375  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00255  putative regulatory protein  62.03 
 
 		 187 aa  241  3e-63  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0190  helix-turn-helix domain-containing protein  55.06 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.55176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4951  transcriptional regulator, AraC family  54.59 
 
 		 187 aa  192  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1936  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  51.89 
 
 		 188 aa  186  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0105063 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6599  transcriptional regulator, AraC family  48.65 
 
 		 193 aa  179  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3110  transcriptional regulator, AraC family  48.13 
 
 		 189 aa  174  5e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567517 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1062  AraC family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 193 aa  168  4e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.504746 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3326  AraC family transcriptional regulator  49.45 
 
 		 190 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1512  transcriptional regulator, AraC family  47.31 
 
 		 188 aa  163  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.064462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6868  transcriptional regulator, AraC family  44.62 
 
 		 197 aa  161  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1500  AraC family transcriptional regulator  47.34 
 
 		 192 aa  157  7e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000826989  normal  0.0270775 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6889  transcriptional regulator, AraC family  41.11 
 
 		 200 aa  155  3e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6819  transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 		 188 aa  154  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.632991 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3544  AraC family transcriptional regulator  41.76 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000242227  normal  0.0918221 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2318  helix-turn-helix domain-containing protein  42.31 
 
 		 183 aa  144  8.000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6643  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 		 194 aa  130  7.999999999999999e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.367926 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11748  putative regulatory protein  39.89 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  32.53 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  27.36 
 
 		 261 aa  60.5  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6873  Helix-turn-helix, AraC domain protein  26.71 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 315 aa  58.2  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2914  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  28.08 
 
 		 198 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.431589  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3221  transcriptional regulator, AraC family  28.08 
 
 		 198 aa  57  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1981  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 384 aa  57  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.382238  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0589  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 300 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0682  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2830  helix-turn-helix domain-containing protein  27.38 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  32.56 
 
 		 331 aa  55.1  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2642  transcriptional regulator, AraC family  28.08 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194016 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  37.23 
 
 		 309 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 287 aa  54.7  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 306 aa  54.3  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4367  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 286 aa  54.3  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0906731 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3976  helix-turn-helix domain-containing protein  27.69 
 
 		 336 aa  54.3  0.0000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  32.84 
 
 		 291 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 299 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 262 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 316 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 255 aa  53.9  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0219  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.45 
 
 		 385 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 291 aa  53.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2291  transcriptional regulator, AraC family  32.1 
 
 		 292 aa  53.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2765  transcriptional regulator, AraC family  25.49 
 
 		 270 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0588178  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 315 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  33.73 
 
 		 288 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 315 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 315 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 332 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 154 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 315 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 299 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 312 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 304 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 306 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 306 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2057  helix-turn-helix domain-containing protein  31.34 
 
 		 291 aa  52.4  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 306 aa  52.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  26.47 
 
 		 306 aa  52.8  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  23.83 
 
 		 293 aa  52.8  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0231  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  26.17 
 
 		 342 aa  52.8  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13333  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 291 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5610  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 302 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00190409  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 327 aa  52.4  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  22.16 
 
 		 306 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5827  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 302 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 291 aa  52  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 148 aa  52  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 305 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  24.35 
 
 		 305 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 337 aa  52  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  32.86 
 
 		 156 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  31.76 
 
 		 301 aa  52  0.000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0665  helix-turn-helix domain-containing protein  26.06 
 
 		 270 aa  51.6  0.000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.123814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 146 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  21.74 
 
 		 289 aa  51.6  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 146 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 146 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 310 aa  52  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2987  transcriptional regulator fragment  36.59 
 
 		 111 aa  51.6  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1494  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  34.85 
 
 		 296 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 299 aa  51.6  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5635  transcriptional regulator, AraC family  26.83 
 
 		 282 aa  51.6  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154737  normal  0.936217 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0890  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.37 
 
 		 283 aa  51.6  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312138 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  27.1 
 
 		 308 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 298 aa  51.2  0.000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  34.92 
 
 		 308 aa  51.2  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  34.85 
 
 		 156 aa  51.2  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 308 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 295 aa  51.2  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 306 aa  51.2  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 202 aa  51.2  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0293  two component AraC family transcriptional regulator  27.97 
 
 		 532 aa  51.2  0.000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1138  two component transcriptional regulator, AraC family  32.58 
 
 		 519 aa  51.2  0.000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4136  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 278 aa  51.2  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.322145  normal  0.588482 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3295  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 285 aa  50.8  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 311 aa  50.8  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  23.48 
 
 		 305 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 301 aa  50.4  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>