217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2272 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2272  transcriptional regulator domain protein  100 
 
 		 925 aa  1741    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0573653  hitchhiker  0.00120633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1911  transcriptional regulator domain protein  38.29 
 
 		 990 aa  167  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.345318  decreased coverage  0.000588756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3827  transcriptional regulator domain-containing protein  43.2 
 
 		 1102 aa  151  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0262799 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0921  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  32.45 
 
 		 881 aa  122  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54574  normal  0.164383 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  33.73 
 
 		 1108 aa  110  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2887  transcriptional regulator domain protein  43.15 
 
 		 997 aa  105  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0904649  normal  0.154883 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  31.96 
 
 		 1204 aa  103  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  34.91 
 
 		 1193 aa  99  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  35.47 
 
 		 1190 aa  99  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  32.08 
 
 		 1097 aa  98.6  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  32.5 
 
 		 1163 aa  98.2  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  38.89 
 
 		 999 aa  94.7  7e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  34.69 
 
 		 1145 aa  93.2  2e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  33.61 
 
 		 1018 aa  87.8  9e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  30.43 
 
 		 661 aa  86.3  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  41.46 
 
 		 597 aa  86.3  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  31.8 
 
 		 1083 aa  84.7  0.000000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1895  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.43 
 
 		 867 aa  83.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283939  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4327  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.45 
 
 		 1021 aa  83.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  31.16 
 
 		 561 aa  82  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  30.16 
 
 		 1095 aa  80.9  0.00000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  30.95 
 
 		 1094 aa  80.9  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 423 aa  80.5  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  33.61 
 
 		 1055 aa  79  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5287  two component response regulator  26.62 
 
 		 896 aa  79  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.318061  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3347  transcriptional activator domain-containing protein  32.09 
 
 		 1109 aa  79  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2864  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  32.71 
 
 		 766 aa  79  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.155264  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1678  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.91 
 
 		 910 aa  78.2  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0910  transcriptional activator domain-containing protein  33.92 
 
 		 1064 aa  77  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41800  putative transcriptional regulator  31.07 
 
 		 907 aa  75.5  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1995  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.84 
 
 		 1019 aa  75.1  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.686742  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3547  transcriptional regulator  35.75 
 
 		 907 aa  75.1  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  30.12 
 
 		 775 aa  74.7  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  27.46 
 
 		 572 aa  74.3  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39970  transcriptional regulatory protein AcoK, LuxR family  27.62 
 
 		 900 aa  72  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1584  regulatory protein, LuxR  28.42 
 
 		 916 aa  72  0.00000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3384  regulatory protein, LuxR  28.41 
 
 		 913 aa  71.6  0.00000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425044  normal  0.0489433 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2376  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  29.5 
 
 		 897 aa  71.2  0.00000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000225223  hitchhiker  0.000754758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1936  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.85 
 
 		 880 aa  71.2  0.00000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.443116  hitchhiker  0.000000309593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1506  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.3 
 
 		 876 aa  70.5  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  33.47 
 
 		 965 aa  70.1  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 1116 aa  68.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0423  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  33.92 
 
 		 1003 aa  68.6  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5188  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  28.22 
 
 		 884 aa  68.2  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5027  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.65 
 
 		 921 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.381332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5833  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.65 
 
 		 921 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4346  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.65 
 
 		 921 aa  67.8  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.815962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  33.33 
 
 		 969 aa  67.4  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  36.69 
 
 		 919 aa  67.4  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2916  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  28.82 
 
 		 905 aa  67  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20540  regulatory protein LuxR  22.44 
 
 		 887 aa  67  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  30.67 
 
 		 1029 aa  66.2  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0498  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  35.26 
 
 		 1150 aa  65.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.813194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  38.02 
 
 		 1339 aa  66.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5822  LuxR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 914 aa  65.5  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1728  ATP-dependent transcription regulator LuxR  25.09 
 
 		 870 aa  65.5  0.000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  34.27 
 
 		 379 aa  65.1  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5257  transcriptional regulator, SARP family  38.54 
 
 		 655 aa  65.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0459808  normal  0.112263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0160  transcriptional regulator MalT  26 
 
 		 903 aa  64.7  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.814727  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3994  transcriptional regulator MalT  26 
 
 		 903 aa  64.7  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3046  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.18 
 
 		 922 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3658  regulatory protein, LuxR  27.91 
 
 		 914 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0993  regulatory protein, LuxR  31.55 
 
 		 920 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.962183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  29.2 
 
 		 1126 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  30.61 
 
 		 877 aa  63.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3606  LuxR transcriptional regulator  31.03 
 
 		 947 aa  62.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.156001  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4759  regulatory protein, LuxR  29.08 
 
 		 913 aa  62.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  29.84 
 
 		 1118 aa  62.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  29.84 
 
 		 1118 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2962  transcriptional activator domain protein  30.13 
 
 		 1013 aa  63.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000192637 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5237  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.62 
 
 		 846 aa  62.4  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2538  regulatory protein, LuxR  26.74 
 
 		 907 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.896851  normal  0.0163895 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6753  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.51 
 
 		 932 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.449288 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2575  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT-like, LuxR family  27.3 
 
 		 917 aa  61.2  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1524  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  30.58 
 
 		 907 aa  60.8  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.179507  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1151  transcriptional regulator, LuxR family  27.66 
 
 		 910 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3844  regulatory protein, LuxR  28.33 
 
 		 944 aa  60.8  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  34.15 
 
 		 1121 aa  60.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  30.29 
 
 		 1733 aa  60.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4208  ATP-dependent transcription regulator LuxR  26.22 
 
 		 894 aa  59.7  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  40.83 
 
 		 1119 aa  59.7  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1607  hypothetical protein  27.1 
 
 		 428 aa  60.1  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1835  SARP family transcriptional regulator  21.62 
 
 		 343 aa  60.5  0.0000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.338537  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2742  ATP-dependent transcription regulator LuxR  28.61 
 
 		 930 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.649414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2003  transcriptional regulator, SARP family  27.39 
 
 		 867 aa  59.3  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.228987  hitchhiker  0.0000000440234 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1936  SARP family transcriptional regulator  24.04 
 
 		 210 aa  59.3  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3481  SARP family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 277 aa  59.3  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.518975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  30.22 
 
 		 1145 aa  58.5  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2534  ATP-dependent transcription regulator LuxR  29.37 
 
 		 925 aa  58.2  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41261  normal  0.169149 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0808  ATP-dependent transcription regulator LuxR  27.27 
 
 		 905 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0605  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  27.13 
 
 		 758 aa  58.2  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.841569 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  25.1 
 
 		 365 aa  58.2  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2963  regulatory protein, LuxR  31.49 
 
 		 824 aa  58.2  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1771  hypothetical protein  24.48 
 
 		 215 aa  57  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5436  LuxR family LuxR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 904 aa  57.4  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3158  response regulator receiver protein  32.04 
 
 		 446 aa  57.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0794  regulatory protein, LuxR  28.89 
 
 		 905 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  28.9 
 
 		 494 aa  57.4  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  32.14 
 
 		 1090 aa  57  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  30.25 
 
 		 1067 aa  56.6  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>